| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 421,154 | Δ1 bp | 5.5% | intergenic (+11/+7) | PP_0347 → / ← PP_0348 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 421,154 | 0 | T | . | 5.5% | 285.6 / 10.2 | 91 | intergenic (+11/+7) | PP_0347/PP_0348 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/43); new base . (2/3); total (44/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.13e-01 | |||||||||||
CCATGTGCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAACGGCAAT > NC_002947/421007‑421301 | ccATGTGCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTc < 6:231859/149‑1 (MQ=255) tgtgCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGc < 6:42007/149‑1 (MQ=255) taccAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTg > 7:270621/3‑149 (MQ=255) ccAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGt < 3:29229/148‑1 (MQ=255) gCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGt > 6:75899/1‑149 (MQ=255) aCGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTgg < 6:285679/149‑1 (MQ=255) gCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑Gc < 5:327323/149‑1 (MQ=255) gCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑Gc > 1:53027/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGC‑CCACTGACAGCGGAGCcggcg < 6:97408/149‑1 (MQ=255) cagctcagctTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCcggcgg < 8:270621/149‑1 (MQ=255) gctcagctTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGt > 2:74054/1‑137 (MQ=255) gctcagctTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCggtg < 1:284496/149‑1 (MQ=255) tcagctTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCggtggt > 2:151270/1‑149 (MQ=255) agctTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTg < 2:273660/149‑1 (MQ=255) agctTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGACCGCCGGC‑CCACTGACAGCGGAGCcggcggcctc < 7:245852/147‑5 (MQ=38) ccccGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTGGCCAAAACTGGTCGACTCAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCTGGGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGc < 3:316158/149‑1 (MQ=255) cccGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCATTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTgg > 4:81932/1‑147 (MQ=255) cccGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTgg > 5:300082/1‑147 (MQ=255) ccGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCTGTGGTTTATCTGGCAg < 8:99584/149‑1 (MQ=255) cTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCa > 4:94258/1‑149 (MQ=255) tATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTACGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAg > 2:282372/1‑149 (MQ=255) tGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑c < 5:75899/148‑1 (MQ=255) tGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCACCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑c < 8:248944/148‑1 (MQ=255) ccGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGAGTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAgt < 4:232566/139‑1 (MQ=255) ccGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAgt > 3:232566/1‑139 (MQ=255) cGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGt > 6:195357/1‑148 (MQ=255) cGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCAGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCCGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGt > 3:76312/1‑148 (MQ=255) aCCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCActg < 2:281679/149‑1 (MQ=255) ccGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCActgc > 8:118554/1‑149 (MQ=255) cGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGGCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTTATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCActgct > 6:115333/1‑149 (MQ=255) cACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTgcgc < 7:118554/149‑1 (MQ=255) aCGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑ACAGTCACTGATGCGcc > 6:256201/1‑149 (MQ=255) ggCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCcct > 1:221954/1‑149 (MQ=255) ctgctgCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCcctgc < 2:221954/149‑1 (MQ=255) gctgcGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCcctgcct > 6:74644/1‑149 (MQ=255) ctgcGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCcctgcctg < 2:133131/149‑1 (MQ=255) gcgcAACTCCCCCACTGGCAGTGCCTTCAATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑CCCGGCGGTGGTTGATCTCGCAGTCTCAG‑CCAGTCACTGCTGCCCcctcaatggc > 8:252887/1‑142 (MQ=255) cgcAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTgg < 1:282372/147‑1 (MQ=255) aaCTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGTTGTTGCCAATACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAAc < 5:323803/149‑1 (MQ=255) cTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAAcgc < 8:107918/149‑1 (MQ=255) cTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAAcgc < 5:74644/149‑1 (MQ=255) cTGGCACACTGGCAGTGCCTTGCAGCAGCGGATGGACCGGCTGTTGCCAAACCTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGGCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAAcgc < 5:115333/149‑1 (MQ=255) aCTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAg > 7:183987/1‑149 (MQ=255) cTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGc > 5:137624/1‑149 (MQ=255) gCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGATCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCAc > 1:231759/1‑149 (MQ=255) aGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTg < 1:151270/149‑1 (MQ=255) gTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTgg < 2:82697/149‑1 (MQ=255) cATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTc < 3:94258/149‑1 (MQ=255) tCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCcctgcctg < 1:57606/117‑1 (MQ=255) tCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCcctgcctg > 2:57606/1‑117 (MQ=255) tCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCAc > 4:139269/1‑136 (MQ=255) tCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCAc < 3:139269/136‑1 (MQ=255) tCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGt > 3:36715/1‑149 (MQ=255) tCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCATATCAGCCACTGGCCGTTTTCGt > 5:78933/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCATATCAGCCACTGGCCGTTTTCGt < 6:78933/148‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTgg < 2:53027/149‑1 (MQ=255) aGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCAGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTgg < 4:76312/149‑1 (MQ=255) gCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCGCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCgca < 6:300082/149‑1 (MQ=255) tGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCgcagc > 3:245101/1‑149 (MQ=255) 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aCTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTg < 7:252887/149‑1 (MQ=255) tGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGcc > 1:322047/1‑148 (MQ=255) gAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTg > 6:255312/1‑149 (MQ=255) accaccgccgGC‑CCACTGACAGCGGAGCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTg < 3:130639/145‑1 (MQ=255) accaccgccgGC‑CCACTGACAGCGGAGCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTg > 4:130639/5‑149 (MQ=255) ccaccgccgGC‑CCACTGACAGCGGAGCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTgg > 2:42797/4‑149 (MQ=255) aGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTgg > 3:305039/1‑149 (MQ=255) aGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTgg > 3:310041/1‑149 (MQ=255) aGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTgg < 2:303786/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGAGCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTgg > 1:84916/1‑149 (MQ=255) ccgccgGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCaa < 5:88287/149‑1 (MQ=255) ccgcagGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGAACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCac > 6:106351/1‑148 (MQ=255) gccgGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCCAGCAACg > 6:91630/1‑149 (MQ=255) cgGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAACGGc < 4:245101/149‑1 (MQ=255) ggCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCCAGCAACgccg < 2:322047/149‑4 (MQ=255) gCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCCAGCAACgccgg < 5:91630/149‑5 (MQ=255) cTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAACGGCAAt < 6:137624/149‑1 (MQ=255) | CCATGTGCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAG‑CCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAACGGCAAT > NC_002947/421007‑421301 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |