Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,366,551 | A→T | 9.1% | V50D (GTC→GAC) | PP_1191 ← | S4 domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,366,551 | 0 | A | T | 9.1% | 171.1 / 5.3 | 63 | V50D (GTC→GAC) | PP_1191 | S4 domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/31); new base T (3/3); total (29/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 |
AGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGTTCG > NC_002947/1366404‑1366694 | aGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCAACGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑Ac > 8:17221/1‑149 (MQ=255) gggCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTCGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑Acg > 1:135850/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCTCTGAGGATGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCAATGTCAATGACGGCTGTCTGTTTCAGCAGCAGTGTCACCGGATACAGGGTTTCGGCACCGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑Acgc > 2:257443/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑Acg < 4:46639/148‑1 (MQ=255) ggCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGCGTTTCGGCCCGGGCGCCCGGCAGCCGCTCG‑Acgc > 6:245641/1‑149 (MQ=255) cgcACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCgctg < 1:90919/149‑1 (MQ=255) cgcACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCgctg < 5:181923/149‑1 (MQ=255) cggcggGCCGCGCTGAGGCGGCCCATCTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCtt < 8:203246/149‑1 (MQ=255) cgGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCtt < 8:194034/149‑1 (MQ=255) ggTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTg < 6:108724/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGaa < 7:26375/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGaa < 2:164434/149‑1 (MQ=255) ccTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGc > 4:264290/1‑149 (MQ=255) ccTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGc > 6:329897/1‑149 (MQ=255) ccTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGc > 8:235529/1‑149 (MQ=255) tCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCgg > 3:228276/1‑149 (MQ=255) gCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCgg < 4:8284/147‑1 (MQ=255) tGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGgctgc > 2:208960/1‑149 (MQ=255) ggCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCGAACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTc < 1:208960/149‑1 (MQ=255) ttcccATTTTCATGCTGTCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGacc < 7:198883/147‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGCGGGCTTCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATc < 2:105194/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCATGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCg < 6:162591/148‑1 (MQ=255) gcgcGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGt < 3:264290/149‑1 (MQ=255) gcgGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTAG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTa > 4:81137/1‑149 (MQ=255) cACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGcctc < 7:235529/147‑1 (MQ=255) aTGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTa > 1:170897/1‑149 (MQ=255) aTGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTa > 2:135052/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTAc < 4:228276/149‑1 (MQ=255) gctggctgGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTc > 8:292398/1‑149 (MQ=255) tggctggTTCAGCAGAAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACTGGCTCCAGGCAGCAGCTCT‑AAGCGCTGATGATCAACCTTGAACTGTGTCTGCTCGACCACAACGCCATCTACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTctg < 1:257443/149‑3 (MQ=255) ggctggTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGCGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCCCCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGc > 8:6872/1‑149 (MQ=255) gctggTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGcc > 6:273383/1‑149 (MQ=255) gctggTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGc > 8:143035/1‑148 (MQ=255) gTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTcgc < 2:106733/149‑1 (MQ=255) agcagcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCgcggcg < 5:245641/149‑1 (MQ=255) gcagcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGcggcgg < 2:170897/149‑1 (MQ=255) gcagcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACACAGCCTCCTTCACTGTACTGCTCGGCCTCGcggcgg > 8:70475/1‑149 (MQ=255) gcagcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGACGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACACCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGcggcgg < 7:298235/149‑1 (MQ=255) agcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGa < 5:329897/149‑1 (MQ=255) ggTCACCGGCTCCAGGGTTTAGGCACGGGCCCACGGCAGCAGCTAG‑ACGCGCTGGTGCTCAACCATGAACTGCGGCTGCTCGACCCCCACGCCATCGACCGTTAACCAGCCTCCTTCAATTTACTGCTCGGACTCGCGGCGCGagcacc > 2:194465/1‑147 (MQ=255) aCCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTCAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAg < 7:6872/149‑1 (MQ=255) cGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAgct > 1:94965/1‑149 (MQ=255) cAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTAGCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTc < 7:292398/147‑1 (MQ=255) cAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGa < 4:130867/132‑1 (MQ=255) cAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGa > 3:130867/1‑132 (MQ=255) cAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCTCGGCTGCTcc < 8:20115/148‑2 (MQ=255) cAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGa > 1:193632/1‑149 (MQ=255) aGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGGCCTGCGCGAt > 3:1369/1‑149 (MQ=255) gTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCTCGGCTGCTcccgccg < 3:81137/149‑7 (MQ=255) aCGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTg > 8:92609/1‑148 (MQ=255) gcCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGc < 5:273383/149‑1 (MQ=255) cccGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCg < 8:273677/149‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGa < 2:193632/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGAc > 5:123555/1‑149 (MQ=255) gcagcaGCGCG‑TCGAGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAAt > 7:36448/1‑85 (MQ=39) gcagcaGCGCG‑TCGAGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAAt < 8:36448/85‑1 (MQ=39) gcagcaGCGCG‑TCGAGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACg > 2:287336/1‑149 (MQ=255) agcagcGCG‑TCGAGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACggg > 5:150433/1‑149 (MQ=255) gcagcTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGt > 1:233835/1‑149 (MQ=255) gcagcGCG‑TCGAGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGt < 1:287336/149‑1 (MQ=255) agcGCG‑TCGAGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGTTc < 6:150433/149‑1 (MQ=255) gcTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGTTCg > 5:233314/1‑149 (MQ=255) gcTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGTTCg < 1:135052/149‑1 (MQ=255) | AGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACGGGCGCCCGGCAGCAGCTCG‑ACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGTTCG > NC_002947/1366404‑1366694 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |