| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,262,543 | Δ1 bp | 5.4% | coding (716/1488 nt) | PP_4638 → | methylenetetrahydrofolate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,262,543 | 0 | C | . | 5.4% | 243.1 / 7.0 | 74 | coding (716/1488 nt) | PP_4638 | methylenetetrahydrofolate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/39); new base . (2/2); total (33/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.30e-01 | |||||||||||
CTGGATGCGCCGTCAGGCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATCGAGTACTGGC > NC_002947/5262397‑5262689 | cTGGATGCGCCGTCAGGCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTcc > 7:73509/1‑148 (MQ=255) tGGATGCGCCGTCAGGCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTcc < 5:129688/147‑1 (MQ=255) tGGATGCGCCGTCAGGCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTcc > 6:129688/1‑147 (MQ=255) gATGCGCCGTCAGGCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAgg > 3:307816/1‑149 (MQ=255) gATGCGCCGTCAGGCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAgg > 1:1173/1‑149 (MQ=255) gcCGTCAGGCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCttt < 4:307816/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGcc < 8:54292/149‑1 (MQ=255) gCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCTTGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGgc > 1:26914/1‑149 (MQ=255) gCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGgc > 4:157465/1‑149 (MQ=255) cTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGgcgc > 1:166483/1‑149 (MQ=255) aCCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGgcgcg < 3:157465/147‑1 (MQ=255) ccAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCCCCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCCAGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCCTCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAgt > 5:13034/1‑149 (MQ=255) aaGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAgtgt > 2:82293/1‑149 (MQ=255) aGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGtt < 8:140334/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGAGGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGc < 4:37772/149‑1 (MQ=255) cTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCt < 5:104836/149‑1 (MQ=255) gcctCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTg > 8:140291/1‑149 (MQ=255) cctCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTg > 8:275376/1‑148 (MQ=255) ccTCACCCACGGGCGCTCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCg < 7:70476/149‑1 (MQ=255) ccTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCg < 7:275376/149‑1 (MQ=255) ccTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCg < 3:292486/149‑1 (MQ=255) ccTAACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTAACGCCAACCATTCGCGACATGCTAGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTTCCCAGGCGCGCAGAGTTTCCCGCCAGGCCTTGCAGATTAtac > 8:257122/1‑147 (MQ=255) aCCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGt < 1:125623/147‑1 (MQ=255) ccACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACa > 4:193301/1‑148 (MQ=255) cgcgcgACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGAt < 7:192519/149‑1 (MQ=255) gcgcgACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTTCAAAGCTGATg > 8:178172/1‑149 (MQ=255) gcgcgACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATg < 4:44631/149‑1 (MQ=255) cgcgACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATgg < 2:26914/149‑1 (MQ=255) cgcgACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATgg < 2:1173/149‑1 (MQ=255) gaTGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCtt > 3:68344/1‑117 (MQ=255) gaTGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCtt < 4:68344/117‑1 (MQ=255) gCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGCCGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATGGGTCCTAAGCTGATGGGCTACGCCg > 5:178728/1‑149 (MQ=255) cTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCgg > 7:65107/1‑149 (MQ=255) gACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGgt < 2:92589/147‑1 (MQ=255) ccACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGtgtg > 4:155746/1‑148 (MQ=255) ccACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGT‑‑‑AGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCAcc > 6:131589/1‑149 (MQ=255) ccACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGT‑‑‑AGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCAcc > 2:232595/1‑149 (MQ=255) cGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCAcc > 5:53790/1‑149 (MQ=255) gTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCt < 8:65107/149‑1 (MQ=255) tggatggCGTGACAGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTg > 7:30714/6‑149 (MQ=255) ggCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATggg > 2:192682/1‑129 (MQ=255) ggCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATggg < 1:192682/129‑1 (MQ=255) cGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAg < 6:145813/149‑1 (MQ=255) gCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAggg < 7:140291/149‑1 (MQ=255) tGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGtt < 3:155746/149‑1 (MQ=255) gACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGtt > 2:37871/1‑148 (MQ=255) gACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTc < 8:73509/149‑1 (MQ=255) aCTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTc < 3:193301/148‑1 (MQ=255) cTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTcac < 3:110032/149‑1 (MQ=255) tGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTcaca > 5:294662/1‑149 (MQ=255) aCGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGc < 2:166483/148‑1 (MQ=255) aCGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCt > 6:14259/1‑149 (MQ=255) cGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCt > 5:323221/1‑130 (MQ=255) cGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCt < 6:323221/130‑1 (MQ=255) cGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTc < 1:82293/149‑1 (MQ=255) gCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTc > 3:145936/1‑148 (MQ=255) ccatccatGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCg > 1:6342/1‑148 (MQ=255) catccatGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGaa > 8:244374/1‑149 (MQ=255) atccatGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGaa > 3:296099/1‑148 (MQ=255) catGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAg < 7:257122/148‑1 (MQ=255) gACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGc < 3:10666/149‑1 (MQ=255) aTGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCt < 6:294662/149‑1 (MQ=255) cTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGga < 5:181433/149‑1 (MQ=255) gAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGgaga < 4:145936/148‑1 (MQ=255) gAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGAc > 4:108099/1‑149 (MQ=255) aGCGGCGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCGGGCCGTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGGTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGAccc < 6:13034/149‑1 (MQ=255) gagaCGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTAt > 7:123770/1‑149 (MQ=255) gagaCGGCGCAGT‑‑‑AGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATCGa < 1:232595/149‑1 (MQ=255) gagaCGGCGCAGT‑‑‑AGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATCGa < 5:131589/149‑1 (MQ=255) agaCGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATc < 3:108099/149‑1 (MQ=255) gaCGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATc > 1:165209/1‑148 (MQ=255) aCGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATCGa < 5:14259/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATCGa < 2:65206/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATCGa < 6:53790/149‑1 (MQ=255) cgcAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATCGAGTAc < 8:30714/149‑1 (MQ=255) aGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATCGAGTACTgg > 1:63658/1‑149 (MQ=255) gTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATCGAGTACTGGc < 2:63658/149‑1 (MQ=255) | CTGGATGCGCCGTCAGGCCTCACCCAAGCCCATGCTGGCCTGCCTCATGAGCCTCACCCACGGGCGCGCGACGATGCTCGACCACGTGGCCGGCGTGACTGTCACGCCATCCATGCGCGACATGCTCGAAGCGGAGACGGCGCAGTCCAAGGCCTTTGCCCAGGCGCGCAGTGTTGACCGCCTGGCCTTGCAGATTATCGGTACAAAGCTGATGGGCTACGCCGGTGTGCACCTGTCAGGGGTTCACACGCTCGAACAGCTGCTGGCCCTGGAGACCCGTATCGAGTACTGGC > NC_002947/5262397‑5262689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |