| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 11,656 | C→T | 7.4% | P185L (CCG→CTG) ‡ | dnaN → | DNA polymerase III subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 11,656 | 0 | C | T | 7.4% | 193.8 / 3.7 | 67 | P185L (CCG→CTG) ‡ | dnaN | DNA polymerase III subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/29); new base T (3/2); total (36/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.32e-01 | |||||||||||
GCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACC > NC_002947/11512‑11804 | gccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATc > 8:191930/1‑149 (MQ=255) cTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGa < 4:258635/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAg > 1:214206/1‑147 (MQ=255) aGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCaggag < 5:204240/149‑1 (MQ=255) aGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCaggag > 7:62268/1‑149 (MQ=255) gAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGa > 2:211938/1‑139 (MQ=255) gAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGa < 1:211938/139‑1 (MQ=255) aaCCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATc > 1:46009/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCATGGCCGAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCTA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACTGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGacac < 8:62268/148‑1 (MQ=255) ttCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGacac > 3:10821/1‑147 (MQ=255) cATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCa > 3:144709/1‑149 (MQ=255) ggCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCg > 5:145019/1‑149 (MQ=255) cccAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTg < 5:62863/149‑1 (MQ=255) cccAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTg < 5:58245/149‑1 (MQ=255) gATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTa > 8:225058/1‑148 (MQ=255) tgtgCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCCGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAg < 5:87280/149‑1 (MQ=255) gcgcTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGt > 2:279038/1‑148 (MQ=255) ggaaaCCTCAAGCAGCATGCCG‑TTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCt > 8:161158/5‑149 (MQ=255) ttACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTg > 4:256719/1‑148 (MQ=255) ttACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTg > 2:222977/1‑148 (MQ=255) tCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCTACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTg > 6:208884/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCct > 1:156693/1‑149 (MQ=255) ctgctTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCctgct < 2:156693/149‑1 (MQ=255) ctgctTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATACTGGAGTTGG‑CGCGCctgct > 6:239983/1‑149 (MQ=255) gctTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCACCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGa > 1:80018/1‑149 (MQ=255) ctTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGAc < 4:144709/149‑1 (MQ=255) gAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGa > 8:191266/1‑149 (MQ=255) tttCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGg‑cgcgc < 2:85947/134‑1 (MQ=255) tttCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGg‑cgcgc > 1:85947/1‑134 (MQ=255) ccGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCctg < 7:168035/133‑1 (MQ=255) ccGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCctg > 8:168035/1‑133 (MQ=255) cGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAg > 3:14197/1‑109 (MQ=255) cGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAg < 4:14197/109‑1 (MQ=255) acacGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATg < 5:208884/149‑1 (MQ=255) cacGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATgg > 1:156746/1‑149 (MQ=255) ttGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAg < 4:48017/149‑1 (MQ=255) cgcTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATc < 1:222977/149‑1 (MQ=255) gcTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGt < 2:214206/149‑1 (MQ=255) tCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTggg > 1:201837/1‑149 (MQ=255) ccACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGc > 3:3981/1‑149 (MQ=255) cACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGc < 6:145019/148‑1 (MQ=255) aCCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGc > 2:177065/1‑147 (MQ=255) aCCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGc > 2:49289/1‑147 (MQ=255) ctaCGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGc < 7:191930/147‑1 (MQ=255) aCGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCAt < 1:279038/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCCGCATCACATcc > 6:304576/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATcc > 3:307082/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgc < 4:10821/149‑1 (MQ=255) tGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCgcgc > 3:88839/1‑148 (MQ=255) ggCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGc < 2:296124/130‑1 (MQ=255) ggCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGc > 1:296124/1‑130 (MQ=255) gcgcTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCgcgc < 4:88839/146‑1 (MQ=255) gcgcTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCac > 3:302986/1‑149 (MQ=255) ctGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTTGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTg > 2:95553/2‑149 (MQ=255) ctGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTg > 6:182793/2‑149 (MQ=255) tGCTCGATGCGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGACGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTg < 1:49289/148‑1 (MQ=255) tGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTg < 7:191266/148‑1 (MQ=255) cTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGt < 7:225058/148‑1 (MQ=255) cTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGcc < 7:117406/122‑1 (MQ=255) cTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGcc > 8:117406/1‑122 (MQ=255) gATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGa < 4:255218/147‑1 (MQ=255) gAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAg > 4:231423/1‑118 (MQ=255) gAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAg < 3:231423/118‑1 (MQ=255) ggcgcgcTCATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTTGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCAc < 1:95553/148‑1 (MQ=255) aGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCAc < 4:3981/149‑1 (MQ=255) gcgcCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCtt < 3:118020/149‑1 (MQ=255) cgcCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCtt > 6:64084/1‑148 (MQ=255) ccGATCGCGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTAc < 5:64084/149‑1 (MQ=255) ccGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTAc < 2:156746/149‑1 (MQ=255) cGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTAcc > 1:7971/1‑149 (MQ=255) cGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTAcc < 2:7971/149‑1 (MQ=255) | GCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGG‑CGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACC > NC_002947/11512‑11804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |