| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 1450275 | 63 (1.210) | 7 (0.140) | 7/254 | NT | 9.9% | coding (269/447 nt) | PP_1269 | universal stress protein family protein |
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GTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGCCTCGGCTACGGCGTGGTCGGCATGCTGCTGTTCCTGGCAGGCGGCGGGGTATTCTTCCAGTTCCTCGGCGGTGTAGGGCGCAGGTTGCTCATGCACGGCGAAGGTGG > NC_002947/1450133‑1450422 | gTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCctggc < 8:223793/149‑1 (MQ=255) aCCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCg > 2:82040/1‑147 (MQ=255) aCCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCg > 1:79541/1‑147 (MQ=255) aCCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGaa > 3:8874/1‑149 (MQ=255) gcgcTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCgg < 6:159447/148‑1 (MQ=255) cgcTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCt > 3:252657/1‑149 (MQ=255) tGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCaagccggcttcgccagccagggc > 8:186661‑M1/1‑126 (MQ=255) tGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTgc < 2:242909‑M2/149‑3 (MQ=255) aTTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCTGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTgctg > 1:82040‑M2/1‑145 (MQ=255) aTTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTgct > 4:8874‑M2/1‑145 (MQ=255) ttGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTgctg < 7:96755‑M2/148‑5 (MQ=255) gggTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCaagccggcttcgccagccagggctgcatggt < 7:302625‑M1/149‑32 (MQ=255) gggTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCaagccggcttcgccagccagggctgcatggt > 3:190828‑M1/1‑118 (MQ=255) gggTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTc < 6:324496/149‑1 (MQ=255) ggTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCaagccggcttcgccagccagggctgcatggtg < 4:190828‑M1/149‑33 (MQ=255) ggTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTcg > 5:217158/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCaagccggcttcgccagccagggctgcatggtgg < 7:186661‑M1/149‑34 (MQ=255) cAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCaagccggcttcgccagccagggctgcatg > 2:212845‑M1/1‑113 (MQ=255) cAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCaagccggcttcgccagccagggctgcatg < 1:212845‑M1/142‑30 (MQ=255) aGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCAc > 8:44833/1‑149 (MQ=255) aaCCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGc < 8:68209/149‑1 (MQ=255) aCCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGcc > 8:229982/1‑149 (MQ=255) aCCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGcc > 1:149679/1‑149 (MQ=255) ccGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGCCCATGATGATCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGCCt < 4:690/149‑1 (MQ=255) 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gatCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGCCTCGGCTACGGCGTgg > 4:72363/1‑127 (MQ=255) gatCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGCCTCGGCTACGGCGTgg < 3:72363/127‑1 (MQ=255) gatCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGCCTCGGCTACGGCGTGGTCGGCATGCTGCTGTTCCTg > 2:294340/1‑147 (MQ=255) gatCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGCCTCGGCTACGGCGTGGTCGGCATGCTGCTGTTCCTg < 1:294340/147‑1 (MQ=255) atCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTGGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGCCTCGGCTACGGCGTGGTCGGCATGCTGCTGTTCCTGGc < 2:195198/148‑1 (MQ=255) tCAGTTCGCAGTTCAATTCCTGCGCTTTCGTCACAATCGCTTCAACCGGCAGCCCGGCCACCATGCAGCCCTGGCTGGCGAAGCCGGCTTGCTGCAGTTCGCGCACGGCCTCGGCTACGGCGTGGTCGGCATGCTGCTGTTCATGCCAg > 7:234205/1‑149 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |