| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,274,564 | T→A | 5.0% | L174Q (CTG→CAG) | glcD → | glycolate oxidase FAD‑linked subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,274,564 | 0 | T | A | 5.0% | 291.1 / 2.6 | 92 | L174Q (CTG→CAG) | glcD | glycolate oxidase FAD‑linked subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/45); new base A (3/2); total (45/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
AACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCGTCACCGAA > NC_002947/4274417‑4274709 | aaCCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCACACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCt < 1:314214/149‑1 (MQ=255) ccGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTGATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGa > 1:320559/1‑149 (MQ=255) cGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGTCAGGCCGTacttga < 7:199397/149‑5 (MQ=255) cGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACaa < 8:37750/149‑1 (MQ=255) gCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAAt > 3:54941/1‑149 (MQ=255) gCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAAt < 6:223779/149‑1 (MQ=255) cAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGTCAGGCCGTacttgagg < 6:50849/149‑7 (MQ=255) cAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAAtg < 5:43396/149‑1 (MQ=255) cTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGc > 4:200356/1‑148 (MQ=255) cTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCt > 8:90241/1‑149 (MQ=255) gCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCTACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑AGGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTc < 7:148478/147‑1 (MQ=255) cATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTa < 8:216423/133‑1 (MQ=255) cATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTa > 7:216423/1‑133 (MQ=255) cATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAgg > 7:122718/1‑149 (MQ=255) cATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAgg < 8:374374/149‑1 (MQ=255) tctcCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTg > 2:7195/1‑149 (MQ=255) ccagcgcgccgcACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCGTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGa < 8:282504/141‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTgg < 7:37971/146‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATCTGCTCAAGGTg < 3:195126/145‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATcc < 5:349215/149‑1 (MQ=255) cgccgcACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTa < 7:198170/149‑1 (MQ=255) cccATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAg > 6:297571/1‑149 (MQ=255) cccATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAg > 7:394441/1‑149 (MQ=255) cATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAggg > 5:171109/1‑149 (MQ=255) tGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGc > 4:60315/1‑148 (MQ=255) ggT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCg > 5:85338/1‑148 (MQ=255) gTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAAt > 8:92907/1‑109 (MQ=255) gTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAAt < 7:92907/109‑1 (MQ=255) tactacGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCt > 3:424392/1‑149 (MQ=255) ctacGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGa < 6:266684/149‑1 (MQ=255) ctacGCACCCGAACCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGa < 6:272689/149‑1 (MQ=255) tacGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGACCGCCTGAg > 3:272039/1‑149 (MQ=255) tacGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAg > 7:246013/1‑149 (MQ=255) cGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGcc > 5:162387/1‑149 (MQ=255) gCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCt < 5:4953/149‑1 (MQ=255) cACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTg > 2:128735/1‑149 (MQ=255) aCCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTgg < 8:276632/149‑1 (MQ=255) ccGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTggg > 1:330577/1‑148 (MQ=255) gACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAg < 6:171109/149‑1 (MQ=255) ccgtCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGa < 8:265027/146‑1 (MQ=255) cTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGAt < 3:200356/149‑1 (MQ=255) ttCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGAGCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATg > 7:283000/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATg > 1:113982/1‑149 (MQ=255) tCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACTCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCt > 3:56798/1‑149 (MQ=255) tCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCt > 8:269400/1‑149 (MQ=255) tCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCt > 7:233837/1‑149 (MQ=255) tCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGAACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGCCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGACCt > 4:21866/1‑149 (MQ=255) gCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCt < 4:297171/147‑1 (MQ=255) gCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTg < 2:320559/148‑1 (MQ=255) ttGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCAGGGCATCGCTGCCCAggctcag < 5:297571/149‑6 (MQ=255) ttGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCAGGGCATCGCTGCCCAggctcag < 8:122718/149‑6 (MQ=255) gCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGccc > 5:311380/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGccc < 4:35512/148‑1 (MQ=255) tGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCgg > 2:327728/1‑149 (MQ=255) tGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCgg > 7:316304/1‑149 (MQ=255) cGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTc > 4:189733/1‑149 (MQ=255) gATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCCGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTc < 1:7195/148‑1 (MQ=255) gTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACctg > 7:51102/1‑149 (MQ=255) tGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACctgc < 8:233837/149‑1 (MQ=255) gCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACctgctg > 1:128992/1‑149 (MQ=255) gCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACctgctg < 2:330577/149‑1 (MQ=255) a‑aCGTCGCCGAAAACGCCGGTGGAGTGCACTGCCTCAAGTAAGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTAAGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGACCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTgg > 3:252144/1‑148 (MQ=255) aCGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCa < 6:162387/149‑1 (MQ=255) aCGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCa < 3:189733/149‑1 (MQ=255) cGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCAt < 4:54941/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCAtt < 4:66957/149‑1 (MQ=255) cGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGt < 3:271578/149‑1 (MQ=255) gCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGt < 4:424392/148‑1 (MQ=255) gCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGt < 8:283000/148‑1 (MQ=255) gCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGt < 7:90241/148‑1 (MQ=255) ccGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGCGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGtt > 8:340786/1‑148 (MQ=255) gAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCAt > 6:312910/1‑149 (MQ=255) gAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCAt < 6:311380/149‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCg < 2:128992/149‑1 (MQ=255) actccGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGc < 4:56798/146‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTc > 4:393732/1‑149 (MQ=255) tGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAg < 6:85338/149‑1 (MQ=255) tGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATg > 5:391657/1‑149 (MQ=255) cACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACTCCTGAGCCTGTGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGc < 3:21866/148‑1 (MQ=255) aCTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTc > 3:338999/1‑149 (MQ=255) ccTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTa < 6:391657/149‑1 (MQ=255) cattgtgTACGGTCAGGCCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTa > 7:294067/7‑149 (MQ=255) ttgtgTACGGTCAGGCCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATc > 2:24396/5‑149 (MQ=255) tCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATc > 2:133165/1‑149 (MQ=255) tCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATc > 1:250746/1‑149 (MQ=255) tgtgTACGGTCAGGCCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCg > 4:131087/4‑149 (MQ=255) aaGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATc > 6:248674/1‑123 (MQ=255) aaGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATc < 5:248674/123‑1 (MQ=255) aaGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCGt > 2:270771/1‑149 (MQ=255) gTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACTCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTc < 5:308867/118‑1 (MQ=255) gTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTc > 6:308867/1‑118 (MQ=255) gCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCGTCACCGaa < 2:113982/149‑1 (MQ=255) gCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCGTCACCGaa < 1:133165/149‑1 (MQ=255) | AACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCA‑ACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCGTCACCGAA > NC_002947/4274417‑4274709 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |