New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 375996 = | 47 (0.900) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.1% | coding (43/771 nt) | PP_0313 | electron transfer flavoprotein subunit beta |
? | NC_002947 | 376052 = | 49 (1.010) | coding (99/771 nt) | PP_0313 | electron transfer flavoprotein subunit beta |
CCTGTCGGTGATTGGCGACAGTTCGGCGATTCTCAAGGCGCTGATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGAC > NC_002947/375850‑376142 | ccTGTCGGTGATTGGCGACAGTTCGGCGATTCTCAAGGCGCTGATCGAGGCTGTAGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCAcccc < 7:275992/149‑1 (MQ=255) agcacgcccagcacatcggccccggccggttgctccagcacgtcgaggtggtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCTc < 5:279075‑M1/8‑1 (MQ=255) gTGATTGGCGACAGTTCGGCGATTCTCAAGGCGCTGATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCg > 4:318797/1‑149 (MQ=255) gCGACAGTTCGGCGATTCTCAAGGCGCTGATCGAGGCTGTGGACAGCTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCgcgc < 6:271728/149‑1 (MQ=255) gCGACAGTTCGGCGATTCTCAAGGCGCTGATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCgcgc > 2:170972/1‑149 (MQ=255) cacatcggccccggccggttgctccagcacgtcgaggtggtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCt > 8:180079‑M1/131‑137 (MQ=255) cacatcggccccggccggttgctccagcacgtcgaggtggtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCt < 7:180079‑M1/7‑1 (MQ=255) atcggccccggccggttgctccagcacgtcgaggtggtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGc < 4:64583‑M1/6‑1 (MQ=255) atcggccccggccggttgctccagcacgtcgaggtggtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGc > 3:64583‑M1/128‑133 (MQ=255) ttCGGCGATTCTCAAGGCGCTGATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCcgccgc < 3:318797/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGATTCTCAAGGCGCTGATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCcgccgc > 2:77135/1‑149 (MQ=255) tcAAGGCGCTGATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCTTGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCACGCCGCGCCGAGCAGGa > 5:258747/1‑149 (MQ=255) tcAAGGCGCTGATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGa > 4:184682/1‑149 (MQ=255) gcgcTGATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGccc < 6:253800/149‑1 (MQ=255) gcTGATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCccgt > 3:299705/1‑149 (MQ=255) cagaacgtcgaggtggtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCccgtg < 2:254847‑M1/43‑1 (MQ=255) gATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCccgtgcc > 5:170496/1‑149 (MQ=255) gAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTgg < 1:170972/149‑1 (MQ=255) gCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGc > 3:265891/1‑149 (MQ=255) tgGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACCCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGTAAGTGATCAGCCAGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTggg > 6:44711/1‑149 (MQ=255) gtggtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTgg > 5:156345‑M1/95‑149 (MQ=255) gACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGACCGTGCCGTGGAGATGGGta > 4:19265/1‑148 (MQ=255) gtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGt > 1:254847‑M1/92‑148 (MQ=255) aCAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACAAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGttt > 6:242614/1‑149 (MQ=255) cAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTg > 7:263419/1‑149 (MQ=255) ccGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAgg > 2:220330/1‑117 (MQ=255) cGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAgctgg > 5:266305/1‑149 (MQ=255) gCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATGAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAgctgg > 1:179818/1‑149 (MQ=255) ggCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTggg > 5:119320/1‑148 (MQ=255) cgcgACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGc < 1:3066/149‑1 (MQ=255) gACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCAGGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGCTGCCCGTGCCGTGGAGGTGGGGTTGCAGCGGGCTGGGGAGAACTTGCAgg > 6:324607/1‑149 (MQ=255) aCGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTggg > 3:56745/1‑135 (MQ=255) aCGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTggg < 4:56745/135‑1 (MQ=255) cgcgGCAT‑AAGGGTACTAGCATGAGTACGAAAGTGATGAGTCTGGTTTCGATTGGTGCACACCCATGGTCCGGCCGGGCGCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCGGTGGAGCTGGGTTTGCAGGTGGCTGGTGATATGTTGCAggt < 4:41885/148‑1 (MQ=255) gcgGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAggtgg < 4:265891/149‑1 (MQ=255) gcgGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGACCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAggtgg > 7:255155/1‑149 (MQ=255) cgGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAggtggt < 2:179818/149‑1 (MQ=255) aT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCAt > 4:295742/1‑149 (MQ=255) gggCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCgg > 2:173652/1‑149 (MQ=255) gAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATc < 6:170496/149‑1 (MQ=255) aTGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCca > 6:161344/1‑147 (MQ=255) gTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCGCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGaa < 3:19265/149‑1 (MQ=255) gTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGaa < 6:266305/149‑1 (MQ=255) tACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAgg > 4:122569/1‑146 (MQ=255) cGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAagag < 3:295742/149‑1 (MQ=255) cGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAagag > 1:116830/1‑149 (MQ=255) cGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAagag < 1:77135/149‑1 (MQ=255) aGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCt > 2:61507/1‑149 (MQ=255) aTCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCca < 4:61979/132‑1 (MQ=255) aGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTgcgcgc < 1:173652/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCAGCCGCGCAGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGAAGATGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTgcgcgc > 3:246776/1‑149 (MQ=255) aTTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCAt > 2:181892/1‑149 (MQ=255) ttGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATg > 3:116543/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATggg > 6:15130/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATggg > 8:158389/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATgg < 7:154129/148‑1 (MQ=255) cccACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTgcg < 4:106093/127‑1 (MQ=255) cccACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTgcg > 3:106093/1‑127 (MQ=255) cACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGGCCGTGCCGGGGAGGGGGGTTTGCGGCTGGCTGGGGAGAACTTGCAGGTGGTGGATGCGGGCAATCCACAGGAAGGGGCCTTGCGCGCTGAGCGGGGGGTGGGGCTGGa > 4:262168/1‑149 (MQ=255) aCCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGac < 4:299705/149‑1 (MQ=255) | CCTGTCGGTGATTGGCGACAGTTCGGCGATTCTCAAGGCGCTGATCGAGGCTGTGGACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCAT‑AAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGAC > NC_002947/375850‑376142 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |