Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,468,367 | G→T | 5.3% | A204A (GCG→GCT) | PP_3959 → | voltage‑gated chloride channel family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,468,367 | 0 | G | T | 5.3% | 229.7 / 3.6 | 75 | A204A (GCG→GCT) | PP_3959 | voltage‑gated chloride channel family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/36); new base T (2/2); total (37/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.76e-01 |
GGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTGGGCGGGCTGCTGGGTGGTTTTTACG > NC_002947/4468222‑4468512 | ggcGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTg < 4:422949/149‑1 (MQ=255) ggcGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTg > 5:391640/1‑149 (MQ=255) gcgcACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGc < 6:175043/149‑1 (MQ=255) cACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGa < 3:95934/149‑1 (MQ=255) ccATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACAACGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATc > 5:305825/1‑149 (MQ=255) cATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATcg > 5:244516/1‑149 (MQ=255) cATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATcg > 6:406554/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTc < 2:191941/149‑1 (MQ=255) gTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGa < 1:19388/148‑1 (MQ=255) gTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGa < 7:210928/148‑1 (MQ=255) cTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCt < 1:206260/149‑1 (MQ=255) aGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCTGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTgg > 3:162763/1‑149 (MQ=255) aGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCTGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTgg > 3:156406/1‑149 (MQ=255) cGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTGTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGc > 5:303814/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATg < 6:374770/149‑1 (MQ=255) tGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATgggg > 5:333634/1‑148 (MQ=255) ggTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGGGGAGTCGTTCCGCTGGGTCTGATGGGGCAtt > 6:300800/1‑148 (MQ=255) gTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTAc > 1:200052/1‑149 (MQ=255) gCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTa > 2:116862/1‑149 (MQ=255) ccTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTAACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCATACTTTGGc > 1:144833/1‑149 (MQ=255) ttCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTCCTTTGGc > 6:102418/1‑147 (MQ=255) ttCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGc > 5:381319/1‑147 (MQ=255) ttCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATAGGCGGAGTCGAGAAGCTTGGGCTGATGGGGCATTAAGCCTACTTTGGc > 5:192233/1‑147 (MQ=255) ttaaTACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGc > 7:175057/3‑146 (MQ=255) tCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGc < 2:259191/146‑1 (MQ=255) tCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGc > 1:259191/1‑146 (MQ=255) aaTACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATgggg < 2:317182/126‑1 (MQ=255) aaTACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATgggg > 1:317182/1‑126 (MQ=255) acCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCg < 5:406554/149‑1 (MQ=255) acCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCg > 1:2498/1‑149 (MQ=255) acCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCg > 4:33654/1‑149 (MQ=255) ttAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCTGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCg < 4:156406/149‑1 (MQ=255) ttAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCTGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCg < 4:162763/149‑1 (MQ=255) gggTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCg > 6:118876/1‑149 (MQ=255) tttGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTg > 6:259386/1‑149 (MQ=255) tttGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGAGCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGAGGAGCGGGCGGATGTCGGTGCACTg > 4:377972/1‑149 (MQ=255) tGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTgg < 6:391640/148‑1 (MQ=255) tGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTg < 6:333634/147‑1 (MQ=255) tGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTg < 7:4666/147‑1 (MQ=255) gCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACg < 2:355998/106‑1 (MQ=255) gCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACg > 1:355998/1‑106 (MQ=255) ccATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGGTGCCGGTGGACTGGGGc > 7:265042/1‑149 (MQ=255) cATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACACCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCt > 2:57916/1‑149 (MQ=255) tttaGGAATTGAGCCGGAGGTTCGTGCAAGGTTGCAGTGGCTTGGTGCGCACTGCGTTGCTGATCGGCGGAGTCGGGACGCTGTGGATGAGGGGGCATTACTCCTACTTTGGCGAGAGCATCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGTGCTgg < 6:192233/146‑1 (MQ=255) ttGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTgg > 7:328566/1‑149 (MQ=255) aGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGc < 2:200052/149‑1 (MQ=255) gAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGGGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGcgt > 5:371339/1‑149 (MQ=255) aaTTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTTGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGcgtc < 6:305825/149‑1 (MQ=255) gCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTcct < 6:244516/149‑1 (MQ=255) gcGCACGTTCGTGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTGAATGCGTTTCTGATCGGCGGAGTCGTGTCGCTTTGGCTGATGGGTCATTTCGCGTACTTTGGGGTGTTCAGCTGTCGTATGTGGGTTGACTGGGGGTGGAGATTCGTTcctg < 2:381267/148‑1 (MQ=255) gCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTcctgcc > 7:140362/1‑149 (MQ=255) cACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTcct < 6:177940/145‑1 (MQ=255) cACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTcct > 5:177940/1‑145 (MQ=255) gTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCtgtg > 7:188277/1‑149 (MQ=255) aaCGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTg < 6:352817/146‑1 (MQ=255) aaCGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTg > 5:352817/1‑146 (MQ=255) aCGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTTCTTTGGCGAGATCAGCTGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTTCTgg < 5:300800/149‑1 (MQ=255) aCGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGGTGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgg < 8:265042/149‑1 (MQ=255) aCGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgg > 1:1843/1‑149 (MQ=255) gttCAGTGGCTGGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgggcg < 6:303814/148‑1 (MQ=255) ttCAGTGGTTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgggcg < 8:140362/148‑1 (MQ=255) tCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgggcggg > 3:22990/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgggcgggc > 2:61847/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgggcggg < 6:381319/148‑1 (MQ=255) aGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgggcgggc < 1:116862/148‑1 (MQ=255) aGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACACCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGTGCGGCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgggcgggc < 1:57916/148‑1 (MQ=255) gCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTGGGCGGGctgctg < 8:188277/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgggcgg > 8:279404/1‑138 (MQ=255) ggTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTGGGCGGGCTGCTGggtg > 3:145879/1‑149 (MQ=255) ggTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGAGCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTgggcgg < 7:279404/138‑1 (MQ=255) gTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTGGGCGGGCTGCTGggtg < 3:172372/148‑1 (MQ=255) gCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCGGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTGGGCGGGCTGCTGGGTGGtt < 8:175057/149‑1 (MQ=255) aCTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGGCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTGGGCGGGCTGCTGGGTGGTTTTTa < 5:118876/149‑1 (MQ=255) tGCGGGGCTGATCGGCTGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACGTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGTCGGGGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTGGGCGGGCTGCTGGGTGGTTTTTa < 3:377972/147‑1 (MQ=255) cGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTGGGCGGGCTGCTGGGTGGTTTTTACg < 1:61847/147‑1 (MQ=255) | GGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTGGTGCTCACTGCGGTGCTGATCGGCGGAGTCGTGACGCTGGGGCTGATGGGGCATTACGCCTACTTTGGCGAGATCAGCGGTCGGATGCCGGTGGACTGGGGCTGGAGCGTCGTTCCTGCCTGTGCAGTGCTGGGCGGGCTGCTGGGTGGTTTTTACG > NC_002947/4468222‑4468512 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |