New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 251034 | 65 (1.250) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 6.1% | coding (169/1347 nt) | nfeD | membrane bound peptidase NefD |
? | NC_002947 | = 251061 | 61 (1.220) | coding (142/1347 nt) | nfeD | membrane bound peptidase NefD |
GGTGCCGGCGCTGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGCAACAACAGCAGCAACAGCCA > NC_002947/250891‑251181 | ggTGCCGGCGCTGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCtt < 7:294542/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCGCTGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCt < 3:212461/148‑1 (MQ=255) gTGCCGGCGCTGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCagcctc > 7:184062‑M1/1‑143 (MQ=255) ccGGCGCTGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTgcgc > 8:8752/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCTGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTgcgc > 6:59692/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCgcct > 3:171008/1‑149 (MQ=255) gcTGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCgcctggg > 5:102119/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCgcctgggcc > 3:44637/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCgcctgggcc > 8:34927/1‑149 (MQ=255) gcggcgCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCgcctgggcctg < 2:6249/149‑1 (MQ=255) gcgGGCGCCGCTGGGGGCTACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCTCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGa < 2:267860/149‑1 (MQ=255) gccgcTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTgc > 2:3954‑M2/1‑147 (MQ=255) cggcgggggcaacGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCagcctcggccaggcccaggcgcaaggcgcgc < 5:12139‑M1/145‑32 (MQ=255) cgcTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGcc < 5:15687/139‑1 (MQ=255) cgcTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGcc > 6:15687/1‑139 (MQ=255) ggggCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCagcctcggccaggcccaggcgcaaggcgcgcaac < 8:184062‑M1/147‑35 (MQ=255) ggggCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAg < 8:273126/149‑1 (MQ=255) gggCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCagcctcggccaggcccaggcgcaaggcgcgcaactgg < 3:286881‑M1/149‑38 (MQ=255) gggCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAgg < 7:8752/149‑1 (MQ=255) cAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAg > 7:54726/1‑149 (MQ=255) cAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAg > 3:212669/1‑149 (MQ=255) aGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCAc > 6:139200/1‑136 (MQ=255) tGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTc > 3:119224/1‑142 (MQ=255) tGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTc < 4:119224/142‑1 (MQ=255) tGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTg > 8:27731/1‑149 (MQ=255) gggTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTggccgggc < 6:21428/149‑1 (MQ=255) ggTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTggccgggcc < 5:141925/149‑1 (MQ=255) gTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAAGCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTggccgggccg < 3:91717/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTgc > 4:130217/1‑94 (MQ=255) ggTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTgc < 3:130217/94‑1 (MQ=255) ggTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCAGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGAGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGACGGCGCTGGCCGGGCCGATgg > 1:181397/1‑149 (MQ=255) tGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGcgtcg > 2:137203/1‑149 (MQ=255) gagagaATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGcgtcgt < 6:102119/148‑1 (MQ=255) aTTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGtt > 8:243221/1‑149 (MQ=255) cTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAg < 4:119438/147‑1 (MQ=255) cTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAg > 3:119438/1‑147 (MQ=255) gATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCAcc > 5:175804/1‑148 (MQ=255) atcTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCacac > 5:56216/1‑149 (MQ=255) tcTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCCCCCACAcc > 1:321721/1‑149 (MQ=255) tcTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACAcc > 2:209088/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGcgtcgt > 4:269066/1‑128 (MQ=255) cgcATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGcc < 6:28835/149‑1 (MQ=255) cACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGTTggc > 1:147747/1‑100 (MQ=255) cACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGTTggc < 2:147747/100‑1 (MQ=255) cACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGcc > 5:194604/1‑142 (MQ=255) cACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGcc < 6:194604/142‑1 (MQ=255) tCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTg > 3:164901/1‑149 (MQ=255) cAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGc > 3:186743/1‑149 (MQ=255) cAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGc > 3:139418/1‑149 (MQ=255) aGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGc > 7:103669/1‑148 (MQ=255) cccgcccgGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGc < 6:309014/118‑1 (MQ=255) cccgcccgGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGc > 5:309014/1‑118 (MQ=255) ccgGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTg > 1:235293/1‑139 (MQ=255) ccgGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTg < 2:235293/139‑1 (MQ=255) ccgGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGc > 5:164184/1‑149 (MQ=255) cgGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCg < 6:56216/149‑1 (MQ=255) ggggTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGt < 4:164901/149‑1 (MQ=255) ggggTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGt < 4:212669/149‑1 (MQ=255) ggggTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGt < 8:54726/149‑1 (MQ=255) gggTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTg < 4:44637/149‑1 (MQ=255) ggTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGACCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGa < 3:16337/149‑1 (MQ=255) gTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGAt < 5:59692/149‑1 (MQ=255) tCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGcc < 7:27731/149‑1 (MQ=255) aTGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAg < 7:34927/149‑1 (MQ=255) aTGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGACGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAg < 2:181397/149‑1 (MQ=255) ggATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGTCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGcaac < 1:209088/149‑1 (MQ=255) ggATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGcaac < 4:186743/149‑1 (MQ=255) accaccAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGCAACAAcag < 4:139418/149‑1 (MQ=255) ccaccaGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGCAACAAcag > 2:253220/1‑148 (MQ=255) caccaGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGCAACAAcagca < 6:175804/149‑1 (MQ=255) ccaGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTgcgcaactggtggttatccgcatggataccccgggcgggctggacagtgccatgcgccagatgatcaaggcaattctctccagcaccgtacccgtcgccagctacgttgccc < 3:286881‑M2/149‑113 (MQ=255) ccaGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGCAACAACagcagc < 7:243221/149‑1 (MQ=255) ccaGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGCAACAACagcagc < 4:108041/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTgcgcaactggtggttatccgcatggataccccgggcgggctggacagtgccatgcgccagatgatcaaggcaattctctccagcaccgtacccgtcgccagctacgttgcccc < 8:184062‑M2/147‑114 (MQ=255) gcgcgcCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTgcgcaactggtggttatccgcatggataccccgggcgggctggacagtgccatgcgccagatgatcaaggcaattctctccagcaccgtacccgtcgccagctacgttgcccccgccg < 5:12139‑M2/149‑119 (MQ=255) cgcgcCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGCAACAACAGCAGCAACAGc < 1:137203/148‑1 (MQ=255) gcgcCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGCAACAACAGCAGCAACAGcc > 6:142870/1‑148 (MQ=255) gcagcctcggccaggcccaggcgcaaggcgcgcaactggtggttatccgcatggataccccgggcgggctggacagtgccatgcgccagatgatcaaggcaattctctccagcaccgtacccgtcgccagctacgttgcccccagcggc > 2:3954‑M1/1‑2 (MQ=255) | GGTGCCGGCGCTGGCGGCGCGGGCGCCGCTGGGGGCAACGTAGCTGGCGACGGGTACGGTGCTGGAGAGAATTGCCTTGATCATCTGGCGCATGGCACTGTCCAGCCCGCCCGGGGTATCCATGCGGATAACCACCAGTTGCGCGCCTTGCGCCTGGGCCTGGCCGAGGCTGCGCACCAGGTAGTCGGCGCTGGCCGGGCCGATGGCGTCGTCGATGTTCAGCACCCACACCGCGCCGGGCGCTGCCTGGCCACCTGGCGTGATGCCAAGCAACAACAGCAGCAACAGCCA > NC_002947/250891‑251181 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |