| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,010,482 | G→A | 5.8% | intergenic (‑1388/‑280) | PP_2628 ← / → PP_2631 | ABC transporter ATP‑binding protein/cellulose biosynthesis protein BcsF/YhjT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,010,482 | 0 | G | A | 5.8% | 207.6 / 2.0 | 69 | intergenic (‑1388/‑280) | PP_2628/PP_2631 | ABC transporter ATP‑binding protein/cellulose biosynthesis protein BcsF/YhjT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/39); new base A (2/2); total (28/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.82e-01 | |||||||||||
AGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGTTCATCAGCCAGGAGGTACTTGCCGGCGTCGA > NC_002947/3010336‑3010626 | aGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGc > 8:259758/1‑148 (MQ=255) gcgcCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCCGCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGa > 1:278282/1‑149 (MQ=255) ccACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGATCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACAt < 2:31821/149‑1 (MQ=255) ccACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACAt > 7:399642/1‑149 (MQ=255) cACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACAtt < 5:188716/149‑1 (MQ=255) agggCGTTAGCCGTTGCCGTGGAAAGCATGTGGCACGGGGGGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTTCTGGTGTTGCTTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTTCAGGCTGGCTCGCGTACGTTATTCCGCAGTGATGGCGACAtttc < 8:265493/148‑3 (MQ=255) gTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCg < 6:395678/149‑1 (MQ=255) tCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTg > 6:222834/1‑149 (MQ=255) cGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTg > 4:412565/1‑149 (MQ=255) ccGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGaa < 6:84703/149‑1 (MQ=255) ccGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGaa < 3:412565/149‑1 (MQ=255) ccGGGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCGGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGa < 4:23148/148‑1 (MQ=255) cGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTTGTTGGCGAAg > 3:337703/1‑149 (MQ=255) cGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAg > 2:381331/1‑149 (MQ=255) gTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGt < 7:42955/149‑1 (MQ=255) gTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGt < 3:48787/149‑1 (MQ=255) tGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTg < 5:13504/149‑1 (MQ=255) aaGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGctgt > 8:393761/1‑149 (MQ=255) aaGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGctgt > 8:92345/1‑149 (MQ=255) aGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGctgtt > 5:114905/1‑149 (MQ=255) gCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGGCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGGCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCGTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGctgttc < 5:357653/149‑1 (MQ=255) tgtgGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGctgttcctg < 6:332981/149‑1 (MQ=255) tgtgGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGctgttcctg < 5:222834/149‑1 (MQ=255) tgGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGctgttcctgt < 5:279879/148‑1 (MQ=255) gCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGctgttcctgttcc > 2:351001/1‑149 (MQ=255) gCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGctgttcctgttc < 1:38842/148‑1 (MQ=255) cACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGctgttcctgttcct < 8:399642/149‑1 (MQ=255) cGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTcc > 7:233534/1‑148 (MQ=255) aaaTCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGaa < 1:351001/149‑1 (MQ=255) aTCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAgg < 4:149886/149‑1 (MQ=255) gTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAgggg < 2:81581/148‑1 (MQ=255) gTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGt < 4:274381/149‑1 (MQ=255) tCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTc < 7:40929/149‑1 (MQ=255) ccaGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGc < 3:155218/149‑1 (MQ=255) caGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAATTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGc > 7:179831/1‑148 (MQ=255) gTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCGTGGCCTTACCCGGCTGCAGGATTGGTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACTTTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTTCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAg < 1:313887/149‑1 (MQ=255) cTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAgcgc < 8:52981/148‑1 (MQ=255) gtgtTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGa > 7:339868/1‑149 (MQ=255) tgtTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGAc < 7:92345/149‑1 (MQ=255) tgtTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCAAGCAAGCGCTTGAc < 7:393761/149‑1 (MQ=255) gtTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGAc > 5:360262/1‑148 (MQ=255) ttGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGAcc < 1:381331/148‑1 (MQ=255) ttGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACca > 1:168576/1‑149 (MQ=255) cGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCtt < 6:114905/148‑1 (MQ=255) ggCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTc > 5:101221/1‑148 (MQ=255) ctggcctgACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTg > 7:197103/1‑149 (MQ=255) tggcctgACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGt > 2:254097/1‑149 (MQ=255) tggcctgACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGACTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGt > 2:260614/1‑149 (MQ=255) cctgACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCAt < 5:211749/149‑1 (MQ=255) ctgACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGc < 4:128920/118‑1 (MQ=255) ctgACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGc > 3:128920/1‑118 (MQ=255) ccccGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTTGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGa > 7:186054/1‑147 (MQ=255) ccccGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGGTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGaaa < 2:278282/149‑1 (MQ=255) cTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCt < 7:334473/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGt < 6:360262/149‑1 (MQ=255) cAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGtt < 3:199093/149‑1 (MQ=255) cTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGTtcatc < 6:194634/149‑1 (MQ=255) gcgTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATg > 5:292055/1‑126 (MQ=255) gcgTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATg < 6:292055/126‑1 (MQ=255) cgTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGTTCATCAGCCagga < 8:179831/149‑1 (MQ=255) tATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGTTCATCAGCCAGGAGGTACtt > 5:236180/1‑149 (MQ=255) tATTCCGCCGTGATGACGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCa < 5:241704/109‑1 (MQ=255) tATTCCGCCGTGATGACGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCa < 5:235692/109‑1 (MQ=255) tATTCCGCCGTGATGACGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCa > 6:235692/1‑109 (MQ=255) tATTCCGCCGTGATGACGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCa > 6:241704/1‑109 (MQ=255) ttCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGTTCATCAGCCAGGAGGTACTTGc < 8:339868/149‑1 (MQ=255) ccgccgTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGTTCATCAGCCAGGAGGTACTTGCCg > 8:282905/1‑149 (MQ=255) cgccgTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGTTCATCAGCCAGGAGGTACTTGCCgg < 7:259758/149‑1 (MQ=255) ccgTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGTTCATCAGCCAGGAGGTACTTGCCGGCg > 8:402194/1‑149 (MQ=255) gacggCGCCACTGCCTGCCTGGCTGGCGCAGCGCGCTGCCCCTTCCAGCTCGCCTGCCGCCCCGCCGGGCTTGAGCAAGCGCTTGACCACAACTCCCAGCTGTCATGGACAGAGCTGTTCATCAGCCAGGAGGTCCTTGCCGGCGCCGa < 8:186054/146‑1 (MQ=255) | AGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCCGCTGCAGGCTTGCTCGCGTACGGTATTCCGCCGTGATGGCGACATTGCCTGCGTGGTTGGCGAAGTGCTGTTCCTGTTCCTGTTCGCCTGCCGCTCCGAAGGGGTCGAGCAAGCGCTTGACCACATCTTCCAGCTGTCATGGAAAGAGCTGTTCATCAGCCAGGAGGTACTTGCCGGCGTCGA > NC_002947/3010336‑3010626 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |