Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,793,873 | T→G | 7.1% | T1343P (ACT→CCT) | gltB ← | L‑glutamate synthase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,793,873 | 0 | T | G | 7.1% | 214.8 / 7.0 | 70 | T1343P (ACT→CCT) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/31); new base G (2/3); total (36/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 |
CCGCCAGTCATGCCAGAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGG > NC_002947/5793725‑5794019 | ccgccAGTCATGCCAGAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGt > 4:275057/1‑149 (MQ=255) gTCATGCCAGAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGc < 2:52106/149‑1 (MQ=255) gTCATGCCAGAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGc > 1:52106/1‑149 (MQ=255) ccAGAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCATAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGGTACTGCgggcga < 8:212158/149‑5 (MQ=255) ccAGAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCaaa < 6:255199/149‑1 (MQ=255) gAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCAGGTCATGTATTCACAGAAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATTGGCGCCGGAGTTACGTACATCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAg > 1:54735/1‑149 (MQ=255) cGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCGCCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCtt < 1:29882/149‑1 (MQ=255) cGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTg > 2:249552/1‑149 (MQ=255) gAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTgc > 3:288874/1‑149 (MQ=255) gAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGGTACTGCgggcga > 3:177227/1‑137 (MQ=255) gAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGGTACTGCgggcga < 4:177227/141‑5 (MQ=255) gTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAGCTGTTTgccgcag < 8:5516/148‑3 (MQ=255) gTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCa < 1:249552/148‑1 (MQ=255) tAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAg < 2:152270/148‑1 (MQ=255) tAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAg < 1:223798/148‑1 (MQ=255) aCCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTgg < 6:219620/149‑1 (MQ=255) aCCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTgg > 3:199635/1‑149 (MQ=255) cGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCACTGGCa > 4:107982/1‑149 (MQ=255) ccAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTAcagg < 8:265706/149‑1 (MQ=255) cAGAACGCAGACAAAGCCGCCGTTCATGTATTCACAGGAGTTATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGGATCGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTAcagg < 3:187529/148‑1 (MQ=255) aCGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGGTACTGCgggcgag < 6:98185/117‑6 (MQ=255) aCGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGGTACTGCgggcgag > 5:98185/1‑112 (MQ=255) gCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGgtgt > 4:135198/1‑149 (MQ=255) cAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGACAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCTCAGTAACTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACATGCAGGTGtt < 6:75390/149‑1 (MQ=255) ccgccgGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGAt > 4:84304/1‑149 (MQ=255) gccgGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATgg > 4:283952/1‑149 (MQ=255) ggTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGgcgc > 2:195870/1‑149 (MQ=255) tGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGc < 1:195870/149‑1 (MQ=255) acaGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGtt > 5:183858/1‑123 (MQ=255) acaGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGtt < 6:183858/123‑1 (MQ=255) acaGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGAATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCAGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGttt > 5:229389/1‑149 (MQ=255) cagTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAg > 8:102805/1‑86 (MQ=255) cagTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAg < 7:102805/86‑1 (MQ=255) gTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACg < 1:142911/149‑1 (MQ=255) gATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTgc > 5:72767/1‑87 (MQ=255) gATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTgc < 6:72767/87‑1 (MQ=255) aTCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACggg < 7:284703/148‑1 (MQ=255) aTCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGc > 3:244498/1‑149 (MQ=255) ccAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGcc > 2:200923/1‑149 (MQ=255) tGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCt < 3:107982/149‑1 (MQ=255) ccTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAATCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTggc > 7:71953/1‑149 (MQ=255) ccTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTggc > 2:273952/1‑149 (MQ=255) tCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCt < 4:30955/116‑1 (MQ=255) tCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCt > 3:30955/1‑116 (MQ=255) tCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTggcgg > 5:13360/1‑149 (MQ=255) aacaGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACggg < 5:96238/130‑1 (MQ=255) aacaGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACggg > 6:96238/1‑130 (MQ=255) caGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATg < 1:273952/149‑1 (MQ=255) caGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATg < 3:135198/149‑1 (MQ=255) gTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCgg < 3:283952/149‑1 (MQ=255) aCGAACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTAACTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGCCAGATGTTGACGACGATGGCGCTGAGCTAGGTTTCGAACGCGCTGCCGGCAGGCGGCACGAAGGTGACCTTGCCACCGCTCa > 6:308325/1‑149 (MQ=255) cGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCAt < 4:199635/149‑1 (MQ=255) aCAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTg < 6:237961/129‑1 (MQ=255) aCAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTg > 5:237961/1‑129 (MQ=255) cAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCt > 4:290196/1‑149 (MQ=255) cAGCGAAGAG‑AGCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCGTGCAGACAGTGTAACCTTACAGGAAGGTTTTGCCTACTATGGCGCTGTGCTGTGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGAACTTGCCACCTGTCATGcc < 2:54735/148‑1 (MQ=255) aGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCtt > 3:294594/1‑149 (MQ=255) aGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCtt > 1:146311/1‑149 (MQ=255) aGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCtt > 2:325538/1‑149 (MQ=255) gCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCttt > 5:103021/1‑149 (MQ=255) gCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCttt > 1:229118/1‑149 (MQ=255) gAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGc < 6:103021/149‑1 (MQ=255) g‑cTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGc > 7:155998/1‑138 (MQ=255) g‑cTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGc < 8:155998/138‑1 (MQ=255) g‑cTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACg > 6:272658/1‑149 (MQ=255) cTCGCACGCACTACCTGCGCGAAACACCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGGAGCTCTTCCCGCCGCTGCCGCTGTGCTGGCTTTCGCAAGGGCTGACTGCTCCCCCCACGATGGTGGCATTGCCACCGGTAATGCCTTTGCCGACg > 2:310691/1‑148 (MQ=255) tCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGt > 5:64048/1‑148 (MQ=255) cAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTg < 1:200923/149‑1 (MQ=255) aGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTgg < 1:270396/149‑1 (MQ=255) aGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTg > 4:49951/1‑148 (MQ=255) aGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTg < 3:49951/148‑1 (MQ=255) | CCGCCAGTCATGCCAGAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTTACGTACAGCGAAGCG‑CTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGG > NC_002947/5793725‑5794019 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |