Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 672,892 | T→A | 7.5% | I210F (ATC→TTC) | PP_0574 ← | LuxR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 672,892 | 0 | T | A | 7.5% | 180.9 / 2.2 | 62 | I210F (ATC→TTC) | PP_0574 | LuxR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/28); new base A (3/2); total (32/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AATGGGTCGTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCTTTTTC > NC_002947/672745‑673036 | aaTGGGTCGTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATc > 1:188838/1‑149 (MQ=255) aaTGGGTCGTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATc < 6:277967/149‑1 (MQ=255) aTGGGTCGTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCAGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTGTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCt > 7:202648/1‑149 (MQ=255) ggTCGTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTgg < 2:378/148‑1 (MQ=255) gTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAAtt < 7:126636/149‑1 (MQ=255) aCCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGTGGGTCAGCGCCAGATCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑AAGTTGTTTTCGGTAATGACCATTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTc > 7:138695/1‑149 (MQ=255) aCCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTc < 6:41559/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTct < 7:95032/149‑1 (MQ=255) cGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTg > 6:41593/1‑144 (MQ=255) cGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTg < 5:41593/144‑1 (MQ=255) cGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTg < 3:171011/144‑1 (MQ=255) cGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGAAGGCGATCTGGTAATTg > 4:171011/1‑144 (MQ=255) tGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTcttgcc < 8:67745/149‑1 (MQ=255) cGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGgc < 5:78556/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTc > 3:264112/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTc > 5:215394/1‑148 (MQ=255) aGCTCCATATCCAGCTGGGTGCGGTTTTGCATATGCGTCAAACGCAATACATGATACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCTATCTTGTAATTGGTATTTCCATTGCCTACCAGTCGCGCCACTTCCa < 8:138695/148‑1 (MQ=255) aGCACCAGATACAGCTGGTTGACTTAGTCCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATACAGCTTC‑ACATTGATATCGGTAATGCCAACTACACAGTAGAACTTTTAATTGTTCTTGCCATTGAAAACCACGAGCACCACTTc > 2:196662/1‑146 (MQ=255) ccAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCGACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTg > 1:96819/1‑149 (MQ=255) agagCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGGCCAGTTCGGAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCg > 4:20792/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTg > 8:231773/1‑147 (MQ=255) aGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGgaga > 8:23522/1‑149 (MQ=255) aGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGgaga < 7:231773/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACa < 7:38616/149‑1 (MQ=255) tGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGgag > 6:24929/1‑141 (MQ=255) tGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGgag < 5:24929/141‑1 (MQ=255) tGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTtc < 4:165067/149‑1 (MQ=255) cGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTtctc < 2:188838/149‑1 (MQ=255) ggTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTtctc > 2:16670/1‑148 (MQ=255) ggTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTtctc > 3:248831/1‑148 (MQ=255) atGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTAGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCATTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGctgctg > 5:82762/1‑149 (MQ=255) gCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTgg > 5:14201/1‑148 (MQ=255) gCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCtcgcat > 7:142098/1‑147 (MQ=255) aaTACCTGAGACCCCTAGAGCTAC‑ACGGTGTCTTCGGTACTGCCCAGTTCGCAGGCCATCTTGTACTTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCtcgctttc < 8:298397/149‑1 (MQ=255) aaTACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCtcgctttc < 6:215394/149‑1 (MQ=255) agaCACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCgctttcgctttc < 5:303773/147‑1 (MQ=255) agaCACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTttctt < 6:14201/149‑1 (MQ=255) acaTAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTg > 5:239337/1‑148 (MQ=255) gCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTg < 2:96819/149‑1 (MQ=255) cTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTgg > 5:257619/1‑149 (MQ=255) cTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTgg > 8:154656/1‑149 (MQ=255) aCGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACg > 8:76904/1‑149 (MQ=255) ttttCGGTAATGCCGAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCggt < 6:82762/148‑1 (MQ=255) ttCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCggtggg > 5:6769/1‑149 (MQ=255) tCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCggtgggt > 4:139517/1‑149 (MQ=255) aTGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTg < 7:76904/149‑1 (MQ=255) ccAGATCGCCTGCGAACTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCa > 7:217101/1‑149 (MQ=255) ccAGATCGCCTGCGAACTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCa > 7:221281/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCggtgggt > 6:112353/1‑138 (MQ=255) cAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCggtgggt < 5:112353/138‑1 (MQ=255) cAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATAACTGTCACGCCGGTGGGTGCCTTTGCCAc > 1:23334/1‑149 (MQ=255) gTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACgg > 5:245072/1‑149 (MQ=255) gTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACgg > 3:12033/1‑149 (MQ=255) gTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACgg > 6:306386/1‑149 (MQ=255) cGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGc < 3:20792/148‑1 (MQ=255) gcctgCGAACTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCtt < 8:217101/145‑1 (MQ=255) gcctgCGAACTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCtt < 8:221281/145‑1 (MQ=255) aGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCtttt < 4:264112/149‑1 (MQ=255) gCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCTTTTTc < 5:281567/149‑1 (MQ=255) gCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCTTTTTc < 6:239337/149‑1 (MQ=255) gCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTCGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCTTTTTc < 4:144650/149‑1 (MQ=255) cGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCTTTTTc > 3:275696/1‑148 (MQ=255) | AATGGGTCGTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTC‑ACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGCGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCTTTTTC > NC_002947/672745‑673036 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |