| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 787,407 | C→A | 7.5% | R175R (CGC→CGA) | ettA → | ADP/ATP ratio sensor/translation inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 787,407 | 0 | C | A | 7.5% | 255.7 / 7.9 | 80 | R175R (CGC→CGA) | ettA | ADP/ATP ratio sensor/translation inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/40); new base A (4/2); total (38/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.47e-01 | |||||||||||
CAAGCTGGAAGCCATCCTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCTCGACAAC > NC_002947/787260‑787554 | cAAGCTGGAAGCCATCCTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGATGCGCCAGATGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACCCCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTgccgc > 1:67486/1‑149 (MQ=255)cAAGCTGGAAGCCATCCTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTgccgcc > 6:100179/1‑149 (MQ=255)cAAGCTGGAAGCCATCCTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTgccgcc > 2:26963/1‑149 (MQ=255) tGGAAGCCATCCTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCctgctg > 3:190963/1‑149 (MQ=255) tGGAAGCCATCCTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCctgctg > 6:127542/1‑149 (MQ=255) gAAGCCATCCTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCctgctgct > 2:232415/1‑149 (MQ=255) gCCATCCTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTc < 6:152725/149‑1 (MQ=255) ccATCCTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCg < 8:158677/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCAc > 4:254746/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCAcc > 2:50011/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCAcc > 1:298129/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGCCGTTGGCCACAACCTTGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGGCTTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCg < 3:239094/148‑1 (MQ=255) cAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCg < 2:287358/148‑1 (MQ=255) cAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGACAGCAGCAGGCGGCAcaggg < 7:75019/149‑5 (MQ=255) aGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGAc < 2:218414/149‑1 (MQ=255) cgccgATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACAtgc < 6:55077/149‑1 (MQ=255) gccgATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACAtgct > 7:223803/1‑149 (MQ=255) ccgATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACAtgctg < 1:26963/149‑1 (MQ=255) ccgATGGAAACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACAtgctg > 3:261338/1‑149 (MQ=255) gATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGGTGCCGACagcagcag < 2:224346/149‑8 (MQ=255) ccACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTcg < 2:298129/149‑1 (MQ=255) ccACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTc > 3:166253/1‑148 (MQ=255) caACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACAtgctgc < 7:234940/140‑1 (MQ=255) caACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACAtgctgc > 8:234940/1‑140 (MQ=255) cTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAAcc > 3:246366/1‑149 (MQ=255) gA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGac < 8:223803/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGaccaac > 2:98591/1‑148 (MQ=255) gCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAaccacc > 3:37241/1‑149 (MQ=255) cTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCt > 7:60469/1‑149 (MQ=255) tGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGac > 5:78583/1‑139 (MQ=255) tGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGac < 6:78583/139‑1 (MQ=255) aCGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGAc > 3:54521/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGc > 7:219306/1‑149 (MQ=255) gCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGa < 5:127542/149‑1 (MQ=255) ccGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCAGCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTc < 8:64051/148‑1 (MQ=255) cGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGACCCGACCAACCACCTGGACGCCGCCTCgg > 7:66727/1‑149 (MQ=255) gACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGt < 3:254746/149‑1 (MQ=255) gACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGt > 3:170354/1‑149 (MQ=255) aCGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTg < 4:190963/149‑1 (MQ=255) aCGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTg < 4:246366/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGCCACCGAGTCggcgtc > 6:141867/1‑143 (MQ=255) ccTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCct > 3:160960/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGAAGCCGACTCGGTGGCct > 5:310997/1‑149 (MQ=255) cgcCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCctgg < 1:4066/147‑1 (MQ=255) gcCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCCCCTGGACGCCGACTCGGTGGCctggctg > 8:180834/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAg > 5:83272/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGa > 6:78693/1‑146 (MQ=255) ccGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGa < 5:78693/146‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAgc < 8:60469/148‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAg < 1:232415/147‑1 (MQ=255) ggCCGGGGATCCGCGCACCGACCCCCTGGCCGGGGGGGATAACCGCCGGGTGGCCCTGTGCCGCCTGCGGCTGGCGGCACCCTCCATGGGGGGGTTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCt < 1:249121/149‑1 (MQ=255) ccTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTCCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTc > 4:154188/1‑149 (MQ=255) ggATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGc < 4:37241/149‑1 (MQ=255) gATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCa < 4:160960/149‑1 (MQ=255) gcgcgcATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCtt < 5:243317/140‑1 (MQ=255) gcgcgcATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCtt > 6:243317/1‑140 (MQ=255) cgcgcATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGa < 3:267730/148‑1 (MQ=255) gcgcATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCATGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGCCTGGAGCGCTTCCTGCACGACt > 1:250517/1‑149 (MQ=255) tCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGTGCTTCCTGCACGACTTCCCg < 4:166253/149‑1 (MQ=255) aaCACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCggg < 5:185133/148‑1 (MQ=255) aaCACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCggg > 6:185133/1‑148 (MQ=255) aaCACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACAAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCggg > 1:219582/1‑148 (MQ=255) acacCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCa < 6:83272/149‑1 (MQ=255) 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agaAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCCCGACTTCCCGGGCACCGTGGTa > 7:54406/1‑140 (MQ=255) agaAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTa < 8:54406/140‑1 (MQ=255) gaAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTAccc < 4:54521/149‑1 (MQ=255) aaCGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCAc < 8:219306/149‑1 (MQ=255) aaCGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCAc > 3:62053/1‑149 (MQ=255) tgtgGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGtt < 4:258943/149‑1 (MQ=255) cTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCt < 8:66727/149‑1 (MQ=255) cTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCt > 2:47812/1‑149 (MQ=255) tgttCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCTc < 2:250517/149‑1 (MQ=255) ggtgCCGACAGCAGCAGGCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGAc > 8:69650/2‑137 (MQ=39) ggtgCCGACAGCAGCAGGCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGAc < 7:69650/136‑1 (MQ=39) gtgCCGACAGCAGCAGGCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCTc > 8:232763/1‑148 (MQ=39) gtgCCGACAGCAGCAGGCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCTc > 2:152251/1‑148 (MQ=39) tgCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCTc < 1:50011/147‑1 (MQ=255) tgCCGACAGCAGCAGGCGGCACCCGCCATGCTGCTGCTCGACGCCCCGCCCAACCACCTGGCCGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCCCCGTGGTAGCCATTACCCACGCCCGTTACTTCCTCGa > 7:103234/1‑149 (MQ=255) ccgccTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCTCGAc > 6:23303/1‑148 (MQ=255) ccgccTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCTCGAc > 6:27934/1‑148 (MQ=255) cgccTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTa < 4:187303/117‑1 (MQ=255) cgccTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTa > 3:187303/1‑117 (MQ=255) gccTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCTCGACAAc > 5:5466/1‑149 (MQ=255) | CAAGCTGGAAGCCATCCTGCAGGCCGCCGATGGCCACAACCTGGA‑GCGCCAGCTGGACGTCGCTGCCGACGCCCTGCGCCTGCCGGCCTGGGATGCGCGCATCGAACACCTGTCCGGTGGTGAGAAACGCCGTGTGGCCCTGTGCCGCCTGCTGCTGTCGGCACCCGACATGCTGCTGCTCGACGAACCGACCAACCACCTGGACGCCGACTCGGTGGCCTGGCTGGAGCGCTTCCTGCACGACTTCCCGGGCACCGTGGTAGCCATTACCCACGACCGTTACTTCCTCGACAAC > NC_002947/787260‑787554 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |