| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 922,757 | G→C | 7.7% | Q91E (CAG→GAG) | PP_0803 ← | protein secretion ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 922,757 | 0 | G | C | 7.7% | 209.8 / 4.7 | 71 | Q91E (CAG→GAG) | PP_0803 | protein secretion ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/33); new base C (2/4); total (34/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.30e-01 | |||||||||||
ATCAGGTCAGGAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCACCTCGAAC > NC_002947/922609‑922902 | aTCAGGTCAGGAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGGCGGGGCGAGCTg < 4:196878/149‑1 (MQ=255) tcaggtcaggAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTgg < 3:100644/149‑1 (MQ=255) caggtcaggAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCAGCCTGCAGGCGGGCCTGGCAGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCAGGAAGCCGTCTTGGTCCGGTCGACCTggg > 4:288611/1‑149 (MQ=255) agagTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCt > 8:204735/1‑149 (MQ=255) agagTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCt < 7:249037/149‑1 (MQ=255) agTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTgg < 5:321371/149‑1 (MQ=255) gTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTTGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTgg < 4:4821/148‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCcgc > 7:150918/1‑149 (MQ=255) cgcAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCTGGTCGAGCGCGGCCAGGTGCTGGcccag < 2:269258/149‑4 (MQ=255) aGGCTCTCCGGGAAGGGCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCGCGGCCAGGTGCTGGCCCAGCTc < 7:122847/149‑1 (MQ=255) ctctCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCGCGGCCAGGTGCTGGCCCAGCTCGAc < 6:208345/149‑1 (MQ=255) tcCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCACTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGATCGACCAg > 7:27523/1‑149 (MQ=255) cGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAg < 2:115848/147‑1 (MQ=255) cAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCgg > 7:177670/1‑149 (MQ=255) aGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCcgc > 6:88366/1‑127 (MQ=255) tGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCa > 8:228807/1‑149 (MQ=255) tGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCa > 8:46629/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGc > 6:63966/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGc > 6:258135/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGc < 3:168767/149‑1 (MQ=255) gCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTc < 8:150918/148‑1 (MQ=255) ggTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCt > 4:50671/1‑149 (MQ=255) gTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCCCGCTCATCTg > 1:156093/1‑149 (MQ=255) tCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTgc < 7:46629/149‑1 (MQ=255) aCCTCTTCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGTTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTgc‑‑‑gc < 8:276229/149‑1 (MQ=255) aCCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTgc‑‑‑gc < 6:153632/149‑1 (MQ=255) ccTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTgc‑‑‑gc > 5:256831/1‑148 (MQ=255) ctttgcctgcAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑Gcga > 3:99436/4‑149 (MQ=255) ctctGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑Gcga < 7:30235/149‑1 (MQ=255) ctctGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCGCGGCCAGGTGCTGGCCCAGCTCGAcccg > 4:175294/1‑118 (MQ=37) ctctGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCGCGGCCAGGTGCTGGCCCAGCTCGAcccg < 3:175294/120‑3 (MQ=37) tctGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑Gcgac > 3:72749/1‑149 (MQ=255) tgcctgcAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑Gcgacga > 1:2505/1‑149 (MQ=255) cctgcAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGAt < 5:9758/148‑1 (MQ=255) gcAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCg > 1:139189/1‑149 (MQ=255) cAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGTGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGc > 5:94377/1‑149 (MQ=255) aGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGcc > 8:136175/1‑149 (MQ=255) ggCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGccc < 4:99436/149‑1 (MQ=255) gCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCt < 7:228807/149‑1 (MQ=255) gCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCt < 8:177670/149‑1 (MQ=255) gCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCt > 6:106515/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCCGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGCTACCGCCcgcgca > 7:224500/1‑147 (MQ=255) ccTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAAc < 2:139189/149‑1 (MQ=255) ctggcCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTg < 6:256831/149‑1 (MQ=255) cccTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAAt > 4:88296/1‑148 (MQ=255) gCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCt < 6:94377/148‑1 (MQ=255) gcgcGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGctc < 3:288611/149‑1 (MQ=255) gcgGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCCGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑CCGACGAAACCGCCCTCCAACGACTGAATGACCTGCtctc > 4:168355/1‑149 (MQ=255) cgGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTcg < 7:204735/149‑1 (MQ=255) ggTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGCCTGAATGACCTGCTCTcgc > 3:253166/1‑149 (MQ=255) tACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGa < 5:106515/149‑1 (MQ=255) aCTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGaa > 5:189238/1‑149 (MQ=255) gCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTg < 8:27523/148‑1 (MQ=255) gCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTg < 2:2505/148‑1 (MQ=255) ccTCGCTTTCACCTAGGCTGGAAGCGGTCTTGGTCGGGTCGTGGCGGGCCAGCAGCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGTATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGa < 8:224500/149‑1 (MQ=255) cTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGCCCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGaa > 5:196893/1‑149 (MQ=255) cTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGaa < 6:189238/149‑1 (MQ=255) cTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGaa < 4:72749/149‑1 (MQ=255) cTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTACTATAAGACGATACCGCCCTCGAACGAAGGAATGACCTGCTATAGCGAACTTg > 1:268979/1‑149 (MQ=255) gCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATg < 3:88296/148‑1 (MQ=255) cccACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGcc > 6:147625/1‑149 (MQ=255) cACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCCGGTCGACCTCGGAAAGCACCTGGCCGCGCACCACCAGGTC‑ACCTTCCGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAAAGACTGAATGACCAGCTCTCGCGAACTAGGAATGACCTTACCtg > 1:90776/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGt > 2:294226/1‑149 (MQ=255) aaGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTg < 5:147625/149‑1 (MQ=255) aaGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTg < 7:136175/149‑1 (MQ=255) ccGTGTTGGTCGGGTCGTGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCAGGCTCTTCTGC‑‑‑GCGTCGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTGTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGa < 2:275517/148‑1 (MQ=255) ggtcgggtcgAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCg < 3:50671/148‑1 (MQ=255) gtcgggtcgAGCTGGGCCAGCACCAGGCCCCGCACGACCAGGTC‑ACCTTAGGCCACGCTCATATGC‑‑‑GCGACGAAACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAAAGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGt > 7:183853/1‑149 (MQ=255) gggtcgAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCAc < 1:294226/149‑1 (MQ=255) ggggcgAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCAc < 3:168355/149‑1 (MQ=255) ggtcgTGCTGGGCCAGCACGTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACGTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCAcc < 4:253166/149‑1 (MQ=255) tcgAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCACCTc > 5:86453/1‑149 (MQ=255) gAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTCTACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGACCGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCACCTc > 1:217425/1‑148 (MQ=255) gCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCACCTCGAAc > 2:201680/1‑149 (MQ=255) | ATCAGGTCAGGAGAGTCGCGCAGGCTCTCCGGGAAGGTCAGTGGCTTGCCGGTCACCTCTGCCTGCAGGCGGGCCTGGCTGGCCCTGGCAGCGCGGTACTTGGCCTCGCTTTCACCCACGCTGGAAGCCGTCTTGGTCGGGTCGAGCTGGGCCAGCACCTGGCCGCGCTCGACCAGGTC‑ACCTTCGGCCACGCTCATCTGC‑‑‑GCGACGATACCGCCCTCGAACGACTGAATGACCTGCTCTCGCGAACTTGGAATGACCTTGCCTGTGCCGGTGGATACCTCGGTCACCTCGAAC > NC_002947/922609‑922902 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |