| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,084,381 | G→T | 6.1% | D175Y (GAC→TAC) | PP_3594 → | amino acid ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,084,381 | 0 | G | T | 6.1% | 206.8 / 2.3 | 65 | D175Y (GAC→TAC) | PP_3594 | amino acid ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/33); new base T (2/2); total (30/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.83e-01 | |||||||||||
CTTCAAGACCCTGCCCAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGGCGCGTGTT > NC_002947/4084236‑4084526 | cTTCAAGACCCTGCCCAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCTACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGaca > 2:93358/1‑149 (MQ=255)cTTCAAGACCCTGCCCAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGaca > 7:348537/1‑149 (MQ=255) ttCAAGACCCTGCCCAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCGAGGacac > 1:205812/1‑149 (MQ=255) gACCCTGCCCAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGc < 1:118495/149‑1 (MQ=255) cccTGCCCAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGTGCTTAGCAAGCGCACCTGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTg < 5:418836/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTgg > 5:297251/1‑149 (MQ=255) cccAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTc > 1:270246/1‑149 (MQ=255) ccAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTc > 3:213988/1‑148 (MQ=255) ccAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCg > 6:439346/1‑149 (MQ=255) ccAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCg > 2:145195/1‑149 (MQ=255) aaGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGAc < 6:130098/149‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCAtc < 1:145195/149‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCAtc < 8:355889/149‑1 (MQ=255) gCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGc > 8:6582/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCGAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCt < 2:205812/149‑1 (MQ=255) tGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGCCCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTg > 8:340457/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGAc > 5:193067/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCAGCGAGATGGTCGAc < 8:348537/149‑1 (MQ=255) ggCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGGTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGAt < 7:406525/147‑1 (MQ=255) ttGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATgcgc > 1:271466/1‑146 (MQ=255) gggCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAg < 6:193067/147‑1 (MQ=255) gggCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGa < 2:270246/148‑1 (MQ=255) gCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGAcc > 3:367916/1‑148 (MQ=255) aaGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGc > 7:17259/1‑149 (MQ=255) aGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCg < 7:6582/149‑1 (MQ=255) gcACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGAc < 7:62895/136‑1 (MQ=255) gcACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGAc > 8:62895/1‑136 (MQ=255) cACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCa < 4:171262/149‑1 (MQ=255) cGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGTACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCg > 7:336500/1‑149 (MQ=255) cGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGTACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCg > 7:330601/1‑149 (MQ=255) gTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGt > 6:384436/1‑148 (MQ=255) tttCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTTGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTaa < 7:230707/149‑1 (MQ=255) ttcAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAAcc > 3:275924/1‑147 (MQ=255) ttcAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAAcc > 1:310483/1‑147 (MQ=255) aaGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAgg < 8:320928/148‑1 (MQ=255) aaGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAgg > 7:299762/1‑148 (MQ=255) ggTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAAc < 6:297251/149‑1 (MQ=255) gctgcCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGt > 2:278620/1‑149 (MQ=255) gctgcCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGt > 4:356358/1‑149 (MQ=255) ctgcCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGt < 1:278620/148‑1 (MQ=255) ccACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGTCGGTCAGCGTAAGCAAGGAACCGATGttctt < 6:177246/149‑1 (MQ=255) ccACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGttct < 4:213988/148‑1 (MQ=255) cacaACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACATCTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGGTGGTCGACCTGATGCGCCATACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGttcttc < 1:93358/149‑1 (MQ=255) cacaACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGttcttc < 5:384436/149‑1 (MQ=255) acaACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGttcttc > 5:14875/1‑148 (MQ=255) caACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTa < 5:179008/149‑1 (MQ=255) cGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACg < 8:189569/142‑1 (MQ=255) cGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACg > 7:189569/1‑142 (MQ=255) gCATCGCCCTGCCCGTCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTTCTCTAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCATCCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCgcc < 1:316871/149‑1 (MQ=255) aTCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCgcctg < 5:91902/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTgg < 2:271466/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTgg < 3:356358/149‑1 (MQ=255) ccGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTg < 6:335277/47‑1 (MQ=255) ccGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTg > 5:335277/1‑47 (MQ=255) ccGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTAc < 8:17259/149‑1 (MQ=255) ccGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTAc < 5:439346/149‑1 (MQ=255) cGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCCAcc > 7:57321/1‑149 (MQ=255) gTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGt > 1:181046/1‑149 (MQ=255) caacTGGCTGTCGCTGCTCAAGTACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTTGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCgg < 8:330601/149‑1 (MQ=255) caacTGGCTGTCGCTGCTCAAGTACACCTCGCTGGTGTCGACAATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCgg < 8:336500/149‑1 (MQ=255) caacTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCgg < 7:340457/149‑1 (MQ=255) tCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCAGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTcc < 1:174829/147‑1 (MQ=255) ctCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGgcgc < 2:310483/147‑1 (MQ=255) tCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACAATCTCGCTGGTCGACATGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGAGGTTCTTCTACGGCGTAGCCTGCCTGGGCTACCTGCAGTTCGCGGCACTGTCAGGGCGCgtg > 4:62126/1‑149 (MQ=255) aaGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGGCGCGTGtt > 1:248989/1‑149 (MQ=255) | CTTCAAGACCCTGCCCAAGGGCCAGCTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGGCGCGTGTT > NC_002947/4084236‑4084526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |