Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 790,629 | Δ1 bp | 6.8% | coding (41/498 nt) | PP_0676 ← | transcription elongation factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 790,629 | 0 | T | . | 6.8% | 180.7 / 7.0 | 59 | coding (41/498 nt) | PP_0676 | transcription elongation factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/29); new base . (2/2); total (28/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.54e-01 |
TTTGTCACCCCGTTCGCCCTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCAATTGTGGCGATAGGCCTTGGCAGCGCCGCGGTCCTTT > NC_002947/790487‑790776 | tttgtCACCCGGTTCGCCCTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCTCATAGTTTGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGTCC‑GGCTGATCGGCCTGGTcg‑g < 5:259158/149‑1 (MQ=255) tttgtCACCCCGTTCGCCCTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTcg < 2:83222/148‑1 (MQ=255) ttgtCACCCCGTTCGCCCTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTcg‑gc > 4:91170/1‑149 (MQ=255) gtCACCCCGTTCGCCCTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTcg‑gcgg > 2:215315/1‑149 (MQ=255) cACCCCGTTCGCCCTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCt > 7:260947/1‑149 (MQ=255) ccccGTTCGCCCTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTg < 7:33550/149‑1 (MQ=255) ccccGTTCGCCCTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTg < 7:275155/149‑1 (MQ=255) cGTTCGCCCTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTc > 1:76882/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTg < 4:9655/139‑1 (MQ=255) ccTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTg > 3:9655/1‑139 (MQ=255) ccTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGC‑CGACCAGGCCGATCAGCC‑GGTCGAgcggc > 1:237893/1‑136 (MQ=38) ccTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGC‑CGACCAGGCCGATCAGCC‑GGTCGAgcggc > 1:314711/1‑136 (MQ=38) ccTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGC‑CGACCAGGCCGATCAGCC‑GGTCGAgcggc < 2:237893/136‑1 (MQ=38) ccTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGC‑CGACCAGGCCGATCAGCC‑GGTCGAgcggc < 2:314711/136‑1 (MQ=38) cTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGa < 8:21713/149‑1 (MQ=255) gcCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCGCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGCCGCATGCCGCTGGCAGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTGCGTTGACGaa < 3:26475/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAAt < 3:250664/149‑1 (MQ=255) cTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATg > 3:147635/1‑149 (MQ=255) cTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATg > 2:224476/1‑149 (MQ=255) aGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAAAGCTCg > 3:239974/1‑149 (MQ=255) gTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCgg > 6:175615/1‑149 (MQ=255) ttCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGc > 7:198620/1‑149 (MQ=255) cTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGCCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCAt < 4:141610/149‑1 (MQ=255) cAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAgg < 2:78826/149‑1 (MQ=255) aaGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAggg > 1:316831/1‑149 (MQ=255) aGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGc < 7:80072/149‑1 (MQ=255) cGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCt < 5:74774/107‑1 (MQ=255) cGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCt > 6:74774/1‑107 (MQ=255) gCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATga < 8:260947/149‑1 (MQ=255) cagccGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGGCTGGTCG‑TCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCTGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATgaga < 7:191253/146‑1 (MQ=255) cACCCGCGTTTGGAACTGGCGCAGGCCTCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGAGCATgaga < 5:106527/149‑1 (MQ=255) cACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATgaga < 6:169792/149‑1 (MQ=255) cACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATgaga > 7:34530/1‑149 (MQ=255) cccGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCgg > 8:29179/1‑119 (MQ=255) cccGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCgg < 7:29179/119‑1 (MQ=255) gcgTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACcat > 6:132484/1‑148 (MQ=255) tttGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATg < 1:224476/149‑1 (MQ=255) tttGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATg < 6:258855/149‑1 (MQ=255) tttGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGACCTCCTTGTGCATGAGACCATCATg > 6:27415/1‑149 (MQ=255) cAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCa < 1:215315/148‑1 (MQ=255) aaCTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCgg < 6:310306/108‑1 (MQ=255) aaCTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCgg > 5:310306/1‑108 (MQ=255) tGGCGCAGGCCGCTGGACGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTAGGCTCATGTAGGGCATCATTGTGAATGAGACCATCATAGAAGgccg > 8:246814/1‑149 (MQ=255) gcAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGTCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCgg > 3:48749/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGCTGGACGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATAGCAGGCCGCCGGt < 7:246814/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCGTCTCTTAGTTGGGCTGTTCGGTGATGGGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTTGTGG‑GCGGCTTTGTGTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGTCCTCCTTGTGCATGAGAACATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAg < 4:147635/149‑1 (MQ=255) tCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTcc < 3:91170/149‑1 (MQ=255) aTAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGACTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGttt > 8:165811/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCaa < 2:316831/149‑1 (MQ=255) gCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCAATTGTgg < 8:34530/149‑1 (MQ=255) gccgcTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGTTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCAATTGTGGCGATAGGc > 2:250791/1‑149 (MQ=255) cgcTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCAATTGTGGCGATAGGCCt > 6:248110/1‑149 (MQ=255) gcTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTTAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCAATTGTGGAGATAGGCCtt > 5:89919/1‑149 (MQ=255) tCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTaaa < 2:167663/108‑1 (MQ=255) tCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTaaa > 1:167663/1‑108 (MQ=255) tCGACC‑GGATGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGGCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCAATTGTGGCGATAGGCCTTgg > 6:124875/1‑149 (MQ=255) gcGACC‑GGCGGATCGGCCTGGGCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCAATTGTGGCGATAGGCCTTgg < 2:76882/148‑1 (MQ=255) gATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCAATTGTGGCGATAGGCCTTGGCAGCGCcgcg > 8:25338/1‑149 (MQ=255) cTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCAATTGTGGCGATAGGCCTTGGCAGCGCCGCGGTCCttt < 5:175615/149‑1 (MQ=255) | TTTGTCACCCCGTTCGCCCTGCGCCTGCAGTTCGCTGCGCAAGGCATTCAGCTCGGCCACCCGCGTTTGCAACTGGCGCAGGCCGCTGGCCGTCACATAGTTGGGCTGTTCGCTGATGCGCCGCTCGACC‑GGCTGATCGGCCTGGTCG‑GCGGCTTGGTCTTCGTTGACGAATGCTCGGCTCATGTAGGGCCTCCTTGTGCATGAGACCATCATGGCAGGCCGCCGGTTTAAAGGAATGTCCGTTTGCGACTCAATTGTGGCGATAGGCCTTGGCAGCGCCGCGGTCCTTT > NC_002947/790487‑790776 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |