Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 640,265 | G→A | 8.3% | D160D (GAC→GAT) | PP_0551 ← | MORN domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 640,265 | 0 | G | A | 8.3% | 169.1 / 3.1 | 60 | D160D (GAC→GAT) | PP_0551 | MORN domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/27); new base A (2/3); total (30/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.93e-01 |
CGTCGGCCAGTTCCAGTTGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGCCCTCA > NC_002947/640117‑640412 | cGTCGGCCAGTTCCAGTTGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAgg < 1:94402/149‑1 (MQ=255) cagttccagttAGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCa < 8:88606/149‑1 (MQ=255) agttccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCT‑GGGTGACCTGATCA‑ccccag < 7:14066/149‑4 (MQ=255) ttccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCT‑GGGTGACCTGATCA‑ccccaggc < 1:110163/149‑6 (MQ=255) ttccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCT‑GGGTGACCTGATCA‑ccccaggc < 4:47567/149‑6 (MQ=255) ccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGcc < 7:56767/148‑1 (MQ=255) cagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCt < 3:317016/149‑1 (MQ=255) gCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAAc < 4:139644/148‑1 (MQ=255) cgtcgtACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCg > 5:39910/1‑149 (MQ=255) gtcgtACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCgg < 8:90437/149‑1 (MQ=255) aCAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGAGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAAc > 4:32211/1‑149 (MQ=255) aCAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGACTCGTCGGAATGCTTGAGCGTGACCACCCCGTCGCGGCGCACGTCGCGGAAGGTGCAGCAATAGTAGCAGCCTGGGGTGATCAGGTCC‑CCCAGCCCAGGAAACAGCCACTCGGCGaa > 2:240362/1‑148 (MQ=255) aGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTg > 6:269289/1‑149 (MQ=255) cgtcCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCAGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCcg > 1:142032/1‑149 (MQ=255) gtcCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGACCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAGCAGCCCCTCGGCGAACTGGCcgc > 2:215342/1‑149 (MQ=255) cTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCgg < 1:288518/148‑1 (MQ=255) cTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCgg < 2:49552/148‑1 (MQ=255) ttGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCgg > 1:318046/1‑147 (MQ=255) 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ttgAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTTGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTg > 8:156419/1‑149 (MQ=255) tgAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTgg > 4:311545/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGc > 5:43241/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑Gt < 1:121628/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑Gt > 6:281668/1‑149 (MQ=255) tGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGc < 5:281668/149‑1 (MQ=255) ccTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCAc < 1:209741/149‑1 (MQ=255) cGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCACTgg < 1:215342/149‑1 (MQ=255) ccGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCATGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCACTGGcc < 6:238287/149‑1 (MQ=255) tCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCACTGGCCGTc > 2:55272/1‑149 (MQ=255) 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aTCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCACTGGCCCTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGcc > 1:135329/1‑149 (MQ=255) tCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGccc > 7:90040/1‑149 (MQ=255) ggTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGCCCTCa > 7:293442/1‑149 (MQ=255) ggTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGCCCTCa > 8:63340/1‑149 (MQ=255) ggTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCACTGGCCGTCCATGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGCCCTCa > 4:249752/1‑149 (MQ=255) | CGTCGGCCAGTTCCAGTTGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTCGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGGCCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCC‑GTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGCCCTCA > NC_002947/640117‑640412 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |