| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,274,566 | A→G | 5.5% | T175A (ACC→GCC) | glcD → | glycolate oxidase FAD‑linked subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,274,566 | 0 | A | G | 5.5% | 268.5 / 4.3 | 91 | T175A (ACC→GCC) | glcD | glycolate oxidase FAD‑linked subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/45); new base G (3/2); total (44/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.50e-01 | |||||||||||
CCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCGTCACCGAA > NC_002947/4274419‑4274709 | ccGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTGATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGa > 1:320559/1‑149 (MQ=255) cGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGTCAGGCCGTacttga < 7:199397/149‑5 (MQ=255) cGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACaa < 8:37750/149‑1 (MQ=255) gCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAAt > 3:54941/1‑149 (MQ=255) gCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAAt < 6:223779/149‑1 (MQ=255) cAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGTCAGGCCGTacttgagg < 6:50849/149‑7 (MQ=255) cAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAAtg < 5:43396/149‑1 (MQ=255) cTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGc > 4:200356/1‑148 (MQ=255) cTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCt > 8:90241/1‑149 (MQ=255) gCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCTACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAAGGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTc < 7:148478/147‑1 (MQ=255) cATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTa > 7:216423/1‑133 (MQ=255) cATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTa < 8:216423/133‑1 (MQ=255) cATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAgg < 8:374374/149‑1 (MQ=255) cATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAgg > 7:122718/1‑149 (MQ=255) tctcCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTg > 2:7195/1‑149 (MQ=255) ccagcgcgccgcACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCGTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGa < 8:282504/141‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTgg < 7:37971/146‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATCTGCTCAAGGTg < 3:195126/145‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATcc < 5:349215/149‑1 (MQ=255) cgccgcACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTa < 7:198170/149‑1 (MQ=255) cccATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAg > 6:297571/1‑149 (MQ=255) cccATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAg > 7:394441/1‑149 (MQ=255) cATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAggg > 5:171109/1‑149 (MQ=255) tGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGc > 4:60315/1‑148 (MQ=255) ggT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCg > 5:85338/1‑148 (MQ=255) gTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAAt < 7:92907/109‑1 (MQ=255) gTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAAt > 8:92907/1‑109 (MQ=255) tactacGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCt > 3:424392/1‑149 (MQ=255) ctacGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGa < 6:266684/149‑1 (MQ=255) ctacGCACCCGAACCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGa < 6:272689/149‑1 (MQ=255) tacGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGACCGCCTGAg > 3:272039/1‑149 (MQ=255) tacGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAg > 7:246013/1‑149 (MQ=255) cGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGcc > 5:162387/1‑149 (MQ=255) gCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCt < 5:4953/149‑1 (MQ=255) cACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTg > 2:128735/1‑149 (MQ=255) aCCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTgg < 8:276632/149‑1 (MQ=255) ccGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTggg > 1:330577/1‑148 (MQ=255) gACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAg < 6:171109/149‑1 (MQ=255) ccgtCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGa < 8:265027/146‑1 (MQ=255) cTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGAt < 3:200356/149‑1 (MQ=255) ttCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGAGCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATg > 7:283000/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATg > 1:113982/1‑149 (MQ=255) tCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACTCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCt > 3:56798/1‑149 (MQ=255) tCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCt > 7:233837/1‑149 (MQ=255) tCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCt > 8:269400/1‑149 (MQ=255) tCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGAACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGCCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGACCt > 4:21866/1‑149 (MQ=255) gCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCt < 4:297171/147‑1 (MQ=255) gCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTg < 2:320559/148‑1 (MQ=255) ttGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCAGGGCATCGCTGCCCAggctcag < 5:297571/149‑6 (MQ=255) ttGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCAGGGCATCGCTGCCCAggctcag < 8:122718/149‑6 (MQ=255) 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cGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGt < 3:271578/149‑1 (MQ=255) gCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGt < 8:283000/148‑1 (MQ=255) gCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGt < 7:90241/148‑1 (MQ=255) gCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGt < 4:424392/148‑1 (MQ=255) ccGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGCGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGtt > 8:340786/1‑148 (MQ=255) 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tGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAg < 6:85338/149‑1 (MQ=255) tGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATg > 5:391657/1‑149 (MQ=255) cACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACTCCTGAGCCTGTGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGc < 3:21866/148‑1 (MQ=255) aCTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTc > 3:338999/1‑149 (MQ=255) ccTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTa < 6:391657/149‑1 (MQ=255) cattgtgTACGGTCAGGCCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTa > 7:294067/7‑149 (MQ=255) ttgtgTACGGTCAGGCCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATc > 2:24396/5‑149 (MQ=255) tCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATc > 2:133165/1‑149 (MQ=255) tCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATc > 1:250746/1‑149 (MQ=255) tgtgTACGGTCAGGCCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCg > 4:131087/4‑149 (MQ=255) aaGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATc < 5:248674/123‑1 (MQ=255) aaGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATc > 6:248674/1‑123 (MQ=255) aaGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCGt > 2:270771/1‑149 (MQ=255) gTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACTCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTc < 5:308867/118‑1 (MQ=255) gTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTc > 6:308867/1‑118 (MQ=255) gCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCGTCACCGaa < 1:133165/149‑1 (MQ=255) gCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCGTCACCGaa < 2:113982/149‑1 (MQ=255) | CCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGT‑ATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAACGCCTGAGCCTGGGCAGCGATGCCCTGGACAGCCCCGGCTTCGACCTGCTGGCATTGTTCATCGGCTCCGAAGGCATGCTCGGTATCGTCACCGAA > NC_002947/4274419‑4274709 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |