| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,358,671 | C→A | 7.0% | P30P (CCG→CCT) | infB ← | translation initiation factor IF‑2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,358,671 | 0 | C | A | 7.0% | 223.3 / 5.2 | 71 | P30P (CCG→CCT) | infB | translation initiation factor IF‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/26); new base A (2/3); total (41/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
GCTACCGGCGACACGCAGGGTGCTGGTGGTTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGA > NC_002947/5358524‑5358819 | gCTACCGGCGACACGCAGGGTGCTGGTGGTTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGGTCTTGCGCGTTGCTCTTGTGGCTGGTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGc < 7:71586/148‑1 (MQ=255) tACCGGCGACACGCAGGGTGCTGGTGGTTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCgg > 6:164764/1‑148 (MQ=255) aCCGGCGACACGCAGGGTGCTGGTGGTTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGAgg > 7:172000/1‑147 (MQ=255) ccGGCGACACGCAGGGTGCTGGTGGTTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGCGTGAGGCAg > 7:43588/1‑149 (MQ=255) gCAGGGTGCTGGTGGTTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCa > 7:5696/1‑149 (MQ=255) gggTGCTGGTGGTTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGAGGCAGGTCTGCCGCAcac < 4:274588/149‑3 (MQ=255) tGCTGGTGGTTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGCGTGAGGCAGGTCTGCCGCAcaccga < 8:43588/149‑6 (MQ=255) cTGGTGGTTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGAGGCAGGTCTGCCGCAcaccgacg < 8:172000/149‑8 (MQ=255) gtggtTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCTGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATctgctg > 4:243291/1‑149 (MQ=255) gtggtTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATctgctg < 8:62617/149‑1 (MQ=255) gtggtTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATctgctg > 3:222414/1‑149 (MQ=255) gtggtTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATctgc < 1:307766/147‑1 (MQ=255) gtggtTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTCGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATctgct < 2:46337/148‑1 (MQ=255) tggtTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCtgctgc < 5:164764/149‑1 (MQ=255) gtTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTgcag > 7:132193/1‑149 (MQ=255) gtTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTgca < 8:238522/148‑1 (MQ=255) tGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGcagcag < 8:132193/148‑1 (MQ=255) gcTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGgcgc > 3:183836/1‑149 (MQ=255) tGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCTGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGctc > 1:9868/1‑149 (MQ=255) ggTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCg > 5:52676/1‑149 (MQ=255) ggTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCg > 3:70945/1‑149 (MQ=255) gTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCgg > 6:298871/1‑149 (MQ=255) aTCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGTTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGc < 5:306681/149‑1 (MQ=255) aTCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGc < 4:222414/149‑1 (MQ=255) tCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGcc > 8:24844/1‑149 (MQ=255) gcgcGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGcc < 4:183836/145‑1 (MQ=255) cgcgGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGAc < 7:24844/149‑1 (MQ=255) gcgGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACTGATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGAcc > 5:310481/1‑149 (MQ=255) gcgGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGGATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGAcc > 5:305879/1‑149 (MQ=255) ggCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCAt < 3:150453/113‑1 (MQ=255) ggCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCAt > 4:150453/1‑113 (MQ=255) ctctTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCtt < 7:281096/149‑1 (MQ=255) ctTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGCTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACAGGt > 8:263199/1‑134 (MQ=255) ttCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTg < 4:219460/147‑1 (MQ=255) ccTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGCCCTCTTGGGCCAGt > 6:85950/1‑149 (MQ=255) ctctTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCtt < 6:52676/148‑1 (MQ=255) tctTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCttt > 8:78455/1‑148 (MQ=255) gtgGCTGCTTTTCAAATGAGGCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCAc < 7:61514/147‑1 (MQ=255) gctgctTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGa < 4:70945/149‑1 (MQ=255) gctgatTTTCAAATGAGTCAGAAAGGTCTTATTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGACGGTGTGCGGCAGACCTGCCTAACGCATCTGCTGAAGCAGGCCCTCTACCCGAGCCTCGACCACTTGGGCCAGTTCTTTCACCGtt > 4:173988/1‑147 (MQ=255) aaaTGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCAt > 5:331283/1‑149 (MQ=255) aaTGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATg > 8:198972/1‑149 (MQ=255) aTGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACtt > 2:153870/1‑140 (MQ=255) aTGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACtt < 1:153870/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATTCACTtc > 6:25218/1‑149 (MQ=255) aGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTtct < 2:9868/148‑1 (MQ=255) gCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGCCCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTtctct > 1:167811/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTtctctc > 4:212656/1‑149 (MQ=255) tCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCCCCGTGACTTGCGTCATGCACTTCGATCCTCAg > 6:230398/1‑149 (MQ=255) cTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCcg > 6:147312/1‑149 (MQ=255) ctcATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCcgcg < 8:5696/148‑1 (MQ=255) ctcATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCgcgc > 7:137785/1‑149 (MQ=255) ctcATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCgcgc > 1:203711/1‑149 (MQ=255) tcATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGcc > 1:41248/1‑149 (MQ=255) aTTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGTCCGCGccg > 6:190457/1‑147 (MQ=255) gTCGGTCTCTACCTGTCCGGCGTCGGTGTGGGGGAGACCTGCCTCACGCATGTGGTGCAGCTGGCGCTGTACCGTTGGGTGGACCTCTTGGGCCTGTTCTTTCTCCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTGCTCAGGCCGCGCCTAAt < 5:230398/148‑1 (MQ=255) ggTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACt > 4:102461/1‑149 (MQ=255) tCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTc > 2:260954/1‑148 (MQ=255) aCTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGaa > 2:99545/1‑149 (MQ=255) aCTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGaa < 6:331283/149‑1 (MQ=255) tGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTg > 8:81742/1‑149 (MQ=255) tGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTg > 6:215917/1‑149 (MQ=255) gcaggCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTCGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTggg > 2:43524/4‑149 (MQ=255) aCCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTg < 5:147312/147‑1 (MQ=255) cGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCt > 3:311099/1‑149 (MQ=255) ggCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGGCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACGGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTc < 3:173988/149‑1 (MQ=255) gCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTc > 4:102849/1‑148 (MQ=255) gCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTc < 3:102849/148‑1 (MQ=255) gTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGgcg < 4:72870/45‑1 (MQ=255) gTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGgcg > 3:72870/1‑45 (MQ=255) gTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCggg < 2:203711/149‑1 (MQ=255) cGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGggcg < 5:215917/149‑1 (MQ=255) cGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGa < 5:211405/149‑1 (MQ=255) | GCTACCGGCGACACGCAGGGTGCTGGTGGTTTTGCGCTGCAAGGTAATCTTGCGCGGCTCTTCCGCCTTGCTCTTGTGGCTGCTTTTCAAATGAGTCAGCAAGGTCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGCAGGCGCTCTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGA > NC_002947/5358524‑5358819 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |