| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,132,430 | T→A | 6.7% | H244L (CAC→CTC) | PP_3636 ← | sulfonate ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,132,430 | 0 | T | A | 6.7% | 220.0 / 5.1 | 74 | H244L (CAC→CTC) | PP_3636 | sulfonate ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/28); new base A (2/3); total (43/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
AGGCTCGTGCGGGGTGTACTTGTTGGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCAT > NC_002947/4132282‑4132578 | aGGCTCGTGCGGGGTGTACTTGTTGGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGt < 6:118272/149‑1 (MQ=255) tGCGGGGTGTACTTGTTGGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCACGAGCATGac < 3:211934/149‑2 (MQ=255) gCGGGGTGTACTTGTTGGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAac < 6:317781/149‑1 (MQ=255) cGGGGTGTACTTGTTGGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAac < 6:440356/148‑1 (MQ=255) gtgtACTTGTTGGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTCGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAAcaccac > 3:21511/1‑149 (MQ=255) gtACTTGTTGGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACg > 1:77361/1‑148 (MQ=255) ttgttgGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACgcagca > 1:118229/1‑149 (MQ=255) ttgttgGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACgcagca > 5:407189/1‑149 (MQ=255) gttgGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACgcagca < 1:208154/147‑1 (MQ=255) gttgGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCACGAGCATGacc < 8:186274/136‑3 (MQ=255) gttgGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCACGAGCATGacc > 7:186274/1‑134 (MQ=255) ggggCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCa < 2:277313/148‑1 (MQ=255) gcccgcccTGGACAGCAGTGTGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGt > 5:41040/1‑149 (MQ=255) gcccgcccTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTGACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGt > 8:172440/1‑149 (MQ=255) gcccgcccTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGt > 1:129507/1‑149 (MQ=255) cccgcccTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACAACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGtt > 4:329734/1‑149 (MQ=255) ccTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTgcgc > 1:81499/1‑148 (MQ=255) ccTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTgcgc > 2:251310/1‑148 (MQ=255) gACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTTCGATTGTCACGGTTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATa < 2:249263/148‑1 (MQ=255) agTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGcc < 2:118229/149‑1 (MQ=255) gTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCg < 6:407189/149‑1 (MQ=255) cggcggCTTCGGTTCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGt < 2:21902/148‑1 (MQ=255) cggcTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAg < 5:211968/149‑1 (MQ=255) tGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCAcg > 1:58298/1‑149 (MQ=255) tGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACCCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCAcg < 5:357847/149‑1 (MQ=255) aTGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCTACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTAGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGAGCCATACATCGACGGTAAAGCGCTGCACGCGGc > 7:233320/1‑149 (MQ=255) gTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTa > 8:270323/1‑149 (MQ=255) cACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCATGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCTCCATACATCCCCGGTAAAGCCCTCCa > 4:260680/1‑138 (MQ=255) cACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCa < 3:260680/138‑1 (MQ=255) gTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAg < 1:251310/149‑1 (MQ=255) tCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGtt < 7:220577/103‑1 (MQ=255) tCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGtt > 8:220577/1‑103 (MQ=255) tCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCAcc < 4:420074/108‑1 (MQ=255) tCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCAcc > 3:420074/1‑108 (MQ=255) aTTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAgc < 3:248529/123‑1 (MQ=255) aTTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTtc > 4:295206/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTtc > 1:394203/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGAGCCATACATCGCCGGTAAAgc > 4:248529/1‑123 (MQ=255) aTTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGCCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTtc > 5:245700/1‑149 (MQ=255) cTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCgg < 5:140837/149‑1 (MQ=255) cGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGtt > 2:8314/1‑148 (MQ=255) gATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTg > 5:146179/1‑148 (MQ=255) aTGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGaa < 3:295206/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAAc < 7:270323/148‑1 (MQ=255) cGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGc > 8:336193/1‑149 (MQ=255) gTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTtct < 6:353345/128‑1 (MQ=255) gTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGAGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTtct > 5:353345/1‑128 (MQ=255) cACTTTCTCCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCaa > 1:317098/1‑149 (MQ=255) tCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATg > 8:260294/1‑149 (MQ=255) gCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAg > 6:284945/1‑149 (MQ=255) gCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAg > 6:275584/1‑149 (MQ=255) cGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGTCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAg < 5:297137/148‑1 (MQ=255) cGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGc < 3:329734/149‑1 (MQ=255) aCCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCg > 2:414492/1‑149 (MQ=255) aCTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGc > 4:277708/1‑148 (MQ=255) cTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCaa < 2:129507/149‑1 (MQ=255) tCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAAt > 6:407176/1‑149 (MQ=255) gCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCt > 1:229337/1‑149 (MQ=255) ggTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGTCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTg > 1:112375/1‑149 (MQ=255) aTTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACCCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTg < 7:172440/148‑1 (MQ=255) aGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCa < 6:41040/148‑1 (MQ=255) ggTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGcc < 6:194522/146‑1 (MQ=255) ggTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGcc > 5:194522/1‑146 (MQ=255) gTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCat > 6:366625/1‑146 (MQ=255) aTGCTCGAGCATAAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCaga < 6:337743/145‑1 (MQ=255) aTGCTCGAGCATAAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCaga > 5:337743/1‑145 (MQ=255) tGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTAcc > 1:278858/1‑75 (MQ=255) tGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTAcc < 2:278858/75‑1 (MQ=255) tGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCggg < 7:336193/149‑1 (MQ=255) tGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGACTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCggg < 6:245700/149‑1 (MQ=255) gCTCGTGTATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGt > 1:421323/1‑149 (MQ=255) gCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGt > 5:147187/1‑149 (MQ=255) cTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTg > 1:55667/1‑149 (MQ=255) tCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTgg > 3:295136/1‑149 (MQ=255) tCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTgg > 4:113605/1‑149 (MQ=255) tGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCACTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCAt < 2:77361/149‑1 (MQ=255) | AGGCTCGTGCGGGGTGTACTTGTTGGGGCCCGCCCTGGACAGCAGTGCGGCGGCTTCGGTGCGATGGTCACGGGTCCATTGCTGGGCCTTGACGATGGCGTTGACCACTTTCTGCGACCACTCCGGGCGGTTATTCAGGTCATGCTCGTGCATGAACACCACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAACGGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCAT > NC_002947/4132282‑4132578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |