| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,106,357 | G→C | 6.2% | S205R (AGC→AGG) | PP_3613 ← | L‑sorbosone dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,106,357 | 0 | G | C | 6.2% | 316.9 / 8.1 | 97 | S205R (AGC→AGG) | PP_3613 | L‑sorbosone dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/49); new base C (2/4); total (44/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
CGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCTACATACAGCTTGCCGTTG > NC_002947/4106214‑4106504 | cGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTCCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGAt < 2:300922/149‑1 (MQ=255) gCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATg > 3:360259/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATg > 3:105722/1‑149 (MQ=255) ccGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTGGTCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCAGCCCGGATGGTcgc < 7:346547/149‑3 (MQ=255) ccGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAg > 3:138943/1‑149 (MQ=255) cGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAgg < 2:84707/149‑1 (MQ=255) ggCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCAACTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCt > 3:174815/1‑149 (MQ=255) gCATACGGCCTGTGAGCCCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCGGACCAAGGCCCGATCGATCTCCACCACCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGATCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGCCTGATTGTCAGGGCCtt < 2:424790/149‑1 (MQ=255) aTAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTgg > 1:200180/1‑149 (MQ=255) aTAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTgg > 4:109214/1‑149 (MQ=255) tAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGt < 8:381230/149‑1 (MQ=255) gggCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTc < 5:91726/148‑1 (MQ=255) gCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCaa < 5:439243/149‑1 (MQ=255) ccGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAAt > 2:27941/1‑149 (MQ=255) ccGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAAt < 2:208954/149‑1 (MQ=255) gtgtGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATCCCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAAtggt < 2:145347/149‑1 (MQ=255) gtgtGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAAtggt < 2:200180/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAAtggtg < 3:332801/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAAtggtg < 6:117105/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAAtggtg > 3:131404/1‑149 (MQ=255) tgtgCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAAtggtg > 7:333632/1‑149 (MQ=255) tgtgCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAAtggtg < 5:59970/149‑1 (MQ=255) cgcCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTg < 4:138943/149‑1 (MQ=255) gcCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGa < 1:270609/149‑1 (MQ=255) ccGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGAt > 1:280384/1‑149 (MQ=255) cGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGAtt > 3:310980/1‑149 (MQ=255) tctcGGCATCAACCTGCCAGAGCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCa < 7:110584/149‑1 (MQ=255) tctcGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCAACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCa < 1:3733/149‑1 (MQ=255) ctcGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATgg > 7:168775/1‑116 (MQ=255) ctcGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATgg < 8:168775/116‑1 (MQ=255) tcGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGc > 6:192180/1‑149 (MQ=255) cGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGcc > 1:261681/1‑149 (MQ=255) ggCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCg > 1:50543/1‑149 (MQ=255) cATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCgg > 3:224290/1‑148 (MQ=255) cATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGc < 1:312818/149‑1 (MQ=255) aCCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGGCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTc < 6:81666/149‑1 (MQ=255) aCCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCAACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGAGGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTc > 8:78638/1‑149 (MQ=255) ccTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCg > 3:183555/1‑149 (MQ=255) ccTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCg > 5:423612/1‑149 (MQ=255) gCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTgg < 6:327469/114‑1 (MQ=255) gCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTgg > 5:327469/1‑114 (MQ=255) ccAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGt < 5:192180/147‑1 (MQ=255) ccAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGa > 3:83783/1‑149 (MQ=255) gACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCt < 3:322903/149‑1 (MQ=255) cATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCttgg < 4:360259/149‑1 (MQ=255) tGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCttggtt > 4:34735/1‑149 (MQ=255) ggCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCttggttg > 7:314745/1‑149 (MQ=255) cccGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGc < 4:167237/149‑1 (MQ=255) cccGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGc < 5:324494/149‑1 (MQ=255) ccGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCg < 8:314745/149‑1 (MQ=255) ccGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCg < 4:131404/149‑1 (MQ=255) cgatcgatCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCgg > 1:246042/1‑149 (MQ=255) gatcgatcTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCggg < 2:176238/149‑1 (MQ=255) gatcgatcTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCggg > 6:64993/1‑149 (MQ=255) atcgatgACCACCTCCAGCCCGCCGTCCGTGATGTTGCAGTTCGAGCAGATACCCACATACTACAAGCGACCATCCGCGCAGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTCATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGc < 8:126713/149‑1 (MQ=255) atcTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTc > 2:33687/1‑149 (MQ=255) ccACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCttgg > 7:230810/1‑132 (MQ=255) ccACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCttgg < 8:230810/132‑1 (MQ=255) ccTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTgg < 4:23434/149‑1 (MQ=255) ccTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTgg < 8:333632/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTggg > 6:135626/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTc > 3:233204/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGt < 2:261681/147‑1 (MQ=255) cAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCt > 6:253530/1‑149 (MQ=255) aGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTg < 5:253530/149‑1 (MQ=255) gCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGc < 5:218651/149‑1 (MQ=255) gcTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttcc < 4:224290/149‑1 (MQ=255) gcTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttcc < 4:183555/149‑1 (MQ=255) tCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttcctt > 6:318282/1‑149 (MQ=255) cGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTg < 5:64993/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttc > 5:351289/1‑144 (MQ=255) ggTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttc > 1:42952/1‑144 (MQ=255) ggTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttc < 6:351289/144‑1 (MQ=255) ggTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttc < 2:42952/144‑1 (MQ=255) tGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAg > 5:323628/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAgc > 1:10432/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAgc > 6:118056/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAg < 1:27941/148‑1 (MQ=255) ttCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAgcgc < 2:50543/147‑1 (MQ=255) ttCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCa < 4:83783/148‑1 (MQ=255) ttCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGAACTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCAc < 5:80425/149‑1 (MQ=255) gAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAg > 5:363996/1‑149 (MQ=255) ccGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAgcgc < 2:10432/149‑1 (MQ=255) cccACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTg < 5:135626/149‑1 (MQ=255) ccACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTgg > 2:369990/1‑149 (MQ=255) ccACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTgg > 2:118244/1‑149 (MQ=255) acaTACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGtt < 2:280384/149‑1 (MQ=255) acaTACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGtt < 3:34735/149‑1 (MQ=255) aTACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTgg < 3:109214/149‑1 (MQ=255) aagaagCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCta > 4:109418/1‑148 (MQ=255) aagCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCtacata < 3:109418/149‑1 (MQ=255) aagCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCtacat > 6:311722/1‑148 (MQ=255) ctgACCATCAGCCCGGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttcctt < 3:139789/106‑1 (MQ=255) ctgACCATCAGCCCGGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttcctt < 3:146114/106‑1 (MQ=255) ctgACCATCAGCCCGGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttcctt > 4:139789/3‑108 (MQ=255) ctgACCATCAGCCCGGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttcctt > 4:146114/3‑108 (MQ=255) ccATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCTACATACAGCtt > 7:187927/1‑149 (MQ=255) ggCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCTACATACAGCTTGCCGTTg < 5:318282/149‑1 (MQ=255) ggCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCTACATACAGCTTGCCGTTg < 6:363996/149‑1 (MQ=255) | CGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCTACATACAGCTTGCCGTTG > NC_002947/4106214‑4106504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |