| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,982,692 | C→G | 7.2% | G163R (GGT→CGT) | PP_2608 ← | shikimate dehydrogenase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,982,692 | 0 | C | G | 7.2% | 203.7 / 4.5 | 66 | G163R (GGT→CGT) | PP_2608 | shikimate dehydrogenase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/28); new base G (2/3); total (35/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.80e-01 | |||||||||||
AGCAGGGCGGCGGACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCAGCGCC > NC_002947/2982544‑2982839 | agcagGGCGGCGGACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCAcc < 4:20883/149‑1 (MQ=255) agGGCGGCGGACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCAt < 6:242677/149‑1 (MQ=255) ggcggcGGACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCAtgc < 4:354291/149‑1 (MQ=255) ccgcaCAACGGCAGCTCTGCCCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAACTCATCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCAtgcgtgc > 8:291824/5‑149 (MQ=255) cggACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCAtgcgtgcg > 4:299035/1‑149 (MQ=255) gACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGt > 6:57808/1‑149 (MQ=255) cAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACGCATGGGTGCGGtat < 5:179277/149‑3 (MQ=255) aaCGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACGCATGGGTGCGGtatg < 2:283809/149‑4 (MQ=255) aCGGCAGGTCTGCGCTGGTGCCCTTGCCGAGTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAAGTGTGTGCTGACCGTATGCCCGGGGAAGCGGTTGCCGTGCAGTTCGCATACCGCACGCATGCGTGCGGTGCTg < 1:200206/149‑1 (MQ=255) aCGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTg < 4:120711/149‑1 (MQ=255) cGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGACGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTgg > 7:169896/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTgg > 5:81990/1‑149 (MQ=255) gCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTgggg < 8:240904/149‑1 (MQ=255) cAGCTCTGTGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGt > 2:356016/1‑149 (MQ=255) gCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCg > 6:224510/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTa < 5:224510/149‑1 (MQ=255) gTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTAt > 4:54109/1‑149 (MQ=255) gCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGc > 5:71039/1‑149 (MQ=255) ccATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGTCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTg < 4:194471/149‑1 (MQ=255) ccATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTg > 4:287944/1‑149 (MQ=255) cATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTgg < 2:215480/149‑1 (MQ=255) aTGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGc < 3:299035/149‑1 (MQ=255) aTGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGc < 6:81990/149‑1 (MQ=255) aCTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTGCAGCCCACTGAACTGTGTGTTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATccc > 2:402063/1‑149 (MQ=255) gggACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGc < 3:287944/148‑1 (MQ=255) ggACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTggg > 1:248772/1‑117 (MQ=255) ggACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTggg < 2:248772/117‑1 (MQ=255) aCGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGTTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCa < 1:402063/149‑1 (MQ=255) ccaccaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCa > 5:185248/1‑149 (MQ=255) caccaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAggg < 7:181397/116‑1 (MQ=255) caccaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAggg > 8:181397/1‑116 (MQ=255) aaccaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTCACCCTAAGCCCGGGCAAGCCGTTGCCGAGAAGTTCGCATACCACACCCAAGCGAGCGGTGCTGGGGTCGCAGATGGTTATGATGGCGATCACTACCTCAGACAGTgaa > 2:392466/2‑146 (MQ=255) aaGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGc > 7:284314/1‑116 (MQ=255) ttCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGc > 4:113757/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGc < 5:390509/147‑1 (MQ=255) aGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAac < 5:57808/149‑1 (MQ=255) cACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACAccg > 6:403873/1‑149 (MQ=255) cTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACAccgcc < 8:169896/149‑1 (MQ=255) aaCTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCa < 1:356016/149‑1 (MQ=255) tgtgCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCg > 8:360028/1‑148 (MQ=255) tgtgCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGa > 2:103036/1‑149 (MQ=255) cTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCAc > 5:256718/1‑149 (MQ=255) aCCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTc > 7:179706/1‑68 (MQ=255) aCCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTc < 8:179706/68‑1 (MQ=255) aCCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCa < 6:185248/148‑1 (MQ=255) aCCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAg > 1:278836/1‑149 (MQ=255) tAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGGCGCAACCGATCACGAGTGcc < 2:278836/149‑1 (MQ=255) tAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGcc > 2:178208/1‑149 (MQ=255) gCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGt > 4:98581/1‑149 (MQ=255) ccGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGttt < 5:110079/149‑1 (MQ=255) ggggAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGc > 4:199688/1‑149 (MQ=255) aGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCccgcc < 3:54109/149‑1 (MQ=255) tccGTTTGCGATCATTTCGCATACCGCACCCATTCGTGGGGTGCTGGGGTCGCAGACGGTTATTGTTGCGATCCCTTCCTCACCCAGTGCATAGGCAACTGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCccgc < 1:103036/147‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGAACACCAGTGCACGATTGTccgccg > 6:297437/1‑149 (MQ=255) ccGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCgg < 3:98581/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCgg > 5:96398/1‑149 (MQ=255) ccGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGTCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGGAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGaa < 7:291824/149‑1 (MQ=255) ccGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGaa < 7:360028/149‑1 (MQ=255) cGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGcc > 5:207586/1‑128 (MQ=255) cGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGcc < 6:207586/128‑1 (MQ=255) gCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCa > 7:353625/1‑149 (MQ=255) ttCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGAGCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCt > 7:18663/1‑149 (MQ=255) cagcaCCGCACGCATGGGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTtgt > 3:191786/5‑149 (MQ=255) aTACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCccgccg < 3:161856/129‑1 (MQ=255) aTACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCccgccg > 4:161856/1‑129 (MQ=255) ccGCACGCATGGGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCCGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTgcg > 2:324129/1‑147 (MQ=255) cGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCAg > 6:251415/1‑149 (MQ=255) ccATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCAGCGcc > 1:436872/1‑148 (MQ=255) | AGCAGGGCGGCGGACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAA‑TGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCAGCGCC > NC_002947/2982544‑2982839 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |