New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1160522 = | 31 (0.600) | 3 (0.060) | 3/258 | NT | 7.6% | coding (334/846 nt) | gtsC | mannose/glucose ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 1160576 = | 43 (0.850) | coding (388/846 nt) | gtsC | mannose/glucose ABC transporter permease |
ACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGG > NC_002947/1160429‑1160719 | aCCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTc > 6:289847/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCg > 5:35031/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCg < 2:192168/149‑1 (MQ=255) gcgGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCAcc > 1:321131/1‑147 (MQ=255) gcgGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCAcc < 2:321131/147‑1 (MQ=255) gATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGACGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGACGTTCCAGACCGTGCTCCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGc > 5:231771/1‑149 (MQ=255) gcgATTGGTGCAGTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTGCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTtgg‑cctggc < 1:99271/149‑1 (MQ=255) gCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCAc > 2:75870/1‑149 (MQ=255) aCTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACtg > 7:185790/1‑149 (MQ=255) cagcaccaggccaccagtggtactggccaggccaagcttgccgagggtgaacgaGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTc < 8:102423‑M1/60‑1 (MQ=255) cagcaccaggccaccagtggtactggccaggccaagcttgccgagggtgaacgaGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTc > 7:102423‑M1/55‑114 (MQ=255) atcGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTACGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGTCGGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACtggtg < 6:231771/146‑1 (MQ=255) ggCTTTGTGCTGTCGATGTGGGGGTTCCGTGGTTCGGAACTGTTCTTCTGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGTCCGTGGTGCTGCCGGCCTCGTTCTCCCTCTGCTTGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCAGTGGTGGCct < 4:112940/149‑1 (MQ=255) tgCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtgctg > 4:316748/1‑149 (MQ=255) tGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtgctggtg > 4:137487/1‑149 (MQ=255) tgtgGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAtgtg < 8:185790/149‑1 (MQ=255) tgGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGt < 5:294828/149‑1 (MQ=255) gAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggcctg < 3:137487/149‑1 (MQ=255) ttCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggcctggcct > 3:4052/1‑149 (MQ=255) gCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCAACCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTc > 6:195295/1‑148 (MQ=255) gCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCAACCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTc < 5:195295/148‑1 (MQ=255) cAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTcac < 3:316748/149‑1 (MQ=255) ttcttcGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACg < 5:323711/147‑1 (MQ=255) gaacgaggccggcagcagcacggtctggaacggcaggaaacagccgaacagcagcaggccTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtgctg > 7:102423‑M2/61‑114 (MQ=255) gaacgaggccggcagcagcacggtctggaacggcaggaaacagccgaacagcagcaggccTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtgctg < 8:102423‑M2/54‑1 (MQ=255) tcttcGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTg > 5:327698/1‑149 (MQ=255) ggccggcagcagcacggtctggaacggcaggaaacagccgaacagcagcaggccTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGttctt > 4:136687‑M2/55‑149 (MQ=255) ttCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGc < 4:161286/130‑1 (MQ=255) ttCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGc > 3:161286/1‑130 (MQ=255) ttCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTa > 6:80419/1‑149 (MQ=255) tCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTAc > 6:298535/1‑149 (MQ=255) ggCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGt > 2:198292/1‑149 (MQ=255) ggCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGt > 8:178211/1‑149 (MQ=255) tGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTAc < 6:226419/144‑1 (MQ=255) tGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTAc > 5:226419/1‑144 (MQ=255) tGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAg > 2:14186/1‑149 (MQ=255) tGTTTCCTGACGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAg > 4:267838/1‑149 (MQ=255) gTTTCCTGCCTTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGGAGCTGGCCAGTACCACTGGTGGCATGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGt > 1:257298/1‑146 (MQ=255) tCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCAt < 3:85200/148‑1 (MQ=255) cTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGGTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATccc > 6:90216/1‑149 (MQ=255) cTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATccc < 5:80419/149‑1 (MQ=255) cTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATccc < 2:95409/149‑1 (MQ=255) cTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATccc > 1:95409/1‑149 (MQ=255) cTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATccc > 8:252156/1‑149 (MQ=255) gCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATcccc > 5:233523/1‑148 (MQ=255) cGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGAc < 7:178211/149‑1 (MQ=255) cGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGAc < 1:198292/149‑1 (MQ=255) cAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCt > 3:12643/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCtt > 4:131026/1‑96 (MQ=255) cGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCtt < 3:131026/96‑1 (MQ=255) tgctgcCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGcc > 6:63022/1‑149 (MQ=255) ctgcCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGcc < 4:4052/147‑1 (MQ=255) cGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCgg < 5:298535/149‑1 (MQ=255) | ACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGG‑CCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGG > NC_002947/1160429‑1160719 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |