| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 297,352 | C→A | 5.1% | E218* (GAA→TAA) | gshA ← | glutamate‑‑cysteine ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 297,352 | 0 | C | A | 5.1% | 254.2 / 3.2 | 78 | E218* (GAA→TAA) | gshA | glutamate‑‑cysteine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/41); new base A (2/2); total (35/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.87e-01 | |||||||||||
CCCACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCATTTTCCGTACT > NC_002947/297204‑297499 | cccACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGTGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTc > 1:393329/1‑149 (MQ=255)cccACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTc < 5:259259/149‑1 (MQ=255)cccACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTc < 6:89916/149‑1 (MQ=255) ccACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCg > 7:348147/1‑149 (MQ=255) cACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTc > 1:386454/1‑147 (MQ=255) cACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTc > 4:261922/1‑147 (MQ=255) cACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTc > 5:171403/1‑147 (MQ=255) aCGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAg > 4:190800/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGc < 7:284571/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTg < 7:50567/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTgg > 7:292964/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGt < 3:108719/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCGAAGAGCTgga < 4:160940/149‑2 (MQ=255) gcgcAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgcg > 2:67135/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgcgggc < 2:386454/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgcgggc < 2:414369/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGCTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgcgggc < 3:292354/149‑1 (MQ=255) aGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgcgggcg < 2:218032/149‑1 (MQ=255) gtgtAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAg > 8:33033/1‑149 (MQ=255) tgtAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAgg < 1:389084/149‑1 (MQ=255) cTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGcc > 5:36016/1‑149 (MQ=255) tGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCt > 7:29147/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGTTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCtt > 2:195474/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCt < 8:277060/147‑1 (MQ=255) cAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGt > 2:54120/1‑149 (MQ=255) gttgttGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTcc < 8:348147/148‑1 (MQ=255) gttgttGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCa < 2:393329/149‑1 (MQ=255) tgttgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑gg > 6:124468/1‑149 (MQ=255) gttgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑gg < 5:340346/148‑1 (MQ=255) ttgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCa < 5:107957/130‑1 (MQ=255) ttgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCa > 6:107957/1‑130 (MQ=255) ttgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGc > 3:377158/1‑149 (MQ=255) aGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGc > 1:67587/1‑149 (MQ=255) aGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGc > 5:42387/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGa < 6:171403/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGa < 5:124468/149‑1 (MQ=255) ggCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGgc < 6:352868/149‑1 (MQ=255) cGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgcgggc > 8:346788/1‑110 (MQ=255) cGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgcgggc < 7:346788/110‑1 (MQ=255) tAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCg < 7:202497/149‑1 (MQ=255) ccggccTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGTTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAg < 1:195474/149‑1 (MQ=255) ccggccTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAg < 8:292964/149‑1 (MQ=255) ggccTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGt < 6:42387/149‑1 (MQ=255) ggccTGGGCGTTGCGCTGGTACCCCAGGTCGCTCCTGCGCAGGCTGGGGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGt < 5:117131/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGa > 4:163430/1‑132 (MQ=255) cTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGa < 3:163430/132‑1 (MQ=255) gggCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACa > 4:266649/1‑141 (MQ=255) gggCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACa < 3:266649/141‑1 (MQ=255) gggCGTTGCTCTGGTAACCCAGGGCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTATTCGAGCTTGTGCGGGCGGCCACGCATGAAGCCAATGTCCA‑CGGCCCGCGAAGCGCCGAACATCTACAt > 6:71458/1‑148 (MQ=255) tgggCTCTGGTAAGCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATcagca < 8:373288/146‑1 (MQ=255) gTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATcagca < 6:36016/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCTGGTAACCAAGGTCGGTCATGCGCAGTCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCGCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTTCATcagca < 8:302336/149‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCagcagc > 7:368131/1‑149 (MQ=255) gCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCagcagc < 3:129800/148‑1 (MQ=255) ctctGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAACGCAGGAACAGGCTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTACA‑GGGCCGGCCAGGCGCCGAACAGGTACATCAGcagcca > 5:49466/1‑149 (MQ=255) tctGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGTCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATAAGcagccag > 3:6383/1‑149 (MQ=255) tctGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGcagccag > 7:261402/1‑149 (MQ=255) tGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCt > 8:60690/1‑149 (MQ=255) ggTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTg > 5:286472/1‑149 (MQ=255) gTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGc > 3:17509/1‑111 (MQ=255) gTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGc < 4:17509/111‑1 (MQ=255) cccAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAgcg > 6:271827/1‑149 (MQ=255) 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tttCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTcg > 5:137349/1‑149 (MQ=255) tCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTcgcg > 5:274590/1‑149 (MQ=255) cGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTcgcg < 7:33033/148‑1 (MQ=255) cGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTcgcg < 2:349681/148‑1 (MQ=255) ggCATCCATCTCTTCGAGCTGGTGCGTGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGTAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCgg < 5:71458/148‑1 (MQ=255) gcaccAGCTCGAAGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTg > 6:341774/4‑136 (MQ=255) gcaccAGCTCGAAGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTg < 5:341774/133‑1 (MQ=255) caccAGCTCGAAGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCa > 1:108093/3‑149 (MQ=255) tCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCAtt < 8:368131/149‑1 (MQ=255) cAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCTGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCTGCTGTAGCGGCGGTAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCAtttt < 3:275598/149‑1 (MQ=255) cAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCAtttt > 7:189233/1‑149 (MQ=255) tCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCATTTTCCGTACt > 7:279848/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCATTTTCCGTACt < 3:261922/148‑1 (MQ=255) | CCCACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCA‑GGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCATTTTCCGTACT > NC_002947/297204‑297499 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |