New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1490726 = | 48 (0.920) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 5.8% | coding (389/1902 nt) | cysNC | sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylyl‑sulfate kinase |
? | NC_002947 | 1490781 = | 51 (1.030) | coding (444/1902 nt) | cysNC | sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylyl‑sulfate kinase |
GGCCTGCAGGCCGAGCGCGAGCAGGGCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGATGAAGGCGTCTTCGAGTC > NC_002947/1490578‑1490873 | gctgctcggggtcaggttgatggcttcggcgaacttcaggtagtcggccttgatcgactcgaagacgccttcatcgaagcccttcaggtccatcttgttgaccgcgaccacgatgtgcttgatacccagcaacgacgcgatgtagctgt < 1:207129‑M1/1‑1 (MQ=255) gctgctcggggtcaggttgatggcttcggcgaacttcaggtagtcggccttgatcgactcgaagacgccttcatcgaagcccttcaggtccatcttgttgaccgcgaccacgatgtgcttgatacccagcaacgacgcgatgtagctgt < 4:302318‑M1/1‑1 (MQ=255) ccTGCAGGCCGAGCGCGAGCAGGGCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTgg < 8:250523/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGAGCGCGAGCAGGGCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGTAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCg < 7:194531/147‑1 (MQ=255) aGGCCGAGCGCGAGCAGGGCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGatc < 2:118367/149‑1 (MQ=255) aGGCCGAGCGCGAGCAGGGCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGat > 7:189484/1‑148 (MQ=255) gCCGAGCGCGAGCAGGGCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGatcat > 4:135420/1‑149 (MQ=255) cGAGCGCGAGCAGGGCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATcc < 8:189484/149‑1 (MQ=255) gcgcGAGCAGGGCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTgg < 8:186984/149‑1 (MQ=255) gcgAGCAGGGCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTc > 5:159987/1‑149 (MQ=255) gggCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGccc > 6:301820/1‑149 (MQ=255) cATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGc > 3:60024/1‑148 (MQ=255) aTCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGc < 6:28612/147‑1 (MQ=255) aTCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGc > 5:28612/1‑147 (MQ=255) tCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTg < 4:108502/149‑1 (MQ=255) gATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGca < 1:82809/149‑1 (MQ=255) cTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTgg < 2:224885/107‑1 (MQ=255) cTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTgg > 1:224885/1‑107 (MQ=255) cGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGTAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCg > 3:302318/1‑149 (MQ=255) cTACTTCTACACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCAATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGACGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTc > 8:45275/1‑149 (MQ=255) cgaagacgccttcatcgaagcccttcaggtccatcttgttgaccgcgaccacgatgtgcttgatacccagcaacgacgcgatgtagctgTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACACAGACCCGTCGCCACAGCt > 3:28819‑M1/90‑149 (MQ=255) cACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCt < 6:159987/149‑1 (MQ=255) cGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTAc > 4:58159/1‑148 (MQ=255) cgcAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGcgtc < 3:58159/149‑1 (MQ=255) atcgaagcccttcaggtccatcttgttgaccgcgaccacgatgtgcttgatacccagcaacgacgcgatgtagctgTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATc > 3:313634‑M1/77‑141 (MQ=255) atcgaagcccttcaggtccatcttgttgaccgcgaccacgatgtgcttgatacccagcaacgacgcgatgtagctgTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATc < 4:313634‑M1/65‑1 (MQ=255) tcatcaTCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTg > 2:291255/1‑149 (MQ=255) atcatcGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTggg > 6:251677/1‑149 (MQ=255) atcatcGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTgg < 5:301820/148‑1 (MQ=255) tcGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTAt > 1:70071/1‑148 (MQ=255) gCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGGCCACCTGCGACCTGGCGATCAGCCTGGTCGAGGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTCCATCGCGTCGTTGCTGGGTATCaa < 8:212421/149‑1 (MQ=255) ccATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTcg > 3:13089/1‑149 (MQ=255) aTGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTcgcg < 5:209907/149‑1 (MQ=255) gCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCCACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTc > 3:51736/1‑148 (MQ=255) gTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTcaaca < 3:135420/149‑1 (MQ=255) tACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTcaac > 2:58548/1‑147 (MQ=255) acCCGCAACATGGCCACCGGTCCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGAt > 2:92446/1‑149 (MQ=255) cccGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATg < 4:13089/149‑1 (MQ=255) ccGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCAGAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATgg < 4:201953/149‑1 (MQ=255) ccGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGtt > 1:149804/1‑108 (MQ=255) ccGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGtt < 2:149804/108‑1 (MQ=255) ccGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATg > 5:172170/1‑148 (MQ=255) ccGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATg > 5:34191/1‑148 (MQ=255) aaCATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCt < 1:58548/149‑1 (MQ=255) aTGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGaa < 6:172170/149‑1 (MQ=255) ggTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGa < 4:60024/149‑1 (MQ=255) gTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGAt < 6:34191/149‑1 (MQ=255) cGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGATGa < 2:70071/148‑1 (MQ=255) gTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGATGAAg < 1:291255/149‑1 (MQ=255) ccACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGAt > 5:218375/1‑143 (MQ=255) ccACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGAt < 6:218375/143‑1 (MQ=255) ccACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGATGAAGGc > 7:96415/1‑149 (MQ=255) cTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGAc > 2:165328/1‑124 (MQ=255) cTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGAc < 1:165328/124‑1 (MQ=255) tGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAg < 4:129039/129‑1 (MQ=255) tGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAg > 3:129039/1‑129 (MQ=255) gCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGATGAAGGCGTCTTc > 5:62664/1‑149 (MQ=255) cGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGATGAAGGCGTCTTc < 1:33061/148‑1 (MQ=255) cTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGATGAAGGCGTCTTCGAGTc > 6:12531/1‑149 (MQ=255) | GGCCTGCAGGCCGAGCGCGAGCAGGGCATCACCATCGATGTCGCCTACCGCTACTTCTCCACCGCCAAGCGCAAGTTCATCATCGCCGACACCCCGGGCCATGAGCAGTACACCCGCAACATGGCCACCGGTGCGTCCACCTGCGACCTGGCGATCATCCTGGTCGATGCCCGCTACGGCGTGCAGACCCAGACCCGTCGCCACAGCTACATCGCGTCGTTGCTGGGTATCAAGCACATCGTGGTCGCGGTCAACAAGATGGACCTGAAGGGCTTCGATGAAGGCGTCTTCGAGTC > NC_002947/1490578‑1490873 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |