| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 262,746 | Δ1 bp | 9.9% | coding (263/282 nt) | PP_0211 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 262,746 | 0 | G | . | 9.9% | 219.0 / 18.3 | 71 | coding (263/282 nt) | PP_0211 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/35); new base . (3/4); total (32/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-02 | |||||||||||
TCACAATGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAACGTGC > NC_002947/262598‑262894 | tCACAATGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCg > 1:156786/1‑149 (MQ=255)tCACAATGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCg > 5:313065/1‑149 (MQ=255) acaATGCCCTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCCGGCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGAGCTACCCTTGGGCTTACTTGCGt < 6:317082/148‑1 (MQ=255) aaTGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGAc > 2:156321/1‑149 (MQ=255) tGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCt < 7:24162/149‑1 (MQ=255) tGCCGTGCGCCGCGCCTGTCCGGAGGCATCAGCCTGGAGCGCGACGATGTGCGCGTGGGGCAACTCGAGTCGCAAGCGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGAGCTACCCTTGGGCTTACTAGCGAGACCt < 6:73452/149‑1 (MQ=255) cggcgCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑g < 7:34418/148‑1 (MQ=255) gcgcgcCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTCACTTGC‑TGACCAGGTCacgcaa < 8:153583/149‑6 (MQ=255) gcCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTg > 4:83920/1‑148 (MQ=255) gcCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGC‑TGACCAGGTCACGCAAGtaa < 8:238673/149‑3 (MQ=255) ccTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGaa < 2:156786/149‑1 (MQ=255) ccTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGC‑TGACCAGGTCACGCAAGtaag < 2:309039/149‑4 (MQ=255) cTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAg > 3:225747/1‑149 (MQ=255) cGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGAt > 8:145529/1‑149 (MQ=255) cGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGAt < 3:46236/149‑1 (MQ=255) tgAGGGATCAGCATGCTGCGCGACTATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGAATTGCGTACAACTGGTGATCAGCGATGGGCATGAGCGAGGGATCTACCATTCGGCTTACTTGCGTCACCTGGTCA‑GAAAGTGAAgataga > 6:327517/2‑143 (MQ=255) ggAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACTATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTGGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGc < 5:327517/144‑1 (MQ=255) ggAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATc > 6:311697/1‑149 (MQ=255) gAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCt < 4:97417/144‑1 (MQ=255) gAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCt > 3:97417/1‑144 (MQ=255) aTCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCa < 3:83920/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGtt > 4:263650/1‑149 (MQ=255) aGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGGGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGtt < 8:56949/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGc > 2:309929/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGGAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGcc < 3:74245/149‑1 (MQ=255) tGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGtt < 8:66626/145‑1 (MQ=255) tGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGtt > 7:66626/1‑145 (MQ=255) tGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCg > 5:189601/1‑149 (MQ=255) tGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGaa < 6:307307/149‑1 (MQ=255) tGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGaa < 6:189601/149‑1 (MQ=255) gcgACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAggg < 1:156321/149‑1 (MQ=255) gacgaTGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGt > 4:163769/1‑149 (MQ=255) gacgaTGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGt < 4:279997/149‑1 (MQ=255) aTGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAg < 5:311697/149‑1 (MQ=255) ggtgCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGgac > 5:97482/1‑148 (MQ=255) gtgCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGgacga > 3:257240/1‑149 (MQ=255) gCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAg > 7:276821/1‑128 (MQ=255) gCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAg < 8:276821/128‑1 (MQ=255) gCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTGGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGccc > 2:111233/1‑149 (MQ=255) cAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGAcc < 6:313065/148‑1 (MQ=255) aGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGcc < 3:163769/149‑1 (MQ=255) tCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAg < 4:213910/132‑1 (MQ=255) tCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAg > 3:213910/1‑132 (MQ=255) gCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAAc > 6:257967/1‑148 (MQ=255) cAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCGTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGCCGACCGCCTCGCCGACg > 8:80396/1‑148 (MQ=255) aTGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGTCGGAATGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGcc > 3:217755/1‑149 (MQ=255) ggCGGACCACTGGCGTGCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGAGCTACCCTTGGGCTTACTTGCGGGACCTGGGCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGa < 8:230375/149‑1 (MQ=255) cGTACTACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAgg > 7:12696/1‑149 (MQ=255) aaCTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCa < 2:157953/129‑1 (MQ=255) aaCTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCa > 1:157953/1‑129 (MQ=255) gtgtTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAggg < 1:241606/96‑1 (MQ=255) gtgtTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAggg > 2:241606/1‑96 (MQ=255) gtgtTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGc < 1:309929/148‑1 (MQ=255) tgtTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCGGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGctc < 7:145529/149‑1 (MQ=255) aGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTgg < 3:263650/149‑1 (MQ=255) gCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGc < 6:97482/149‑1 (MQ=255) aGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGCCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGact > 4:133167/1‑147 (MQ=255) gcgcGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAgt < 7:80396/148‑1 (MQ=255) gcgGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGtgtg < 4:225747/149‑1 (MQ=255) gggATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTggg < 8:12696/149‑1 (MQ=255) tCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTa > 4:52875/1‑147 (MQ=255) ccTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTgggagatcg > 5:51387/1‑140 (MQ=255) ccTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTgg < 6:51387/139‑1 (MQ=255) ttcaCTTGC‑TGACCAGGTCACGCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTgg > 7:185927/4‑149 (MQ=255) ttcaCTTGC‑TGACCAGGTCACGCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTgg > 5:7980/4‑149 (MQ=255) tcaCTTGC‑TGACCAGGTCACGCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGTgg > 1:266393/3‑98 (MQ=38) tcaCTTGC‑TGACCAGGTCACGCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAgg < 2:266393/96‑1 (MQ=38) aCTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGc > 7:29220/1‑148 (MQ=255) ttGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAg > 5:45081/1‑49 (MQ=255) ttGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAg < 6:45081/49‑1 (MQ=255) gCGTGACCTGGTCA‑TCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAAc < 4:257240/147‑1 (MQ=255) gCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAAc < 3:52875/147‑1 (MQ=255) cGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGCCAACGTg > 5:321202/1‑149 (MQ=255) gTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACAGGCCGAGGCTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCAGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAACGTGc > 7:297314/1‑149 (MQ=255) | TCACAATGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAACGTGC > NC_002947/262598‑262894 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |