| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,770,228 | G→A | 5.9% | intergenic (‑94/+15) | PP_2422 ← / ← lpxOA | hypothetical protein/Fe(2+)/alpha‑ketoglutarate‑dependent dioxygenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,770,228 | 0 | G | A | 5.9% | 199.6 / 2.2 | 67 | intergenic (‑94/+15) | PP_2422/lpxOA | hypothetical protein/Fe(2+)/alpha‑ketoglutarate‑dependent dioxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/31); new base A (2/2); total (34/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCATTAACTGCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTAGATGCGGGTGAACAGGCGGTTG > NC_002947/2770083‑2770375 | ccATTAACTGCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCt < 4:146697/149‑1 (MQ=255) ttAACTGCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCg < 6:59793/149‑1 (MQ=255) aCTGCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTg < 3:412592/149‑1 (MQ=255) cTGCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTGATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGGTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGCTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGACCTGCGtt > 4:269197/1‑147 (MQ=255) gCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGc > 3:374432/1‑149 (MQ=255) gCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGc > 3:368333/1‑149 (MQ=255) cTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGcc > 3:82985/1‑149 (MQ=255) cGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTc < 1:324505/148‑1 (MQ=255) gCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATg > 6:441658/1‑147 (MQ=255) ccAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGAGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGACTTCAGATGTAGATg > 8:366514/1‑148 (MQ=255) cAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGaa < 3:272236/149‑1 (MQ=255) tCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAacac > 2:338652/1‑149 (MQ=255) catcatGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCa < 7:275833/149‑1 (MQ=255) catcatGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCa < 2:410330/149‑1 (MQ=255) atcatGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGATTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAg > 4:157482/1‑149 (MQ=255) catGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAg < 3:118904/123‑1 (MQ=255) catGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAg > 4:118904/1‑123 (MQ=255) gCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCAcc > 7:333033/1‑148 (MQ=255) gCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCAcc > 5:425160/1‑148 (MQ=255) cTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCaa < 1:338652/149‑1 (MQ=255) tCGTCTTCACGTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTTCTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTAGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTa < 1:173515/127‑1 (MQ=255) gTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGTTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAAcgccg < 4:145828/148‑1 (MQ=255) ttCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGAc > 3:424411/1‑149 (MQ=255) tCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGAc > 3:190069/1‑148 (MQ=255) cACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGAcc < 4:374432/148‑1 (MQ=255) cACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGAcc < 4:368333/148‑1 (MQ=255) gCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTc > 3:418561/1‑149 (MQ=255) gTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAgg < 4:190069/149‑1 (MQ=255) aGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGgtag > 8:73938/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAgc > 7:267335/1‑148 (MQ=255) tCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAgcg > 2:158825/1‑148 (MQ=255) aGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCAt > 7:72927/1‑149 (MQ=255) cTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCg > 4:379811/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCgg < 7:259516/147‑1 (MQ=255) gTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTAGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCAATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGCtt > 7:148676/1‑149 (MQ=255) gAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGa > 1:172291/1‑109 (MQ=255) gAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGa < 2:172291/109‑1 (MQ=255) gAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTgc < 8:267335/148‑1 (MQ=255) gCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGACCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGctt < 3:269197/149‑1 (MQ=255) cGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGcttc < 7:366514/149‑1 (MQ=255) cGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGcttc > 2:247032/1‑149 (MQ=255) cGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGcttc > 6:24115/1‑149 (MQ=255) gTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGcttct > 8:126745/1‑149 (MQ=255) gCACGTGCGAGGCGGTACTTTCGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTTCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCAACCGCATGCGctactac < 4:47795/148‑3 (MQ=255) aCGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGGACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCA‑TTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAgcg > 1:84215/1‑149 (MQ=255) cGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCtt < 3:157482/149‑1 (MQ=255) cGGTACTTTGGTGGGTAAACGCATGGCACTCGTACG‑TTTGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACAACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCTGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCAc < 2:25436/149‑1 (MQ=255) gTACTTTGGTGGGTAAACTCAGTTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGgtagt < 5:358466/111‑1 (MQ=255) gTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATTAACAACAGCACAAACTACGCGACCAATGCCCATTTTTCAAGgtagt > 6:358466/1‑111 (MQ=255) cTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGc < 7:21290/91‑1 (MQ=255) cTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGc > 8:21290/1‑91 (MQ=255) tttGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTcgc > 2:212714/1‑149 (MQ=255) tggGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GGGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATc < 8:92056/149‑1 (MQ=255) gTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTg < 3:379811/149‑1 (MQ=255) tAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTg > 3:356174/1‑148 (MQ=255) tAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGt < 4:356174/149‑1 (MQ=255) aaCGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTa < 6:425160/148‑1 (MQ=255) cGCAGGCCAC‑CGTACGAGTGACCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTAGAt > 8:311969/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTAGATg < 1:158825/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGAGCTTGTAGATg > 8:277213/1‑149 (MQ=255) cAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTAGATGc < 7:73938/149‑1 (MQ=255) gTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTcgc > 8:123220/1‑131 (MQ=255) gTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTAGATGCGGGTGAACAg > 8:244833/1‑149 (MQ=255) cgagTGACCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTAGATGCGGGTGAACAGGc < 7:311969/146‑1 (MQ=255) g‑gTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTAGATGCGGGTGAACAGGCgg < 1:212714/149‑1 (MQ=255) tGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGcttctt > 4:293714/1‑98 (MQ=255) tGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGcttctt < 3:293714/98‑1 (MQ=255) gCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTAGATGCGGGTGAACAGGCGGTTg < 4:82985/148‑1 (MQ=255) | CCATTAACTGCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTAGATGCGGGTGAACAGGCGGTTG > NC_002947/2770083‑2770375 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |