New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5583793 | 57 (1.090) | 5 (0.100) | 4/252 | NT | 8.6% | coding (1939/2259 nt) | parC | DNA topoisomerase IV subunit A |
? | NC_002947 | = 5583844 | 52 (1.050) | coding (1888/2259 nt) | parC | DNA topoisomerase IV subunit A |
TCGGTAACAAATTCTTCACGGCTGGCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCATCCGAAGCCACCACGTACAGCGCATC > NC_002947/5583645‑5583940 | tCGGTAACAAATTCTTCACGGCTGGCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTC > 1:128950‑M1/1‑149 (MQ=255) tAACAAATTCTTCACGGCTGGCCACCCGCTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGa > 6:2633/1‑149 (MQ=255) cAAATTCTTCACGGCTGGCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CGGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCg < 3:207935/149‑1 (MQ=255) cAAATTCTTCACGGCTGGCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCg < 1:22773/149‑1 (MQ=255) cACGGCTGGCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCgg < 2:84450/148‑1 (MQ=255) aCGGCTGGCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCagcttgcccaacggggc > 3:7228‑M1/1‑132 (MQ=255) aCGGCTGGCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGgc > 1:270293/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGgcgc > 2:67309/1‑149 (MQ=255) tGGCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCggg < 7:199666/149‑1 (MQ=255) gCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCACCCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCggg < 1:67309/148‑1 (MQ=255) gCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCgggg < 1:14253/148‑1 (MQ=255) gCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCgggg < 2:272835/148‑1 (MQ=255) gCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCggg < 5:28321/147‑1 (MQ=255) ccACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCgg < 6:191832/139‑1 (MQ=255) ccACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCgg > 5:191832/1‑139 (MQ=255) aCCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCGGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGGGGGCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCAt < 5:65230/149‑1 (MQ=255) tCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACAGGGCGCGGGGTCATGACCtt > 3:23260/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTgg > 8:68857/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTgg > 8:73130/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCACGCCAATGATCTTCTTCCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTCACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTCCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGCCCTAgg > 5:48757/1‑149 (MQ=255) ccGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGcc > 7:165592/1‑149 (MQ=255) ccGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGcc > 1:216972/1‑149 (MQ=255) aCGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGtt < 8:165592/149‑1 (MQ=255) gCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTgg < 5:218976/149‑1 (MQ=255) cAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTggg > 1:304625/1‑148 (MQ=255) cAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGc < 7:68857/149‑1 (MQ=255) cAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGc < 7:73130/149‑1 (MQ=255) aaTGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGc > 7:117198/1‑148 (MQ=255) aTCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGcgcg > 4:222684/1‑118 (MQ=255) aTCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGcgcg < 3:222684/118‑1 (MQ=255) cccTGGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCagcttgcccaacggggccaaggtcatgaccccgcgcccggtggccgatcgcgagcaggac < 8:4489‑M1/149‑61 (MQ=255) ccTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCagcttgcccaacggggccaaggtcatgaccccgcgcccggtggccgatcgcgagcaggact < 4:7228‑M1/149‑62 (MQ=255) ccTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCt > 6:96689/1‑149 (MQ=255) cTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCtt > 1:302989/1‑149 (MQ=255) ccTTTACCCAGCTGTGGCAACTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGc < 8:75732/148‑1 (MQ=255) cTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCg > 5:283777/1‑149 (MQ=255) cTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCg > 1:66483/1‑149 (MQ=255) cccAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCt < 2:304625/148‑1 (MQ=255) cccAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCt < 4:23260/148‑1 (MQ=255) ccAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTg < 5:2633/149‑1 (MQ=255) tgGCAAGTGGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTg < 3:89106/148‑1 (MQ=255) tgGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTgg < 2:216972/149‑1 (MQ=255) ggCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGc > 5:221416/1‑149 (MQ=255) gCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑ACGCCGACAACCAGTCCTGCTCGAGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCATTGTTCTTGGCCTGCAGGt > 8:181209/1‑149 (MQ=255) tGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCggg > 5:73280/1‑80 (MQ=255) tGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCggg < 6:73280/80‑1 (MQ=255) cTTGAACACCAGCAGACGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCagcttgcccaacggggccaaggtcatgaccccgcgcccggtggccgatcgcgagcaggac > 2:187398‑M1/1‑54 (MQ=255) cTTGAACACCAGCAGACGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCagcttgcccaacggggccaaggtcatgaccccgcgcccggtggccgatcgcgagcaggac < 1:187398‑M1/114‑61 (MQ=255) gAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGCTCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCt > 5:223123/1‑149 (MQ=255) aaCACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCtt > 5:122864/1‑149 (MQ=255) acacCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGCCCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCtt > 8:270911/1‑148 (MQ=255) cacCAGCAGGCGGCCTTGTGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCGTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCTAGCTGAGCAGGCGTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTGAGGCTTGa < 6:48757/149‑1 (MQ=255) gcagGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTg < 8:51154/116‑1 (MQ=255) gcagGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTg > 7:51154/1‑116 (MQ=255) cggcCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGcc < 2:66483/149‑1 (MQ=255) cGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAAc < 8:117198/147‑1 (MQ=255) tCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCATcc > 4:103118/1‑149 (MQ=255) cA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGGCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTCACCGGCATcc > 4:92852/1‑148 (MQ=255) ccgccgCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGCAACCGGCATCCGaa < 5:96689/149‑1 (MQ=255) cgccgcCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCATCCGAAg < 2:302989/149‑1 (MQ=255) ccgccAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCATCCGAAGcc > 7:75818/1‑149 (MQ=255) gccAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCATCCGAAGccac > 8:304118/1‑149 (MQ=255) gccAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGCCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCATCCGAAGccac > 6:8345/1‑149 (MQ=255) aGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTgagcaggactggttggcggcggtgaccaccgaaggccgcctgctggtgttcaaggtcagcgacttgccacagctgggtaaaggcaagg < 4:7228‑M2/149‑89 (MQ=255) gTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTgagcaggactggttggcggcggtgaccaccgaaggccgtctgctggtgttcaag > 2:187398‑M2/1‑60 (MQ=255) gTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTgagcaggactggttggcggcggtgaccaccgaaggccgtctgctggtgttcaag < 1:187398‑M2/114‑55 (MQ=255) gTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTgagcaggactggttggcggcggtgaccaccgaaggccgcctgctggtgttcaaggtcagcgacttgccacagctgggtaaaggccaggg < 8:4489‑M2/149‑90 (MQ=255) gTCCTGCTCGCGATCGGCCAACGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCATCCGAAGCCACCACGTa > 7:288885/1‑147 (MQ=255) gCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCa > 2:291905/1‑125 (MQ=255) gCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCa < 1:291905/125‑1 (MQ=255) tCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCATCCGAAGCCACCACGTACAGCGCAtc > 7:214172/1‑149 (MQ=255) | TCGGTAACAAATTCTTCACGGCTGGCCACCCGGTCACCCGGCACGCCAATGATCTTGTTGCCCTTGCCTTTACCCAGCTGTGGCAAGTCGCTGACCTTGAACACCAGCAGGCGGCCTTCGGTGGTCA‑CCGCCGCCAACCAGTCCTGCTCGCGATCGGCCACCGGGCGCGGGGTCATGACCTTGGCCCCGTTGGGCAAGCTGAGCAGGCCTTTGCCGGCCTTGTTCTTGGCCTGCAGGTCTTCACCCTTGACCACGAAGCCGTAACCGGCATCCGAAGCCACCACGTACAGCGCATC > NC_002947/5583645‑5583940 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |