| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,669,732 | G→A | 8.8% | V22M (GTG→ATG) ‡ | nuoN → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,669,732 | 0 | G | A | 8.8% | 193.8 / 6.4 | 68 | V22M (GTG→ATG) ‡ | nuoN | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/28); new base A (2/4); total (36/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
ACCTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATC > NC_002947/4669587‑4669875 | acCTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑Cggtgg > 7:283516/1‑149 (MQ=255) tGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑Cggtggtgg < 3:370517/147‑1 (MQ=255) ccgccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCTATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGgtggtggtg < 1:59719/147‑1 (MQ=255) ccgccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGa < 2:314202/148‑1 (MQ=255) caccaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTg < 5:34766/149‑1 (MQ=255) caccaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CCACCGTGGTGATGGTg < 2:243125/149‑1 (MQ=255) accaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCGCCAGCATCACCA‑CCACCGTGGTGAtggtgg < 5:78883/149‑1 (MQ=39) tGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGAt > 8:199131/1‑149 (MQ=255) gAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATc > 8:337618/1‑149 (MQ=255) gtggtgTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGc > 2:363945/1‑149 (MQ=255) tggtgTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGcc > 5:101427/1‑149 (MQ=255) tggtgTGCAGCAGTGGCACGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCAACGCATTGGCGCCGATACTGATCACCACCATCACCA‑CGGAGGTGCTGATGCTCGCGATCGc > 2:188375/1‑148 (MQ=255) tcagcagTGGCTCGGATCCGATTTCACTCAACTCTCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCTATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCGTGGaa < 8:207829/147‑1 (MQ=255) cagcagTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAgt < 5:245406/149‑2 (MQ=255) cagcagTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAgc > 3:400790/1‑149 (MQ=255) cagTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCa < 1:68058/149‑1 (MQ=255) gCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCAc > 8:328673/1‑149 (MQ=255) gATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTTATCACCACCATCACCATCGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGc < 1:89511/149‑1 (MQ=255) gATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCg > 2:306300/1‑147 (MQ=255) tCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGa > 6:139575/1‑149 (MQ=255) gCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCt < 5:239537/125‑1 (MQ=255) gCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCt > 6:239537/1‑125 (MQ=255) gCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCt < 7:397495/149‑1 (MQ=255) tCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTc < 4:400790/147‑1 (MQ=255) cACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCct < 7:337618/148‑1 (MQ=255) aCTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCctgc > 1:251693/1‑149 (MQ=255) aCTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCctgc < 5:391868/149‑1 (MQ=255) cTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCctgct < 5:412912/149‑1 (MQ=255) atcTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCGACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTc < 6:18076/147‑1 (MQ=255) aaCTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCctgctg < 6:101427/147‑1 (MQ=255) aCTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTc > 1:143278/1‑148 (MQ=255) tCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCAc > 8:71774/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGCCCTTCCTGCTGTCCACCg > 3:2778/1‑149 (MQ=255) cGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTgg < 2:143278/148‑1 (MQ=255) cGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTg < 7:328673/147‑1 (MQ=255) ggCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATACTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGc < 2:380807/149‑1 (MQ=255) gcTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCct < 8:359946/149‑1 (MQ=255) cTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCctg < 4:2778/149‑1 (MQ=255) tATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGACctgc > 8:93910/1‑149 (MQ=255) caccacTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTcc > 4:257684/1‑149 (MQ=255) ccacTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTg > 4:340418/1‑149 (MQ=255) cTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCg < 5:308588/149‑1 (MQ=255) tCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCgg > 8:182770/1‑149 (MQ=255) tCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCgg > 8:113712/1‑149 (MQ=255) acacTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGgcgc > 7:18322/1‑149 (MQ=255) cTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGa < 1:153789/149‑1 (MQ=255) cATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTcgcg > 3:330077/1‑149 (MQ=255) ttGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGcgcc > 1:6132/1‑149 (MQ=255) aTGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGt < 5:139575/149‑1 (MQ=255) cTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTca > 5:62710/1‑148 (MQ=255) tGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTcaca > 6:70244/1‑149 (MQ=255) aTCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACAt < 3:48869/148‑1 (MQ=255) aTCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATc > 4:390302/1‑149 (MQ=255) caccacCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGc > 3:58076/1‑149 (MQ=255) caccacCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGc < 7:93910/149‑1 (MQ=255) caccacCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGc > 7:259465/1‑149 (MQ=255) ccagcaTCACCA‑CCACCGTGGTGATGGTGGTGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCctgct < 1:214089/100‑1 (MQ=25) ccagcaTCACCA‑CCACCGTGGTGATGGTGGTGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCctgct > 2:214089/1‑100 (MQ=25) ccagcaTCACCA‑CCACCGTGGTGATGGTGGTGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCgg < 1:117964/138‑1 (MQ=38) ccagcaTCACCA‑CCACCGTGGTGATGGTGGTGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCgg > 2:117964/1‑138 (MQ=38) ccaccaTCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGcgcc < 7:252954/130‑1 (MQ=255) ccaccaTCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGcgcc > 8:252954/1‑130 (MQ=255) caccaTCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGa < 7:199131/149‑1 (MQ=255) accaTCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGAt > 1:93307/1‑149 (MQ=255) ccaTCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATc < 8:283516/149‑1 (MQ=255) tCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCAcc < 7:113712/149‑1 (MQ=255) acca‑cGGTGGTCGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGCCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCCCTGATCACCAt > 3:234718/1‑149 (MQ=255) ca‑cGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATc > 8:100017/1‑148 (MQ=255) ca‑cGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATc > 6:159527/1‑148 (MQ=255) ca‑cGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATc > 5:46576/1‑148 (MQ=255) ca‑cGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGAACTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGATTTCGCTCATGCCGGCGCTGAAGGTCACGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATc > 7:272549/1‑148 (MQ=255) | ACCTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCA‑CGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATC > NC_002947/4669587‑4669875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |