New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 639414 | 49 (0.940) | 5 (0.100) | 4/250 | NT | 9.3% | coding (1331/1929 nt) | PP_0551 | MORN domain‑containing protein |
? | NC_002947 | = 639443 | 51 (1.040) | coding (1302/1929 nt) | PP_0551 | MORN domain‑containing protein |
CTGGCTGCCATGGCTGGTGAGGTAGATGAACACCAGGTCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCCGAGCGAGGTACCCGAACCAGCGCCTC > NC_002947/639299‑639589 | cTGGCTGCCATGGCTGGTGAGGTAGATGAACACCAGGTCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTtggc < 1:311307‑M2/149‑5 (MQ=255) aTGGCTGGTGAGGTAGATGAACACCAGGTCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGgcgc > 4:226461/1‑149 (MQ=255) aGGTAGATGAACACCAGGTCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCa < 1:150825/148‑1 (MQ=255) aGATGAACACCAGGTCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCtt > 3:285540/1‑148 (MQ=255) aTGAACACCAGGTCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAg > 1:18025/1‑149 (MQ=255) aTGAACACCAGGTCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAg < 2:18025/149‑1 (MQ=255) tGAACACCAGGTCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAACGCGCACCTTGAg > 8:273253/1‑148 (MQ=255) cacCAGGTCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGc < 7:299652/149‑1 (MQ=255) tCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGAc < 5:249349/149‑1 (MQ=255) tGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGAGGGAGTCGGCTTcg > 5:235475/1‑149 (MQ=255) cgcTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTcgc < 2:110716/148‑1 (MQ=255) tctGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAg > 4:164018/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAGGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGaa > 5:237112/1‑148 (MQ=255) cAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATa < 3:226461/149‑1 (MQ=255) aGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATAc > 8:247445/1‑149 (MQ=255) gggTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTCTGCGGGTGGCCTTGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAACGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCTGGAATAc > 1:20240/1‑149 (MQ=255) ggcAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCt > 6:309496/1‑149 (MQ=255) ggcAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCt > 8:255193/1‑149 (MQ=255) gcAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTg < 2:311307/149‑1 (MQ=255) gcAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTg < 6:136456/149‑1 (MQ=255) gcAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTg < 8:147252/149‑1 (MQ=255) gaGCGCGGGAGATGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTgg < 6:223905/148‑1 (MQ=255) cAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTgg < 4:285540/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGcc < 3:292974/149‑1 (MQ=255) cgGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAg > 3:48671/1‑149 (MQ=255) gCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCtata > 7:206654/1‑149 (MQ=255) gCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCtata > 8:58143/1‑149 (MQ=255) ccATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCtata > 2:66335/1‑148 (MQ=255) ccATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCtata > 5:164482/1‑148 (MQ=255) cATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTg < 6:183906/120‑1 (MQ=255) cATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTg > 5:183906/1‑120 (MQ=255) ggACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCt < 7:58143/148‑1 (MQ=255) ggACGCCTGGCCATGTGGTAGCGGTGGTTGACCAGGGTCAATTGGCCACGGGCGCCAAACCCCCCCATGAGCATGCGGCTGACGAATTCGGCATACCGCCCGAATACGGTTTTCTGGCCCTCGCCGGCCCATACCAACCGAAACAGCTg > 2:324573/1‑149 (MQ=255) gcgTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTtggccacgcgtcccatggccacccgcgaaaacctctcccgcgctgccgccaccctggcagagcgcagcggccccgaagacctggtgttaatctacctcaccagccatggca < 5:28799‑M2/149‑112 (MQ=255) gcgTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATc < 1:66335/149‑1 (MQ=255) gcgTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATc > 4:233801/1‑149 (MQ=255) gcgTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATc > 1:186793/1‑149 (MQ=255) gTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTtggccacgcgtcccatggccacccgcgaaaacctctcccgcgctgccgccaccctggcagagcgcagcggccccgaagacctggtgttcatctacctcacca > 1:33637‑M2/1‑36 (MQ=255) gTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTtggccacgcgtcccatggccacccgcgaaaacctctcccgcgctgccgccaccctggcagagcgcagcggccccgaagacctggtgttcatctacctcacca < 2:33637‑M2/138‑103 (MQ=255) gTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTtggccacgcgtcccatggccacccgcgaaaacctctcccgcgctgccgccaccctggcagagcgcagcggccccgaagacctggtgttcatctacctcac > 5:68279‑M2/1‑36 (MQ=255) gTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTtggccacgcgtcccatggccacccgcgaaaacctctcccgcgctgccgccaccctggcagagcgcagcggccccgaagacctggtgttcatctacctcac < 6:68279‑M2/136‑101 (MQ=255) gTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCGCCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCgg > 5:226695/1‑149 (MQ=255) gTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCgg > 5:159422/1‑149 (MQ=255) ccATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGgc > 5:122221/1‑149 (MQ=255) cATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAGGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGgcg < 6:237112/149‑1 (MQ=255) tgtgGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGcc < 7:247445/149‑1 (MQ=255) gTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCcgagc > 8:246854/1‑149 (MQ=255) cgcgGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCcgagcga < 5:309496/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGGTCGGTGGCGCcgagcgag < 2:84828/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCcgagcgg < 3:233801/148‑2 (MQ=255) gcgGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCcgagcgag < 2:92099/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCcgagcgag < 7:246854/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCcgagcgag < 7:255193/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCcgagcgag < 6:122221/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCcgagcgag < 4:293181/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCcgagcga < 2:186793/148‑1 (MQ=255) tggtTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCCGAGCGAGGTAc < 4:48671/149‑1 (MQ=255) gACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCCGAGCGAGGTACCCGaa > 7:9028/1‑149 (MQ=255) aCTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCCGAGCGAGGTACCCGAACCAGCGCCTc > 2:299496/1‑149 (MQ=255) | CTGGCTGCCATGGCTGGTGAGGTAGATGAACACCAGGTCTTCGGGGCCGCTGCGCTCTGCCAGGGTGGCGGCAGCGCGGGAGAGGTTTTC‑GCGGGTGGCCATGGGACGCGTGGCCATGTGGTCGCGGTGGTTGACCAGGGTCACTTGGCCACGGGCGCCAAAGCGCACCTTGAGCATGCGGCTGACGTAGTCGGCTTCGCGCAGGAATACGCTTTGCTGGCCATCGCCGGCCACTACCAGGCTATACAGCTGGATCGGTGGCGCCGAGCGAGGTACCCGAACCAGCGCCTC > NC_002947/639299‑639589 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |