| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1034946 | 45 (0.860) | 3 (0.060) | 3/252 | NT | 6.3% | coding (983/1158 nt) | PP_0892 | phospholipase family protein |
| ? | NC_002947 | = 1034981 | 46 (0.930) | coding (1018/1158 nt) | PP_0892 | phospholipase family protein | |||||
GTTGCGCGCGGGCGTACGGATTTTCGAGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCAACGGATCTGGGGCTGGCTCGATCGGCTGGT > NC_002947/1034803‑1035093 | gTTGCGCGCGGGCGTACGGATTTTCGAGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCg < 2:293487/149‑1 (MQ=255) cgGGCGTACGGATTTTCGAGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACccgccg < 3:230924/149‑1 (MQ=255) tACGGATTTTCGAGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACa < 7:156183/149‑1 (MQ=255) cGGATTTTCGAGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACa > 8:156183/1‑147 (MQ=255) cGGATTTTCGAGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAgc < 2:30090/149‑1 (MQ=255) aTTTTCGAGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAgcggc > 6:171565/1‑149 (MQ=255) gAGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCggtggt < 8:42014/149‑1 (MQ=255) aGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGgtggtg < 3:180471/149‑1 (MQ=255) aGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGgtggtg < 7:120917/149‑1 (MQ=255) gTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGtggtgg > 6:130092/1‑149 (MQ=255) gTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGCTGTCAAcggcgggtcgag < 6:160419/149‑7 (MQ=255) tACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCtggccaccaccgccgctgtcaacggcgggtc > 5:114305‑M1/1‑116 (MQ=255) ccAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGc > 2:2339/1‑147 (MQ=255) ccAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCa < 5:130092/149‑1 (MQ=255) aGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAgc > 7:187081‑M2/1‑147 (MQ=255) tGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAgcttcga > 5:22741‑M2/1‑142 (MQ=255) cTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCtggccaccaccgccgctgtcaacggcgggtcgagcgcttcgatg < 4:60718‑M1/149‑45 (MQ=255) ttCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAgc > 3:211449‑M2/1‑139 (MQ=255) ttCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAgc < 4:211449‑M2/141‑3 (MQ=255) ccTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCtggccaccaccgccgctgtcaacggcgggtcgagcgcttcgatgtt < 6:114305‑M1/148‑47 (MQ=255) ccTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCg > 6:47978/1‑149 (MQ=255) tGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGCCAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGcc > 7:30625/1‑149 (MQ=255) aaGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCACTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGcc < 1:164544/147‑1 (MQ=255) tAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAgc < 7:168544/123‑1 (MQ=255) tAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAgc > 8:168544/1‑123 (MQ=255) tAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTc > 4:189561/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCAc > 2:41712/1‑149 (MQ=255) cGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGa > 8:134458/1‑135 (MQ=255) cGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGa < 7:134458/135‑1 (MQ=255) cGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGc < 2:57258/149‑1 (MQ=255) tGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGccc > 4:314892/1‑149 (MQ=255) tGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGccc > 5:280496/1‑149 (MQ=255) gCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCt > 8:79603/1‑149 (MQ=255) aaCTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTtg > 3:238834/1‑149 (MQ=255) aCTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGGCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTtgg < 1:54524/149‑1 (MQ=255) aCTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTtgg < 3:189561/149‑1 (MQ=255) cTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTtggt > 5:215321/1‑149 (MQ=255) cACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCGAGCGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAg > 3:308634/1‑149 (MQ=255) cACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAg > 7:142587/1‑149 (MQ=255) cgcTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCAAc < 1:2339/148‑1 (MQ=255) gcTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCaa < 1:68540/146‑1 (MQ=255) gcTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCaa > 2:68540/1‑146 (MQ=255) ttCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCAACGGAt > 4:4213/1‑149 (MQ=255) cTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGgcgc < 8:36302/126‑1 (MQ=255) cTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGgcgc > 7:36302/1‑126 (MQ=255) ttGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCAACGGATCTGGggc > 3:179762/1‑149 (MQ=255) tGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAg < 8:58969/133‑1 (MQ=255) tGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAg > 7:58969/1‑133 (MQ=255) aGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGt < 4:180552/126‑1 (MQ=255) aGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGt > 3:180552/1‑126 (MQ=255) aaCATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAgcttcgatgttggcttcaaggttgaagcgcaagttccagtggtcgaagttgcacgaaccgacgctgacccagtcgtctaccacagccatcttcaggtgcagg < 6:114305‑M2/148‑103 (MQ=255) aaCATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCAACGGATCTGGGGCTGGCTCGa > 6:45940/1‑149 (MQ=255) aaCATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCAACGGATCTGGGGCTGGCTCGa > 3:302603/1‑149 (MQ=255) cATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAgcttcgatgttggcttcaaggttgaagcgcaagttccagtggtcgaagttgcacgaaccgacgctgacccagtcgtctaccacagccatcttcaggtgcaggaag < 4:60718‑M2/149‑106 (MQ=255) tCGAAGCtggccaccaccgccgctgtcaacggcgggtcgagcgcttcgatgttggcttcaaggttgaagcgcaagttccagtggtcgaagttgcacgaaccgacgctgacccagtcgtctaccacagccatcttcaggtgcaggaagca > 5:22741‑M1/1‑7 (MQ=255) tCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCAACGGATCTGGGGCTGGCTCGATCgg > 4:153304/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCAACGGATCTGGGGCTGGCTCGATCGGCt < 5:171565/149‑1 (MQ=255) gCtggccaccaccgccgctgtcaacggcgggtcgagcgcttcgatgttggcttcaaggttgaagcgcaagttccagtggtcgaagttgcacgaaccgacgctgacccagtcgtctaccacagccatcttcaggtgcaggaagcacggct > 7:187081‑M1/1‑2 (MQ=255) gCtggccaccaccgccgctgtcaacggcgggtcgagcgcttcgatgttggcttcaaggttgaagcgcaagttccagtggtcgaagttgcacgaaccgacgctgacccagtcgtctaccacagccatcttcaggtgcaggaa > 3:211449‑M1/1‑2 (MQ=255) gCtggccaccaccgccgctgtcaacggcgggtcgagcgcttcgatgttggcttcaaggttgaagcgcaagttccagtggtcgaagttgcacgaaccgacgctgacccagtcgtctaccacagccatcttcaggtgcaggaa < 4:211449‑M1/141‑140 (MQ=255) | GTTGCGCGCGGGCGTACGGATTTTCGAGTACCAGCCGTGCTTCCTGCACCTGAAGATGGCTGTGGTAGACGACTGGGTCAGCGTCGGTTCGTGCAACTTCGACCACTGGAACTTGCGCTTCAACCTTGAAGCCAACATCGAAGCGCTCGACCCGCCGTTGACAGCGGCGGTGGTGGCCAGCTTCGAGCGCGACTTCGCCCAGAGCGAAGAAGTCGACCTCGCCCACTGGCATGCGCGCCCTTGGTGGCGCAGGGTGAAGCAACGGATCTGGGGCTGGCTCGATCGGCTGGT > NC_002947/1034803‑1035093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |