| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,755,706 | A→G | 6.2% | I678V (ATT→GTT) | czcA‑II → | cation efflux system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,755,706 | 0 | A | G | 6.2% | 185.6 / 2.2 | 64 | I678V (ATT→GTT) | czcA‑II | cation efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/29); new base G (2/2); total (33/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.03e-01 | |||||||||||
CTACGTGATGCTGCGCCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTGGAGCAGACGACGGGCCTGCCG > NC_002947/2755558‑2755852 | cTACGTGATGCTGCGCCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGa > 3:50280/1‑149 (MQ=255) tACGTGATGCTGCGCCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGAt > 5:242141/1‑149 (MQ=255) cGTGATGCTGCGCCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGAttt > 3:234211/1‑149 (MQ=255) tGATGCTGCGCCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTCTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCg > 5:265566/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCGCCGGCGCTAACAATGGGTGGACCCGGGAAAACGGCTAGATGAACTTATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTGTATAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCg < 1:130929/148‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCggg < 4:21268/149‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCgg < 2:116690/148‑1 (MQ=255) ctgcGCCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCACCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGt > 7:341468/1‑149 (MQ=255) tgcGCCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTg > 1:400953/1‑149 (MQ=255) cgcCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGAAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTgc < 4:234211/148‑1 (MQ=255) gcgagAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTg < 4:273947/149‑1 (MQ=255) aaCAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGAtgtg > 3:321245/1‑149 (MQ=255) cAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGc > 2:17035/1‑149 (MQ=255) cAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGc < 6:242141/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGt > 5:75990/1‑149 (MQ=255) ggTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGa < 2:401121/149‑1 (MQ=255) ggTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGa < 2:407382/149‑1 (MQ=255) aCCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTACAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTg > 4:76465/1‑149 (MQ=255) gggCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCg > 8:37052/1‑149 (MQ=255) gCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGt < 2:400953/149‑1 (MQ=255) cgcgAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTgacga > 6:118935/1‑148 (MQ=255) cgAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACAt > 2:295102/1‑149 (MQ=255) agaTGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATgg < 5:118935/149‑1 (MQ=255) aCTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGc < 1:171038/149‑1 (MQ=255) cccAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGaa < 4:285727/115‑1 (MQ=255) cccAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGaa > 3:285727/1‑115 (MQ=255) aCGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCcgcg > 4:398645/1‑148 (MQ=255) cgcgCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCa < 8:13402/149‑1 (MQ=255) cgccgcTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGa < 5:339862/149‑1 (MQ=255) gcTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTACAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGc < 3:76465/149‑1 (MQ=255) cTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCt < 6:75990/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTgac < 7:14342/100‑1 (MQ=255) gCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTgac > 8:14342/1‑100 (MQ=255) cGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGc > 6:237674/1‑147 (MQ=255) cGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGc > 3:430385/1‑147 (MQ=255) gcagcaACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGc < 3:298460/140‑1 (MQ=255) gcagcaACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGc > 4:298460/1‑140 (MQ=255) gcagcaACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAggg < 7:37052/149‑1 (MQ=255) caACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCa > 8:167345/1‑141 (MQ=255) caACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCa < 7:167345/141‑1 (MQ=255) aaCTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGcc > 1:375321/1‑149 (MQ=255) cTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCgg > 6:429632/1‑149 (MQ=255) tGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGgc < 5:346716/148‑1 (MQ=255) tGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGgc < 1:295102/148‑1 (MQ=255) aGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGgcgc < 1:17035/148‑1 (MQ=255) aGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGgcgc < 2:375321/148‑1 (MQ=255) gCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGt < 4:321245/149‑1 (MQ=255) cTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGGTTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGt < 8:24912/137‑1 (MQ=255) cTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGGTTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGt > 7:18440/1‑137 (MQ=255) cTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGGTTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGt > 7:24912/1‑137 (MQ=255) cTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTc > 3:105337/1‑149 (MQ=255) cTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTGCAACGAGCGGGTTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGt < 8:18440/137‑1 (MQ=255) cGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAg < 4:50280/149‑1 (MQ=255) aGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGt > 5:157720/1‑148 (MQ=255) ccGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGAAATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTg > 7:353615/1‑147 (MQ=255) cgcttCAGCTGCGGGTCACCGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGATGCTGTTCGGTGACGACATGGTGGTGCTCCACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAg < 8:341468/146‑1 (MQ=255) tCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTg > 1:285626/1‑148 (MQ=255) cAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGGGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTgg < 7:157610/148‑1 (MQ=255) aGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTGGAg > 7:183372/1‑149 (MQ=255) tGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTGGAg > 3:125589/1‑146 (MQ=255) aaCGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTGGAGCAGACGACggg > 3:359334/1‑149 (MQ=255) gcgCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTGGAGCAGACGACGGGCCt > 7:162845/3‑149 (MQ=255) aGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTGGAGCAGACGACGGGCCTg < 6:157720/149‑1 (MQ=255) tGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTGGAGCAGACGACGGGCCTGCCg > 6:88964/1‑149 (MQ=255) tGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTGGAGCAGACGACGGGCCTGCCg > 6:14509/1‑149 (MQ=255) | CTACGTGATGCTGCGCCCGCGCGAACAATGGGTTGACCCGGGCAAACCGCGAGATGAACTGATCGCCCAGGTGCAACGCGCCGCTG‑CCAGTGTGCCGGGCAGCAACTATGAGCTGTCGCAGCCGATTCAGCTGCGGTTCAACGAGCTGATTTCGGGGGTGCGCAGTGATGTGGCGGTGAAGCTGTTCGGTGACGACATGGAGGTGCTCAACCGCACTGCCGCGCAGATCGCTGCCAGCCTGCAAGGGGTGCCGGGCGCGTCCGAGGTGAAGGTGGAGCAGACGACGGGCCTGCCG > NC_002947/2755558‑2755852 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |