Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,024,211 | A→T | 6.2% | intergenic (+26/+128) | dapA‑II → / ← PP_2640 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase/GNAT family acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,024,211 | 0 | A | T | 6.2% | 226.2 / 2.4 | 74 | intergenic (+26/+128) | dapA‑II/PP_2640 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase/GNAT family acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/33); new base T (2/3); total (38/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
TCAAGGCGGCATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAG > NC_002947/3024067‑3024359 | tCAAGGCGGCATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAg > 2:140810/1‑149 (MQ=255) aaGGCGGCATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAgcc > 4:194802/1‑149 (MQ=255) aaGGCGGCATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAgcc > 2:419190/1‑149 (MQ=255) aaGGCGGCATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAgcc > 8:217819/1‑149 (MQ=255) ggcggcATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAgccgc < 8:107439/149‑1 (MQ=255) gcggcATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAgccgc > 5:87958/1‑148 (MQ=255) cggcATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCca < 6:407697/149‑1 (MQ=255) ggcATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCca > 4:347353/1‑148 (MQ=255) cATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCacac < 2:166957/149‑1 (MQ=255) aTTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGCTTGTCAACCCGCcatcaa < 1:392619/149‑5 (MQ=255) cAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCtt < 1:140810/148‑1 (MQ=255) aGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCttgg > 7:185218/1‑149 (MQ=255) gCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCttggt < 3:398182/149‑1 (MQ=255) tGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCttggttg > 2:243933/1‑149 (MQ=255) cAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCttggttg < 3:194802/147‑1 (MQ=255) aaaGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTggttggtt > 6:45938/1‑149 (MQ=255) aGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTTGTTGGTTCg < 4:342644/149‑1 (MQ=255) aGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCg < 7:217819/149‑1 (MQ=255) cAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTcggcg < 1:107957/148‑1 (MQ=255) aGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGa > 6:291555/1‑149 (MQ=255) aGCTGCGCGGGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCTAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCt > 5:64905/1‑149 (MQ=255) cgAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGc < 1:419190/149‑1 (MQ=255) cccATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGTCGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGa > 1:108719/1‑149 (MQ=255) cAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGc < 1:218460/149‑1 (MQ=255) gACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCa < 6:87958/149‑1 (MQ=255) gACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGCTTGTCAAcccgcc > 2:428192/1‑96 (MQ=255) gACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGCTTGTCAAcccgcc < 1:428192/96‑1 (MQ=255) gTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGc > 5:299593/1‑148 (MQ=255) cACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAAcg > 5:358905/1‑149 (MQ=255) cACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAAc < 6:326562/148‑1 (MQ=255) aCGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAAcgc < 5:384257/149‑1 (MQ=255) gAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACgcgc > 2:268147/1‑149 (MQ=255) tACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCTAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTga < 1:74874/149‑1 (MQ=255) ccaccCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTgaga > 2:401821/1‑149 (MQ=255) ccaccCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTgaga < 3:353468/149‑1 (MQ=255) caccCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTgaga > 1:112376/1‑148 (MQ=255) accCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTgaga > 2:291072/1‑147 (MQ=255) accCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTgaga > 4:230324/1‑147 (MQ=255) accCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACa < 5:291555/149‑1 (MQ=255) agaCAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTa > 4:333159/1‑149 (MQ=255) aCAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTAtt < 1:282394/149‑1 (MQ=255) aaaCTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGAttt < 8:81540/118‑1 (MQ=255) aaaCTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGAttt > 7:81540/1‑118 (MQ=255) aaaCTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGAt < 5:374274/116‑1 (MQ=255) aaaCTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGAt > 6:374274/1‑116 (MQ=255) aaaCTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTCACAAGCCGCCACACCCTTGGATGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACTCGCTGAGACAGAGTATTGc > 3:235110/1‑149 (MQ=255) aaaCTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGCTTGAAGGCGGGATGACAAGACGCAACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTg > 1:215801/1‑148 (MQ=255) aaCTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGc > 7:210904/1‑148 (MQ=255) gCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAggg > 4:52130/1‑149 (MQ=255) gCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAggg > 3:280608/1‑149 (MQ=255) cAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGc > 6:14707/1‑149 (MQ=255) aaGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCg < 3:333159/149‑1 (MQ=255) aGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGc < 1:401821/149‑1 (MQ=255) cGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCtt > 6:405499/1‑149 (MQ=255) gTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCttt < 1:291072/149‑1 (MQ=255) gCTGT‑GTTCACTCTGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGc < 6:242296/149‑1 (MQ=255) cTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCg > 8:21536/1‑149 (MQ=255) t‑gtTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGACAGGGCCGCAAAGCGGcc < 8:185218/149‑1 (MQ=255) t‑gtTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGACGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCgg < 1:243933/147‑1 (MQ=255) gaCTGGGCGCCTGAAGGTGCATGGGTTGATGGCGGGTTGACATGCGGCCTGATCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGTTGCGTCGGGTGCGGTTTTGTGGGTGCTTCGCGCTGAGTCAGAGTTTTGGCAGGGCCGCATAGCGGCCCTg < 4:235110/147‑1 (MQ=255) cACTCGGCTCCTGAAGCGGAAACGGTTGATGGCGGGTTGTCAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCGCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCAAAGCGGCCCTg < 8:365847/148‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGAttt < 6:145582/93‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGAttt > 5:145582/1‑93 (MQ=255) aaGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGt < 6:358905/149‑1 (MQ=255) gCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTc > 1:430752/1‑149 (MQ=255) gCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTc > 3:390045/1‑149 (MQ=255) cAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTcc > 2:244494/1‑149 (MQ=255) aaCGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTcc > 7:144702/1‑148 (MQ=255) tgtGGCGGCTTGTCAACCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACgctgg > 6:184009/3‑149 (MQ=255) gATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACgctg < 4:280608/148‑1 (MQ=255) aTGGAGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGATGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTTCGGCACTGTCGAGACACCAGGTTGCTCCTACgctggc > 2:360700/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACgctggct < 1:244494/149‑1 (MQ=255) ttGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCgg < 8:210904/149‑1 (MQ=255) gACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTCCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGc < 3:230324/148‑1 (MQ=255) aCAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAg < 5:45938/149‑1 (MQ=255) | TCAAGGCGGCATTGCAGCTGCAAAGCCTGATTGCAGACGAGCTGCGCGAGCCCATGCAGACGTGCACGAATACCACCCGAGACAAACTGCAAAGCGTGCTGT‑GTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAG > NC_002947/3024067‑3024359 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |