New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6019270 | 43 (0.830) | 3 (0.070) | 3/220 | NT | 6.9% | intergenic (‑71/+74) | dadX/dadA‑II | alanine racemase/D‑amino acid:quinone oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 6019300 | 46 (1.070) | intergenic (‑101/+44) | dadX/dadA‑II | alanine racemase/D‑amino acid:quinone oxidoreductase |
CCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATA > NC_002947/6019126‑6019413 | cccGTCAGTTCACGTGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGt < 8:96606/149‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTACCACAGGTCGt > 8:263246/1‑148 (MQ=255) gTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGca > 5:230136/1‑149 (MQ=255) gTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGGGGTTCGGGGTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGca < 5:55288/149‑1 (MQ=255) ccGGGCCTGTCGGTTGTTGTGGCGCAGGGCCTGGTGGTCGTTCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTTGGGTTGAAATCGGTGGTGTATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCttt < 7:202413/147‑1 (MQ=255) gggCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCaa < 4:106079/149‑1 (MQ=255) gggCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCa > 5:233282/1‑148 (MQ=255) gCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCaa > 5:59287/1‑147 (MQ=255) ccAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAg > 8:69574/1‑149 (MQ=255) cAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGc > 1:237694/1‑149 (MQ=255) aGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGc < 6:22855/148‑1 (MQ=255) aGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGc > 5:22855/1‑148 (MQ=255) aGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCg < 6:299329/149‑1 (MQ=255) aCGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCggt < 7:69574/149‑1 (MQ=255) aCGGTAGTCGTGGCGCAGGGCCTTGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGTACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCggt < 7:182872/149‑1 (MQ=255) cGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCggtg < 6:233282/149‑1 (MQ=255) gTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGtt > 5:98876/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGGCCTGGAGGTCGATGAGGGCGCGG‑CGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTGGCGGGCTTGCGCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtg > 2:18746‑M2/1‑142 (MQ=255) gcgcAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGGTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgt > 3:43991‑M2/1‑143 (MQ=255) gcgcAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTTTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgt > 6:66911‑M2/1‑143 (MQ=255) cgcAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgg > 6:98876‑M2/1‑142 (MQ=255) cAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGaacaccaccgcttttgaaagctgtgcacgacctgtggga < 7:36841‑M1/149‑40 (MQ=255) ggCCTGGAGGTGGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTTAAATCGGTGGTGCATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGaacaggagcgcttttgaatgctgtgcacgacctgtgggagc < 1:164884‑M1/148‑42 (MQ=255) ccTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGaccaccaccgcttttgaaacctgtgcacgacctgtgggagc > 2:164884‑M1/1‑105 (MQ=255) ccTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcggg > 6:59287‑M2/1‑135 (MQ=255) gAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaag < 4:31946‑M2/149‑19 (MQ=255) aGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCaaaa > 4:102193/1‑119 (MQ=255) aGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCaaaa < 3:102193/119‑1 (MQ=255) ggTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgagcaagcc > 2:116022‑M2/1‑129 (MQ=255) ggCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATggg > 4:56500/1‑149 (MQ=255) gcgcGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGc < 6:230136/149‑1 (MQ=255) gcgggACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGca > 4:217105/1‑148 (MQ=255) ggACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGGGGATTTATCGCGGCGTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAgg < 5:244266/149‑1 (MQ=38) aCGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGGGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCt < 3:56500/149‑1 (MQ=255) gCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTActg < 3:217105/149‑1 (MQ=255) gCGGCTGCCTTATGGGGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTActg < 8:295856/149‑1 (MQ=255) gCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGt > 8:85590/1‑148 (MQ=255) ttATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATTGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGc > 7:40447/1‑149 (MQ=255) ttATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGc > 6:318213/1‑149 (MQ=255) tggtggTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTCCACAGCTTTCAAAAGCGTTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCg < 7:263246/148‑1 (MQ=255) ggtggtTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGgc > 4:235560/1‑149 (MQ=255) ggtggtTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGgc > 2:191716/1‑149 (MQ=255) gggTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTg < 3:235560/149‑1 (MQ=255) gTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGcc > 8:35954/1‑149 (MQ=255) aaaTCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTAAAAAGAGGTGGTGTTACTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGATGTTACTGATGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCAGTg > 7:152041/1‑149 (MQ=38) aaTCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGGGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGGGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGc < 5:161799/149‑1 (MQ=255) gtggtgGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTg < 8:72130/147‑1 (MQ=255) gtggtgGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTg > 7:72130/1‑147 (MQ=255) ttattCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTccc > 1:283534/1‑149 (MQ=255) ttattCGCGGGCTTCCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGGGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGGGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTccc < 5:329383/149‑1 (MQ=255) tattCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCg > 3:134982/1‑149 (MQ=255) ggCTTGCTCGCTCCCACAGGaacaccaccgcttttgaaagctgtgcacgacctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacc > 2:116022‑M1/1‑20 (MQ=255) gCTTGCCCGCTCCCACAGGGCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCTCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGcc < 7:85590/149‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCTCCCACAGGaacaccaccgcttttgaaagctgtgcacgacctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacctc < 4:31946‑M1/149‑132 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGaacaccaccgcttttgaaagctgtgcacgacctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacctccagg > 6:59287‑M1/1‑14 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACg > 3:316271/1‑149 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACgg < 5:318213/149‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGTCGTGCACAGGTTTCAAAAGCGGTGGTGGTcctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacctccagg > 2:164884‑M2/1‑41 (MQ=255) gCTCCCACAGGTCGTGCACAGCATTCAAAAGCGCTCCTGTTcctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatgcaccaccgatttaaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatccacctccaggcc < 1:164884‑M2/148‑108 (MQ=255) tCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacctccaggccctg < 7:36841‑M2/149‑111 (MQ=255) ccACAGGaacaccaccgcttttgaaagctgtgcacgacctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacctccaggccctgcg > 6:98876‑M1/1‑7 (MQ=255) cacaGGaacaccaccgcttttgaaagctgtgcacgacctgtgggagcgcgcaagcccgccaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgccgcgccctcatcgacctccaggccctgcgc > 2:18746‑M1/1‑6 (MQ=255) cacaGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGata > 1:78242/1‑149 (MQ=255) acaGGaacaccaccgcttttgaaagctgtgcacgacctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcacccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacctccaggccctgcgc > 3:43991‑M1/1‑5 (MQ=255) acaGGaacaccaccgcttttgaaagctgtgcacgacctgtgggagcgggcaagcccgcgaaaaatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacctccaggccctgcgc > 6:66911‑M1/1‑5 (MQ=255) gTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGata > 1:72617/1‑144 (MQ=255) gTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGata < 2:72617/144‑1 (MQ=255) | CCCGTCAGTTCACGGGCCAGACGGTAGTTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATA > NC_002947/6019126‑6019413 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |