| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,348,705 | 0 | A | G | 52.3% | 1.9 / 116.0 | 88 | intergenic (‑70/+404) | PP_3820/galU | group II intron‑encoding maturase/UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (22/19); new base G (23/22); total (45/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCTCA > NC_002947/4348594‑4348851 | cATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTgg < 7:118257/146‑1 (MQ=17) ttACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAg > 7:130313/1‑148 (MQ=17) aCGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGt > 1:190301/1‑140 (MQ=31) aCGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGt < 2:190301/140‑1 (MQ=31) aCGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCg > 1:313839/1‑148 (MQ=34) cGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGt < 1:50131/148‑1 (MQ=34) gTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTa > 3:158506/1‑147 (MQ=21) gTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTa > 8:135352/1‑147 (MQ=21) ttACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACa < 4:196377/148‑1 (MQ=21) ccAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAt < 1:197519/148‑1 (MQ=34) taaCTAGACGGAGACGCGTTCTGGAGGCATAAGCTGTTCGGCCGTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGAGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAtc < 4:225563/147‑1 (MQ=11) cAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAtc > 2:320667/1‑148 (MQ=21) aCGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATATCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGTGTACAGAtctc < 4:73705/148‑1 (MQ=255) cGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCg > 2:272162/1‑137 (MQ=21) cGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCg < 1:272162/137‑1 (MQ=21) cGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACATCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTcc > 1:235703/1‑148 (MQ=21) gagaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTccc < 2:57474/148‑1 (MQ=34) agaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTccc < 5:49849/147‑1 (MQ=21) agaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTGCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTccc < 6:213709/147‑1 (MQ=21) gaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCa < 6:22602/147‑1 (MQ=34) aCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAgg > 3:140643/1‑148 (MQ=21) cGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAggg < 4:92373/148‑1 (MQ=21) cGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAggg > 2:202013/1‑148 (MQ=34) cGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAgg < 5:312671/147‑1 (MQ=34) gCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACGCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAggg > 1:81994/1‑147 (MQ=21) gCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGt > 3:167367/1‑147 (MQ=34) gACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAAt > 7:168346/1‑148 (MQ=34) cTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgc > 5:99952/1‑147 (MQ=34) tACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc > 3:158151/1‑148 (MQ=34) tACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcg > 6:301013/1‑147 (MQ=34) aCTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcg > 5:129616/1‑146 (MQ=21) cggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCtt > 2:230889/1‑148 (MQ=21) ggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTaa > 2:265415/1‑134 (MQ=21) ggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTaa < 1:265415/134‑1 (MQ=21) gcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTcc < 4:158151/148‑1 (MQ=34) cATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTcc < 6:42805/147‑1 (MQ=34) attaCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CTCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTTCAGATCTCCCATGGTAATTCGCGCGACCTTCCTg < 2:196603/145‑1 (MQ=255) aTAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTg > 1:328565/1‑148 (MQ=21) aTAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTg < 2:81994/148‑1 (MQ=34) aTAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTg < 4:167367/148‑1 (MQ=34) aaCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCt > 4:238208/1‑148 (MQ=34) aCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTccc < 7:244963/121‑1 (MQ=35) aCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTccc > 8:244963/1‑121 (MQ=35) ccTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCGACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCtt < 5:301013/147‑1 (MQ=21) cTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt < 1:128658/148‑1 (MQ=21) cTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt < 4:158506/148‑1 (MQ=21) ttCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATg < 8:130313/146‑1 (MQ=21) ttCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATg < 8:231276/146‑1 (MQ=21) ttCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATg < 3:234724/146‑1 (MQ=34) cccTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCg < 1:230889/148‑1 (MQ=21) cccTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCg > 3:80581/1‑148 (MQ=34) ttGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCa > 5:77970/1‑109 (MQ=25) ttGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCa < 6:77970/109‑1 (MQ=25) gtggCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTa > 8:28685/1‑148 (MQ=21) gcgcGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGt > 4:129253/1‑148 (MQ=21) ggTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTcac < 5:25479/147‑1 (MQ=21) ttAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGc > 3:186609/1‑148 (MQ=34) cGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTccc < 8:213721/91‑1 (MQ=37) 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gCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTg < 6:99952/147‑1 (MQ=34) gCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAACTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTgg > 1:99621/1‑148 (MQ=21) tGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTa < 2:25652/112‑1 (MQ=35) gACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTGTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTAc > 1:25652/1‑113 (MQ=255) cTTCTGCACGCTCTTCGGGTCGACTT‑TGGAAGCGCGGTAGCACAGTGGATAGCGTACAGATCTCCCAGGTTAATTGGCGTGACCTTCCTGCTTATGCATGTCGTATATACGTCACAGCTTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGAtt < 7:297985/148‑1 (MQ=11) cTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGAtt < 2:328565/148‑1 (MQ=21) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |