Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,349,466 | T→A | 5.6% | E161D (GAA→GAT) | galU ← | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,349,466 | 0 | T | A | 5.6% | 220.1 / 2.6 | 71 | E161D (GAA→GAT) | galU | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/33); new base A (2/2); total (36/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.19e-01 |
GTCAGGATGTAACGGCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAGTGGGCGGCCAGTGAGAA > NC_002947/4349320‑4349614 | gTCAGGATGTAACGGCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGAGTTc < 7:384407/149‑1 (MQ=255) gTCAGGATGTAACGGCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTc < 4:55777/149‑1 (MQ=255) aGGATGTAACGGCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCt < 5:419291/148‑1 (MQ=255) gATGTAACGGCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGa > 3:403800/1‑149 (MQ=255) tGTAACGGCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATg < 6:91834/149‑1 (MQ=255) tAACGGCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTCGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGc > 6:210123/1‑149 (MQ=255) aCGGCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGTGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGcga < 7:6655/149‑1 (MQ=255) aCGGCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGCCATCCAGGAAGTcga > 5:362728/1‑149 (MQ=255) ggCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGCCATCCAGGAAGTcgacc > 6:404567/1‑148 (MQ=255) gatgatCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGCCATCCAGGAAGTcgacccgca < 5:404567/149‑6 (MQ=255) gatgatCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATc > 6:83953/1‑148 (MQ=255) atgatCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGCCATCCAGGAAGTcgacccgcag < 6:362728/149‑7 (MQ=255) atgatCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGa < 7:329399/149‑1 (MQ=255) gCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATc < 6:338326/141‑1 (MQ=255) gCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATc > 5:338326/1‑141 (MQ=255) aaGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTg < 1:9085/149‑1 (MQ=255) ggCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTGGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTa < 1:426662/149‑1 (MQ=255) gcgcGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTAc < 2:358247/149‑1 (MQ=255) tCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGAc > 5:379730/1‑149 (MQ=255) ccGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGttt > 3:129642/1‑136 (MQ=255) ccGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGttt < 4:129642/136‑1 (MQ=255) ccGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGAc > 2:199170/1‑148 (MQ=255) ggggCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCAt < 2:122639/149‑1 (MQ=255) ccGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGa < 1:199170/149‑1 (MQ=255) gTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATc < 1:98168/110‑1 (MQ=255) gTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGATGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATc > 2:98168/1‑110 (MQ=255) gACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGc > 5:181545/1‑149 (MQ=255) aCCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGcc > 2:280302/1‑149 (MQ=255) cacaCGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCg > 3:425829/1‑149 (MQ=255) acacGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCgg < 4:403800/149‑1 (MQ=255) acGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGa > 6:175223/1‑124 (MQ=255) acGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGa < 5:175223/124‑1 (MQ=255) ggAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCt < 2:30582/120‑1 (MQ=255) ggAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCt > 1:30582/1‑120 (MQ=255) ggAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGtt > 6:106047/1‑148 (MQ=255) gAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGa > 5:114403/1‑149 (MQ=255) gAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGa < 3:41057/149‑1 (MQ=255) aaGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGAc < 6:379730/149‑1 (MQ=255) aGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACg < 6:114403/149‑1 (MQ=255) aTGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGca > 8:175562/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGca > 2:305086/1‑147 (MQ=255) tcgCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCgg > 3:65816/1‑134 (MQ=255) tcgCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCgg < 4:65816/134‑1 (MQ=255) tcgCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGgtc < 4:411403/149‑1 (MQ=255) tcgCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGgtc > 3:411403/1‑149 (MQ=255) tcgCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGgtc > 1:304267/1‑149 (MQ=255) ggATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTcc < 1:280302/149‑1 (MQ=255) atcatcTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGc > 5:419121/1‑149 (MQ=255) atcTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAg < 2:304267/149‑1 (MQ=255) ctcACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGca > 6:46347/1‑149 (MQ=255) cACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGcac > 5:40940/1‑148 (MQ=255) aCCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGcacca > 3:184307/1‑149 (MQ=255) aCCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGcac < 5:106047/147‑1 (MQ=255) cGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCaccacc > 3:77131/1‑149 (MQ=255) cGATCACACCATACTTGTTGCTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACcgcg < 2:371286/149‑1 (MQ=255) acacCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACgg < 5:83953/149‑1 (MQ=255) acacCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACgg < 4:77131/149‑1 (MQ=255) ccATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGcgac > 4:414969/1‑44 (MQ=255) ccATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGcgac < 3:414969/44‑1 (MQ=255) ccATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTc < 5:210123/149‑1 (MQ=255) ggTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGAt > 7:13473/1‑147 (MQ=255) gTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAg > 4:144392/1‑149 (MQ=255) tttCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAGt > 6:381266/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAGTggg > 5:129566/1‑149 (MQ=255) cTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAGTGggc > 6:15259/1‑149 (MQ=255) cGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGcc > 7:389949/1‑109 (MQ=255) cGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGcc < 8:389949/109‑1 (MQ=255) gggTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAGTGGGCGGcc < 7:175562/149‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAGTGggcggc > 2:15760/1‑147 (MQ=255) gACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAGTGGGCGGCCAGTga < 5:46347/149‑1 (MQ=255) aCTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGATTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGCCTCGTCACCGATCAGTGGGCGGCCAGt > 3:318024/1‑146 (MQ=255) ttCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAGTGGGCAGCCAGTGAGaa > 2:425872/1‑149 (MQ=255) ttCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGATTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAGTGGGCGGCCAGTgaga > 6:351592/1‑148 (MQ=255) | GTCAGGATGTAACGGCCGATGATCGCCAGGTTCGAAGGCGCGTCTTCCGGGGCCGGTTTTTCGACCATGTTGGTCACACGGAAGATGTCGTCGCGGATCATCTCACCGGCGATCACACCATACTTGTTGGTTTCCTGCGGGTCGACTTCCTGGATGGCGACGATCGAGCAGCGGTACTGTTTGTACAGCTTGACCATCTGAGTCAGCACGCCGTCACCTTCCGGGTTGACGCACAGGTCGTCCGCCAGCACCACCGCGAACGGCTCGTCACCGATCAGTGGGCGGCCAGTGAGAA > NC_002947/4349320‑4349614 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |