| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,183,689 | G→A | 7.3% | V59V (GTG→GTA) | PP_2794 → | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,183,689 | 0 | G | A | 7.3% | 196.4 / 3.5 | 68 | V59V (GTG→GTA) | PP_2794 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/32); new base A (2/3); total (33/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.06e-01 | |||||||||||
CCTCGACGGGCGTCGCGCCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACAGCCAGCCTTTGCTAGCCTGCGATGATCA > NC_002947/3183542‑3183835 | ccTCGACGGGCGTCGCGCCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTgg > 5:38185/1‑149 (MQ=255)ccTCGACGGGCGTCGCGCCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTgg > 8:99128/1‑149 (MQ=255) cGGGCGTCGCGCCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAg < 6:438592/149‑1 (MQ=255) tCGCGCCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAgggcggg > 4:27801/1‑149 (MQ=255) tCGCGCCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAgggcggg > 2:412640/1‑149 (MQ=255) cgcCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGggcgggcg > 2:299322/1‑148 (MQ=255) cgcCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGgcgc > 4:48050/1‑149 (MQ=255) cgcCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTAGCCGGAGGGCGGgcgc < 7:402040/149‑1 (MQ=255) gcCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCg > 5:443854/1‑136 (MQ=255) gcCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCg < 6:443854/136‑1 (MQ=255) cccTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAg > 6:217564/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAgg > 6:285802/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAgg > 3:236377/1‑149 (MQ=255) tGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGcc > 1:247249/1‑149 (MQ=255) tGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTAGCCGGAGGGCGGGCGCAGGcc > 1:263961/1‑149 (MQ=255) tGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTAGCCGGAGGGCGGGCGCAGGcc > 1:270225/1‑149 (MQ=255) gTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCtt < 4:236377/149‑1 (MQ=255) gACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTg > 7:27905/1‑149 (MQ=255) aCCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGc > 7:148746/1‑149 (MQ=255) cTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGAtg < 4:29249/149‑1 (MQ=255) cTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGATGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGAtg > 1:184729/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCttt < 2:77331/136‑1 (MQ=255) cAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCttt > 1:77331/1‑136 (MQ=255) gCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGa < 1:398426/144‑1 (MQ=255) gCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGa > 2:398426/1‑144 (MQ=255) ggCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGt > 5:428423/1‑147 (MQ=255) cGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGTGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGa > 8:313294/1‑149 (MQ=255) cACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACAt < 3:27801/149‑1 (MQ=255) ttCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTg > 6:442566/1‑149 (MQ=255) ccATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGTGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCgg < 7:313294/149‑1 (MQ=255) ccATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCgg < 3:48050/149‑1 (MQ=255) cATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCggg < 3:95373/149‑1 (MQ=255) aTGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAg < 1:1892/135‑1 (MQ=255) aTGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAg > 2:1892/1‑135 (MQ=255) cccTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTc < 5:205914/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGa < 5:285802/149‑1 (MQ=255) cgccgcAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGa < 5:119001/123‑1 (MQ=255) cgccgcAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGa > 6:119001/1‑123 (MQ=255) cgcAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGGGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGccgccg < 8:148746/149‑1 (MQ=255) gcAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGAAGGAGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCTGAGGGCGGGCGCAGTCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCgg > 1:432844/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGc < 6:38185/149‑1 (MQ=255) gcCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCt < 2:247249/149‑1 (MQ=255) ccGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTg < 8:273528/149‑1 (MQ=255) cGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTgg < 7:102281/149‑1 (MQ=255) cGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCATTCGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCATCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTg > 2:366592/1‑148 (MQ=255) aGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGAt < 5:217564/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGAt < 2:184729/149‑1 (MQ=255) tggtggtgACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATgc < 3:63086/130‑1 (MQ=255) tggtggtgACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATgc > 4:63086/1‑130 (MQ=255) ggtgACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTgg < 1:299322/149‑1 (MQ=255) cGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCt > 4:85448/1‑78 (MQ=255) cGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCt < 3:85448/78‑1 (MQ=255) cGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTcaac > 2:267282/1‑148 (MQ=255) aCGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCgg < 6:386501/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCgggg < 1:267282/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCgggg < 8:27905/149‑1 (MQ=255) ccagggCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCgggg < 7:260257/145‑1 (MQ=255) cAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGt > 3:370160/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAg > 3:144536/1‑149 (MQ=255) aGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTTCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGAcagccag < 6:428423/149‑1 (MQ=255) gCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACagccagcc > 2:105165/1‑149 (MQ=255) ttGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACAGCCAGCCttt > 7:130104/1‑149 (MQ=255) ggtggAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACAGCCAGCCTTTGc > 8:159207/1‑149 (MQ=255) gtggAGGCCATCGAGGTAGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCTGGGGTGAGCGACAGCCAGCCTTTGc < 2:270225/148‑1 (MQ=255) gtggAGGCCATCGAGGTAGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACAGCCAGCCTTTGc < 2:263961/148‑1 (MQ=255) cATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACAGCCAGCCTTTGCTAGCCTGCg < 7:99128/149‑1 (MQ=255) tCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACAGCCAGCCTTTGCTAGCCTGCgat > 8:171936/1‑149 (MQ=255) gAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACAGCCAGCCTTTGCTAGCCTGCgatg < 4:144536/148‑1 (MQ=255) aGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACAGCCAGCCTTTGCTAGCCTGCgatgat > 5:182830/1‑149 (MQ=255) gTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACAGCCAGCCTTTGCTAGCCTGCGATGATCa < 8:19860/149‑1 (MQ=255) | CCTCGACGGGCGTCGCGCCCTGGTGACCGGGGCCTCCAGCGGCCTGGGCCGTCACTTCGCCATGACCCTGGCCGCCGCAGGCGCCGAGGTGGTGGTGACCGCCAGACGCCAGGCGCCGCTGCAGGCGTTGGTGGAGGCCATCGAGGTGGCCGGAGGGCGGGCGCAGGCCTTTGCCCTCGATGTGACGAGCCGTGAGGACATCTGCCGGGTGCTCGATGCCGCCGGCCCGCTGGATGTTCTGGTCAACAATGCGGGGGTGAGCGACAGCCAGCCTTTGCTAGCCTGCGATGATCA > NC_002947/3183542‑3183835 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |