| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,667,258 | G→T | 8.0% | intergenic (+36/+35) | nhaP → / ← PP_4975 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/acyl‑CoA thioesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,667,258 | 0 | G | T | 8.0% | 221.1 / 2.9 | 72 | intergenic (+36/+35) | nhaP/PP_4975 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/acyl‑CoA thioesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/29); new base T (2/4); total (39/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGACAG > NC_002947/5667112‑5667405 | gAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTgca > 6:46381/1‑147 (MQ=255) aGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAAc > 8:162444/1‑149 (MQ=255) gAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTCAccc > 6:139115/1‑149 (MQ=255) gAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTCAccc > 4:187670/1‑149 (MQ=255) cGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCcgc > 1:30402/1‑148 (MQ=255) cGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCcgc > 3:45363/1‑148 (MQ=255) ggACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTTGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTCACCCGCGaa < 3:187670/149‑1 (MQ=255) ggACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTCACCCGCGaa < 5:139115/149‑1 (MQ=255) gACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCcgcg > 7:289343/1‑146 (MQ=255) ccTGCTTCTGGCGATCCCCGACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTCACCCGCGaatgg < 8:108546/149‑4 (MQ=255) ctgctgTCTATCTCCTAGAGCTGGGTGTTGGCGGCGTTGCTGGTGCAGGGGGTGAGCCTTGGGCGGGGGGTGCTCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGTGCCTCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTCACCCGCGaatgggc < 8:245604/147‑6 (MQ=255) ctgctgTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGc < 5:46381/147‑1 (MQ=255) ctgctgTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCg < 8:289343/149‑1 (MQ=255) tCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGcaca < 7:80556/148‑1 (MQ=255) aCCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AAc < 7:162444/148‑1 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAg > 1:324720/1‑149 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGAGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCAGCGAAGATGCCGGCACAGGC‑AACCAg > 1:206999/1‑149 (MQ=255) aTCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTc > 1:267576/1‑149 (MQ=255) tggtgTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGt > 5:311007/1‑144 (MQ=255) tggtgTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGt < 6:311007/144‑1 (MQ=255) gATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATc > 4:278381/1‑149 (MQ=255) ttCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCg < 2:267576/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCgg < 3:190705/148‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCgg < 5:54832/148‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCggg > 7:127663/1‑148 (MQ=255) ggTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGaa > 2:260724/1‑149 (MQ=255) gTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCg < 2:317392/144‑1 (MQ=255) gTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCg > 1:317392/1‑144 (MQ=255) ggggTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGCACTGGTc > 3:174856/1‑149 (MQ=255) gggTTGTGGATTGGGGGGGTGGTGCGCAAGGTCTGGGCCCTGCCTTGAGAATGCCGGGGCGGCTTTGGGGCCCATTCGGGGGTGAACCCGGGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATGCgg < 2:238790/139‑1 (MQ=255) gggTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTcc > 8:77874/1‑149 (MQ=255) gggTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCATGAGAATGCCGGCGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGACTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCgg > 1:238790/1‑139 (MQ=255) gTTGAGCATTGAGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTg > 4:150461/1‑149 (MQ=255) ttGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCAAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTg > 1:53231/1‑148 (MQ=255) cATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGaa < 2:108370/134‑1 (MQ=255) cATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTa > 3:58057/1‑149 (MQ=255) cATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGAGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGaa > 1:108370/1‑134 (MQ=255) aTTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCt < 1:171801/141‑1 (MQ=255) aTTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCt > 2:171801/1‑141 (MQ=255) aTTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCAATTCGCGGGTGAACACGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTAc > 7:203967/1‑149 (MQ=255) gCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGa > 8:55746/1‑148 (MQ=255) cGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGAtc < 4:45363/149‑1 (MQ=255) gcAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGcc > 6:69478/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATg > 8:45667/1‑149 (MQ=255) aGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGGCGGCACAGGC‑AACCAGGGTGTGTTGG‑‑‑AGTGCGGAAGCCGGGCACTGGTCCTGCCGGGTGTTGAGGGCGGGGCGCGCATGGGCt > 6:257256/1‑149 (MQ=25) gcgcCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCATTCGCGGGGGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTg < 8:203967/149‑1 (MQ=255) gCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCaa < 3:49586/149‑1 (MQ=255) cTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGc > 5:179394/1‑149 (MQ=255) cTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGC‑AACCACGGTCTATTCG‑‑‑AATGCCCAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTAATTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGCCAAGc > 8:269796/1‑149 (MQ=39) gtgaATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCGCTCTCTGCCGAATCCGGGAACTTGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAg < 1:260724/146‑1 (MQ=38) gaATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATcc < 5:69478/149‑1 (MQ=255) gaatgggCCGCAAAGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGc > 3:91732/5‑149 (MQ=255) ccGGGGCCGGTTGGCGGCCCATGCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGc < 2:324720/148‑1 (MQ=255) cGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGccc < 3:278381/149‑1 (MQ=255) cGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGccc > 8:206504/1‑149 (MQ=255) gCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGa > 2:162899/1‑149 (MQ=255) tttGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGtggcc > 4:235494/1‑144 (MQ=255) cGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAaca < 7:77874/149‑1 (MQ=255) cGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAaca < 3:150461/149‑1 (MQ=255) cGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAac < 7:206504/148‑1 (MQ=255) cGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAac < 4:58057/148‑1 (MQ=255) ggCCCATTTGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAacac > 8:265200/1‑149 (MQ=255) ccATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCAt < 7:55746/149‑1 (MQ=255) cATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATc > 6:139685/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGTGATCCCGCGTAGAGGCCTGCACAGTC‑AACCAGGGTCTTTTCG‑‑‑ACTGACGAATCGGGGAACTGGTCCTTCACTTACTTGATCTCGGTGCGCACATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCAAGGTTGACGAACACCATCtt < 7:269796/149‑1 (MQ=255) gggTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCGAACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTc > 1:29002/1‑148 (MQ=255) gTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCgg < 7:42578/58‑1 (MQ=255) gTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCgg < 7:37572/58‑1 (MQ=255) gTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCgg > 8:37572/1‑58 (MQ=255) gTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCgg > 8:42578/1‑58 (MQ=255) gTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCg > 8:250044/1‑119 (MQ=255) gTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCg < 7:250044/119‑1 (MQ=255) tGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGACAg < 7:265200/149‑1 (MQ=255) | GAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGC‑AACCAGGGTCTATTCG‑‑‑ACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGACAG > NC_002947/5667112‑5667405 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |