Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,452,122 | Δ1 bp | 28.8% | coding (284/1542 nt) | PP_1271 → | putative Multidrug efflux MFS transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,452,122 | 0 | T | . | 28.8% | 134.1 / 58.7 | 59 | coding (284/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (18/23); new base . (9/8); total (28/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.63e-01 |
AACGAGTCGGTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTG > NC_002947/1451974‑1452267 | aaCGAGTCGGTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCt > 5:1639/1‑149 (MQ=255) aaCGAGTCGGTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTAGCt > 1:243741/1‑149 (MQ=255) cGAGTCGGTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTgc > 6:300412/1‑149 (MQ=255) aGTCGGTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTgc‑gg < 8:15969/149‑1 (MQ=255) tCGGTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTgc‑ggcg < 5:300412/149‑1 (MQ=255) gTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCtt > 3:112821/1‑149 (MQ=255) gTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCt > 2:74544/1‑148 (MQ=255) gTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCtt > 1:118380/1‑148 (MQ=255) aaCCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCAc > 1:241706/1‑149 (MQ=255) ccAAGATTTCCCTGGCCGAAATCAGCGCCGCCATCCCCATCGGTGCCGACGAAGGAGCCTGGATGCTGGCGGTAAACAGCGCCGCTACGCACTCGTCCAAGGACATTGCTCCGTGGCTGGCAAAGACCTTCTCGCAGC‑GTCGCTTCAc > 6:97050/1‑148 (MQ=255) cAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCAt < 8:32913/149‑1 (MQ=255) aGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATg < 8:23213/149‑1 (MQ=255) aGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGa < 1:22883/149‑1 (MQ=255) tttCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGAGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAgcg > 1:244092/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAg > 8:296144/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGt < 8:135716/149‑1 (MQ=255) tGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTgg > 5:247308/1‑149 (MQ=255) tCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCg < 7:77468/149‑1 (MQ=255) cgcgGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGc < 2:135904/149‑1 (MQ=255) cgcgGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGcc < 4:316692/149‑1 (MQ=255) gcggcgCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGGAGTGGGGGTGTTCGcc > 4:252119/1‑149 (MQ=255) ccATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCtt > 4:201317/1‑149 (MQ=255) cATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTATCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTg > 6:185816/1‑149 (MQ=255) gCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCctg > 4:96120/1‑149 (MQ=255) cATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCTCGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCctgc > 2:92975/1‑149 (MQ=255) ccGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCg < 2:241706/148‑1 (MQ=255) gacgaAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGt‑‑t < 7:296144/149‑1 (MQ=255) gaAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGAGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGc > 2:194762/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAAcc > 6:293659/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGca < 6:1639/149‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGca < 3:96120/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGcac < 7:120911/148‑1 (MQ=255) gCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGGTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGc < 5:243258/147‑1 (MQ=255) gCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGcc < 4:112821/148‑1 (MQ=255) gCGGTAAACAGCGCCGCTTCGGCCGCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGGGCTTGGCGTGCTGCAGCGGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCt < 2:243741/149‑1 (MQ=255) ggTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGAt > 6:86395/1‑149 (MQ=255) tataCAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGt > 5:164171/1‑149 (MQ=255) aCAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCctgctg > 4:20578/1‑112 (MQ=255) aCAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCctgctg < 3:20578/112‑1 (MQ=255) aGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑ACGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTtgct < 1:194762/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTtgttgc < 2:118380/149‑1 (MQ=255) cgccgcTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGc < 2:45312/103‑1 (MQ=255) cgccgcTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGc > 1:45312/1‑103 (MQ=255) cgccgcTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTtgctgc < 1:74544/149‑1 (MQ=255) cGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACt > 1:249063/1‑149 (MQ=255) gTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTg > 6:19362/1‑147 (MQ=255) ctcGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAggg > 3:247444/1‑149 (MQ=255) tcGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGccc < 5:245480/109‑1 (MQ=255) tcGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGccc > 6:245480/1‑109 (MQ=255) ccTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCt < 5:19362/149‑1 (MQ=255) cgcCGTGGCTGGCCTCGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTCCTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGgc < 1:92975/148‑1 (MQ=255) gcCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCt < 3:252119/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCtt < 1:73578/149‑1 (MQ=255) tggcCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTg > 1:168013/1‑134 (MQ=255) tggcCACGACCTTCTCGC‑GC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTg < 2:168013/134‑1 (MQ=255) ccACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATg < 5:293659/149‑1 (MQ=255) cGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCtg < 7:213555/149‑1 (MQ=255) cTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCtgat > 2:244753/1‑147 (MQ=255) ttCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TAGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGACGCCGATGCTGATGAg > 5:45243/1‑149 (MQ=255) cGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTg > 6:146053/1‑149 (MQ=255) gCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGt < 2:249063/147‑1 (MQ=255) | AACGAGTCGGTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGC‑GGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGT‑‑TCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTG > NC_002947/1451974‑1452267 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |