Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,516,189 | C→G | 5.8% | S18R (AGC→AGG) | ate → | arginyl‑tRNA‑‑protein transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,516,189 | 0 | C | G | 5.8% | 226.1 / 4.1 | 69 | S18R (AGC→AGG) | ate | arginyl‑tRNA‑‑protein transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/34); new base G (2/2); total (33/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 |
CACCTTGACCAGCCCAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGAACTGCAACGCCTGC > NC_002947/4516041‑4516336 | cACCTTGACCAGCCCAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGc < 2:240454/149‑1 (MQ=255) ccTTGACCAGCCCAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTa < 3:21634/149‑1 (MQ=255) cTTGACCAGCCCAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTAc > 7:51083/1‑149 (MQ=255) cTTGACCAGCCCAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTAc > 4:308111/1‑149 (MQ=255) gACCAGCCCAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTg > 4:94093/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGcc < 2:404332/149‑1 (MQ=255) cAGCCCAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCg > 6:256632/1‑149 (MQ=255) cccAACCGCGCGTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTAAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGTGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTTAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCggag < 8:343343/149‑1 (MQ=255) cccAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCggag < 2:418370/149‑1 (MQ=255) cccAACAGCGCATCATTGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGTGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCggag < 5:221146/149‑1 (MQ=255) cAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCggagga < 2:101041/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAATAAAAAGTCTCACCGAAGTGGTTGATAATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGGCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGgaggag > 2:41414/1‑149 (MQ=255) aCAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCGGCAGGTAGCTGCAggagtggg < 3:325814/149‑5 (MQ=255) aGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAg > 8:232541/1‑149 (MQ=255) cgcTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGc < 8:51083/149‑1 (MQ=255) cgcTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGc < 6:275215/149‑1 (MQ=255) cATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGAcc < 7:183992/148‑1 (MQ=255) gTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTg < 2:383739/149‑1 (MQ=255) gTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTg > 4:207565/1‑149 (MQ=255) ccTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTcc < 7:232541/149‑1 (MQ=255) ccTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTc < 3:306951/148‑1 (MQ=255) tAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTc > 6:170407/1‑149 (MQ=255) aGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGAccc > 4:216024/1‑148 (MQ=255) cTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGAt < 5:359972/149‑1 (MQ=255) gCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGa < 5:256632/149‑1 (MQ=255) ttACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACg > 7:119048/1‑149 (MQ=255) acTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCATGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCa > 1:194487/1‑149 (MQ=255) cTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCAc > 7:237889/1‑149 (MQ=255) ttAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCCGCCAGCCGATGGACGTGCACg > 4:248557/1‑149 (MQ=255) ttAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACg > 5:411369/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaaGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACgt < 6:379643/148‑1 (MQ=255) aaaaaaaGACTCCCCGAAGGTGTTGATCAGGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACgt < 4:359953/147‑1 (MQ=255) aGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCg < 3:216024/149‑1 (MQ=255) tcACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGGCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCATCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGAttt > 4:247757/1‑149 (MQ=255) aCCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGt > 1:131654/1‑149 (MQ=255) ccGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTc < 7:80314/149‑1 (MQ=255) ccGAAGGGGATGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTc < 7:380210/149‑1 (MQ=255) cGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCAGATTTGTCg > 4:124453/1‑149 (MQ=255) cGAAGCGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGGTGAAGTGCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCg < 4:100392/149‑1 (MQ=255) ttGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATggg < 8:237889/149‑1 (MQ=255) taTCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGc < 5:355358/147‑1 (MQ=255) aTCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCt < 8:119048/148‑1 (MQ=255) aTCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCt < 6:411369/148‑1 (MQ=255) aTGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTc < 3:308111/148‑1 (MQ=255) gcgGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGac > 3:245165/1‑148 (MQ=255) gcgGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTCCCGGAGGAGCACGCGACCACGCTGATACTCGACCCCAGCCAGCCGATCGACGTGCACGTCTACGCCCATATGTCGTAAATGGGCTTTCGACGCAgatgcgcc > 5:414532/1‑141 (MQ=255) ttGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACACCTGCAGCTACCTGCCTGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCACCCAGCCGATGGACGTGCACGTGAACGCCGATTTGTTCGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGaccac < 1:41414/147‑1 (MQ=255) aGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTAc < 5:170407/149‑1 (MQ=255) ttCTATGCCACTCAGTCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGATCACCTGTACCg > 4:130816/1‑149 (MQ=255) cTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGcc > 4:209286/1‑149 (MQ=255) cTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGc < 3:248557/148‑1 (MQ=255) aTGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGAGGCGACCACCTGTACCGCCca > 4:226531/1‑149 (MQ=255) ccACTCACCCCCACTCATGCAGCTAACTTCCGTCGGAGCAGGCTACCACGCTGTTCATCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCTCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCacac < 3:51749/149‑1 (MQ=255) aCTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGCCCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTg > 5:37440/1‑149 (MQ=255) aCTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATgg > 1:416211/1‑109 (MQ=255) aCTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATgg < 2:416211/109‑1 (MQ=255) aGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGcc < 3:226531/147‑1 (MQ=255) ctgctccTCCGGCAGGTAGCTGCAGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAg > 7:187311/7‑148 (MQ=255) ccccACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGaa > 1:410255/1‑149 (MQ=255) ccccACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGaa > 7:180616/1‑149 (MQ=255) cccACTCCTGCAGCTACCTGCGGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGAAc > 5:271470/1‑149 (MQ=255) aCTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGAACTg > 6:45602/1‑148 (MQ=255) aCTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGAACTg < 5:45602/148‑1 (MQ=255) ccggCAGGTAGCTGCAGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGcc > 4:234085/4‑129 (MQ=255) ccggCAGGTAGCTGCAGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGcc < 3:234085/126‑1 (MQ=255) cTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGAACTGCAAc < 2:131654/148‑1 (MQ=255) cTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGAACTGCAACg > 6:27864/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGAAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTCTACCCCGAGTTGGCGGAAATGGGCGATCGCCGCAGTGGCGACCACCACTACCGCCCACACTGCCAGAACTGCAACg > 7:66501/1‑149 (MQ=255) tGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGAACTGCAACGc > 4:177706/1‑149 (MQ=255) gCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGAACTGCAACGCCTGc < 3:94093/149‑1 (MQ=255) | CACCTTGACCAGCCCAACAGCGCTTCATGGGTTGCCTAGGCGAGTTCCCGTAGCTGGCTTACACTTAAAAAAAAGTCTCACCGAAGGGGTTGATCATGACAGAGTTGGCGCGGTTGAAGTTCTATGCCACTCAGCCCCACTCCTGCAGCTACCTGCCGGAGGAGCAGGCGACCACGCTGTTCCTCGACCCCAGCCAGCCGATGGACGTGCACGTGTACGCCGATTTGTCGGAAATGGGCTTTCGCCGCAGTGGCGACCACCTGTACCGCCCACACTGCCAGAACTGCAACGCCTGC > NC_002947/4516041‑4516336 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |