| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,131,456 | A→T | 5.2% | A22A (GCT→GCA) | copB‑II ← | copper resistance protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,131,456 | 0 | A | T | 5.2% | 243.1 / 2.5 | 77 | A22A (GCT→GCA) | copB‑II | copper resistance protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/35); new base T (2/2); total (40/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.66e-01 | |||||||||||
CGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATA > NC_002947/6131311‑6131604 | cgGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCgcagcagca < 1:193022/149‑1 (MQ=255) tcttctGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAg < 1:37619/148‑1 (MQ=255) cttctGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑a > 5:180812/1‑149 (MQ=255) ttctGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑At > 2:229379/1‑149 (MQ=255) ctgctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCTTCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCtga < 1:229379/149‑1 (MQ=255) ctgctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGctttgc < 5:168435/147‑6 (MQ=255) ctgctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGc < 3:288265/146‑1 (MQ=255) ctgctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCtga < 1:86709/149‑1 (MQ=255) ctgctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGC‑ATGCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGctttgct < 4:96875/147‑7 (MQ=255) tgctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCCGC‑ATGCtgaa > 2:6757/1‑149 (MQ=255) tgctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCtgaa > 2:122500/1‑149 (MQ=255) ctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCtgaa < 6:209614/147‑1 (MQ=255) tCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATg < 8:147391/137‑1 (MQ=255) tCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATg > 7:147391/1‑137 (MQ=255) gcgcCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGt < 1:122500/149‑1 (MQ=255) cgcCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTc < 6:180812/149‑1 (MQ=255) cATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCtgaa > 4:2698/1‑135 (MQ=255) cATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCtgaa < 3:2698/135‑1 (MQ=255) aTCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCTGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGc < 4:43370/149‑1 (MQ=255) aTCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGc > 2:109622/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCcagca < 5:28110/148‑1 (MQ=255) tGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCATCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGa > 3:172161/1‑149 (MQ=255) gTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATg < 6:104560/149‑1 (MQ=255) ccATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCca > 5:156209/1‑138 (MQ=255) ccATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCca < 6:156209/138‑1 (MQ=255) cATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTc > 4:89104/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCGCCCAGC‑ATGCTCAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTg > 6:254754/1‑149 (MQ=255) tCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAAt < 6:5511/122‑1 (MQ=255) tCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAAt > 5:5511/1‑122 (MQ=255) tGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCa < 4:30363/142‑1 (MQ=255) tGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAgagagcg > 3:30363/1‑143 (MQ=255) gTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCGGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTAt > 7:306019/1‑146 (MQ=255) gTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCGGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTAt < 8:306019/146‑1 (MQ=255) tCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCca > 3:81714/1‑121 (MQ=255) tCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCca < 4:81714/121‑1 (MQ=255) tGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCa > 2:188214/1‑149 (MQ=255) cGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCt > 4:230448/1‑149 (MQ=255) ggAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTcc < 7:249537/149‑1 (MQ=255) ggAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGcc < 5:325281/149‑1 (MQ=255) gAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCt > 6:221936/1‑149 (MQ=255) gAATCCATTTCCATGGCTCCGTGACCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCt > 5:65757/1‑149 (MQ=255) aTCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCt > 3:285142/1‑147 (MQ=255) tttCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCttt > 4:93575/1‑149 (MQ=255) ccATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATc > 1:258418/1‑149 (MQ=255) cATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATc < 3:314138/148‑1 (MQ=255) cATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCg > 4:131794/1‑149 (MQ=255) aTGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGc > 7:180812/1‑149 (MQ=255) tGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCATCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCt < 7:224946/149‑1 (MQ=255) ggCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTg > 5:19282/1‑149 (MQ=255) cgCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTg < 8:50774/148‑1 (MQ=255) cGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCt < 4:223379/143‑1 (MQ=255) cGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCt > 3:223379/1‑143 (MQ=255) gTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGc < 6:65757/149‑1 (MQ=255) ccccATTGCCGAATGGTCCATCTCATCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGa < 4:172161/148‑1 (MQ=255) ccATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTc < 3:19820/149‑1 (MQ=255) ccATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTc > 7:55203/1‑149 (MQ=255) cATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTcc < 3:230448/149‑1 (MQ=255) gCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCcatc < 2:258418/148‑1 (MQ=255) ccGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCcatcat > 4:157139/1‑149 (MQ=255) tGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCGCCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGc < 5:254754/149‑1 (MQ=255) gTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCtg > 5:202826/1‑149 (MQ=255) gTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCtg < 5:221936/149‑1 (MQ=255) tCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCATCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCtgt < 6:135830/149‑1 (MQ=255) tCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGc > 4:34243/1‑125 (MQ=255) tCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGc < 3:34243/125‑1 (MQ=255) ctcctcAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCtg > 3:200580/1‑143 (MQ=255) ctcctcAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCtg < 4:200580/143‑1 (MQ=255) ctcctcAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTACCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATc > 5:275294/1‑148 (MQ=255) cctcAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCa > 4:99083/1‑148 (MQ=255) gcagcaAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCtt > 2:21656/1‑149 (MQ=255) cagcaAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCAt > 3:210910/1‑85 (MQ=255) cagcaAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCAt < 4:210910/85‑1 (MQ=255) cagcaAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTc < 8:55203/149‑1 (MQ=255) cagcatgCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGCTTTGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTc > 7:10525/7‑149 (MQ=38) caAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGATGCCAAGAGATTCCAGCAGTTTGCTGTGATCCATACCGTCCa > 6:159421/1‑148 (MQ=255) tgCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATc > 7:78685/2‑147 (MQ=255) ggCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCAt > 4:177085/1‑149 (MQ=255) cgcAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATgg > 7:270907/1‑149 (MQ=255) gcagcaCCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCa < 3:93575/149‑1 (MQ=255) cagcaCCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGa > 2:135108/1‑101 (MQ=255) cagcaCCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGa < 1:135108/101‑1 (MQ=255) cagcaCCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGCTCGAGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTCCCTTACCTATAACGCTGCCATGCGATTCCAACATTTTCCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGCTcaa > 2:189968/1‑146 (MQ=255) agcaCCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATa > 8:200053/1‑149 (MQ=255) | CGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGC‑ATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATA > NC_002947/6131311‑6131604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |