| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,862,153 | G→C | 7.0% | N212K (AAC→AAG) | fbpC ← | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,862,153 | 0 | G | C | 7.0% | 175.3 / 4.7 | 57 | N212K (AAC→AAG) | fbpC | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/25); new base C (2/2); total (30/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.78e-01 | |||||||||||
GCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCGTCCAGCGCCGACATCGG > NC_002947/5862005‑5862299 | gcATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCgttg < 2:201172/149‑1 (MQ=255) aTGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCgttgtt < 5:261405/149‑1 (MQ=255) tCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACcg < 6:23523/148‑1 (MQ=255) gCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGa > 3:56167/1‑149 (MQ=255) ccGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGAt > 1:231239/1‑149 (MQ=255) cGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATg < 2:98697/149‑1 (MQ=255) cGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATg < 6:181295/149‑1 (MQ=255) cAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATg < 1:286358/145‑1 (MQ=255) cAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATg > 2:286358/1‑145 (MQ=255) ggCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCgg > 8:249534/1‑149 (MQ=255) ggCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCAt > 2:82852/1‑148 (MQ=255) gCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATc > 7:43869/1‑148 (MQ=255) gctgctGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATg < 2:231239/148‑1 (MQ=255) ctgctgCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGc > 8:291725/1‑149 (MQ=255) ctgcGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTc > 3:200235/1‑149 (MQ=255) tgcGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCg > 6:160729/1‑149 (MQ=255) gcTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATc < 6:69214/134‑1 (MQ=255) gcTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATc > 5:69214/1‑134 (MQ=255) gAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGTACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGt > 1:181272/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTtgt < 1:82852/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTtgtg > 5:56736/1‑149 (MQ=255) aGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGt < 7:249534/149‑1 (MQ=255) cAGTTGGCCTGGGCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGTCGCTCCCCCTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTgg < 1:272330/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGATGGTTACCCACAAcc < 4:56167/149‑2 (MQ=255) gCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACgtgg < 2:229655/149‑1 (MQ=255) gCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGATGGTTACCCACAAccag < 1:144820/148‑4 (MQ=255) gacgaACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCt > 3:292587/1‑116 (MQ=255) gacgaACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCt < 4:292587/116‑1 (MQ=255) aCTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGcc > 7:23633/1‑148 (MQ=255) cGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGgcgc < 5:160729/149‑1 (MQ=255) gAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCt > 3:163087/1‑149 (MQ=255) aaCGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCa > 3:197522/1‑139 (MQ=255) aaCGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCa < 4:197522/139‑1 (MQ=255) cGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCATCGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCa < 1:10021/149‑1 (MQ=255) gCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGc < 8:73935/149‑1 (MQ=255) gg‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGCCCTGGCCGTTGTTCAACCCCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGAc < 8:285064/149‑1 (MQ=255) aTAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGAc < 2:70016/137‑1 (MQ=255) aTAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGAc > 1:70016/1‑137 (MQ=255) aTAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTg < 4:200235/148‑1 (MQ=255) aTAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTg > 1:191683/1‑148 (MQ=255) aTAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGATCGACCGGGCCGTTGGTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGGTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTg > 4:214194/1‑148 (MQ=255) aTACATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTAGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGAGATGCCCAGTTCGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTg > 8:91725/1‑148 (MQ=255) aGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCTAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGca > 2:256919/1‑148 (MQ=255) gATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGcac < 8:43869/148‑1 (MQ=255) gATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTCTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGcac > 3:256418/1‑148 (MQ=255) gATCTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTCTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGcac > 3:256416/1‑148 (MQ=255) cTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCt > 2:138401/1‑149 (MQ=255) gggTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTcgcg > 4:181590/1‑148 (MQ=255) ggTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTCTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCa < 4:256418/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTCTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCa < 4:256416/149‑1 (MQ=255) tACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGc > 2:286890/1‑149 (MQ=255) aCTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGCCGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCg > 6:53936/1‑149 (MQ=255) cTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCGTc < 6:56736/147‑1 (MQ=255) cTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCGTCCa < 7:291725/149‑1 (MQ=255) ggCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGgcgc < 8:175883/92‑1 (MQ=255) ggCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGgcgc > 7:175883/1‑92 (MQ=255) gCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCGTCCAGCGcc > 6:283771/1‑145 (MQ=255) gCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCGTCCAGCGcc < 5:283771/145‑1 (MQ=255) cGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCGTCCAGCGCCGACATc > 3:277977/1‑149 (MQ=255) gttgttCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCGTCCAGCGCCGACATCg > 5:70429/1‑149 (MQ=255) ttgttCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCGTCCAGCGCCGACATCgg < 8:23633/149‑1 (MQ=255) ttgttCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCGTCCAGCGCCGACATCgg > 2:49443/1‑149 (MQ=255) | GCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGG‑‑‑‑‑CCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCCCAGTTGGCGCTGCAGCTGACGCAGTTCGGTGCACAAGTGCTCGCGCACCCGGGCGTCCAGCGCCGACATCGG > NC_002947/5862005‑5862299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |