| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,999,564 | C→A | 9.6% | A33A (GCC→GCA) | PP_5256 → | cyclic nucleotide‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,999,564 | 0 | C | A | 9.6% | 203.5 / 10.5 | 73 | A33A (GCC→GCA) | PP_5256 | cyclic nucleotide‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/28); new base A (4/3); total (42/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
AAACCTGCTCTATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGT > NC_002947/5999416‑5999712 | aaaCCTGCTCTATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGcc > 5:83469/1‑149 (MQ=255) gCTCTATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGgcg > 5:148323/1‑148 (MQ=255) tctATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCAt > 7:110630/1‑149 (MQ=255) tctATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGATCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGACATGCCTGGCGCa > 2:84892/1‑148 (MQ=255) ctATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCAt < 8:249406/148‑1 (MQ=255) ctATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCAt > 7:249406/1‑148 (MQ=255) tATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCAt < 3:131401/147‑1 (MQ=255) aTTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCACCGCCATGCCTGGCGCATc < 7:182703/147‑1 (MQ=255) aTTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCAACATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTACCAGTTGTTGGTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTAGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGAGACCCATTAAGCGCCATGCCTGGCGCAACaa > 8:182703/1‑148 (MQ=255) ttACTACCCTCAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGAGCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCAGGCATGgcgctgaatg < 8:195736/149‑7 (MQ=255) ttACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCa < 8:110630/147‑1 (MQ=255) cccACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAgcgcgcgc > 6:274214/1‑149 (MQ=255) cacaGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCt > 8:231016/1‑149 (MQ=255) ccctcccctcACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTg < 2:90302/148‑1 (MQ=255) ccctcccctcACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTg > 1:90302/1‑148 (MQ=255) ccctcccctcACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGa > 8:281012/1‑149 (MQ=255) ctcccctcACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATc > 1:96149/1‑149 (MQ=255) ccctcACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCt < 4:207877/147‑1 (MQ=255) cctcACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTcc < 3:264662/149‑1 (MQ=255) cccGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGtt > 1:44460/1‑149 (MQ=255) aTCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCt > 1:53884/1‑148 (MQ=255) aCCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAg < 3:65873/148‑1 (MQ=255) aCCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGt < 7:231016/149‑1 (MQ=255) ccATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTg > 4:40075/1‑149 (MQ=255) cTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGa < 2:53884/148‑1 (MQ=255) gCGTTCATCCATTCGTCCCCGTTTTTGCTCGGTTGGGCCTTGATCCTGCTCGACCTCTTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCAGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATgg < 1:84892/148‑1 (MQ=255) gTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCg > 1:302897/1‑149 (MQ=255) ttCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGc > 1:295774/1‑149 (MQ=255) ttCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGc > 1:291918/1‑149 (MQ=255) aTCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTgg > 6:319442/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTGTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTgg > 1:89522/1‑148 (MQ=255) ccAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCa < 3:143039/149‑1 (MQ=255) cAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCa < 3:40075/148‑1 (MQ=255) gtcgtcCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCAt > 1:47644/1‑147 (MQ=255) gtcgtcCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGa < 7:281012/149‑1 (MQ=255) cccGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGc > 3:242365/1‑149 (MQ=255) ccGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGTTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCt < 7:27518/149‑1 (MQ=255) ccGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCt > 2:162344/1‑149 (MQ=255) ttgttgCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCa < 5:319442/149‑1 (MQ=255) gttgCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCaa < 5:274214/148‑1 (MQ=255) tCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTg < 3:7790/113‑1 (MQ=255) tCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTg > 4:7790/1‑113 (MQ=255) gcgcCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTg < 2:275806/148‑1 (MQ=255) cgcCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGc > 4:115949/1‑149 (MQ=255) gcCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGcc > 8:111298/1‑149 (MQ=255) cTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGccc > 3:295997/1‑148 (MQ=255) cTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGAGCGCCTGGTGATATTCCTGCAGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGccc > 1:99984/1‑148 (MQ=255) gATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCcgac < 1:162344/148‑1 (MQ=255) tGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGtc > 8:26746/1‑149 (MQ=255) tGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGtc > 4:151814/1‑149 (MQ=255) tCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTcg > 5:190320/1‑149 (MQ=255) gACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTcgcg < 4:242365/149‑1 (MQ=255) gACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTcg < 4:295997/147‑1 (MQ=255) gACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTcg < 2:47644/147‑1 (MQ=255) gTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATCAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAAc < 1:228079/147‑1 (MQ=255) tt‑tGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATg > 4:280993/1‑149 (MQ=255) tGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCATGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGc > 7:47979/1‑149 (MQ=255) cAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCAc > 1:147003/1‑149 (MQ=255) cAAATGATCCCCATTCAGCGGCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTAAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCTTCCTGATGGCCAc < 2:99984/149‑1 (MQ=255) aaCTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACg < 6:148323/149‑1 (MQ=255) aTCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTa < 2:89522/147‑1 (MQ=255) aTCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTAtt > 2:97744/1‑149 (MQ=255) aTCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTAtt > 2:47892/1‑149 (MQ=255) tCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTAtt < 2:147003/148‑1 (MQ=255) tCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGCTCATCTTCCTCCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTg > 6:71822/1‑149 (MQ=255) aTTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCAt > 6:164861/1‑149 (MQ=255) aTTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCAt > 5:65968/1‑149 (MQ=255) tgatgcgcCAGGCATGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATc > 4:86208/5‑149 (MQ=255) tgatgcgcCAGGCATGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATc > 2:243757/5‑149 (MQ=255) atgcgcCAGGCATGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCgg > 6:135255/3‑149 (MQ=255) aGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGc > 5:292645/1‑149 (MQ=255) cgcCAGGCATGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtg < 3:86208/149‑1 (MQ=255) gcCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGCTGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtgg > 2:96990/1‑149 (MQ=255) aTGCATGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCTATCGGCtggtgg < 8:47979/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGt > 1:237228/1‑149 (MQ=255) | AAACCTGCTCTATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTT‑TGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGT > NC_002947/5999416‑5999712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |