Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,376,321 | A→T | 6.8% | intergenic (+30/+19) | kup → / ← PP_1201 | potassium transport system protein Kup/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,376,321 | 0 | A | T | 6.8% | 170.1 / 2.1 | 59 | intergenic (+30/+19) | kup/PP_1201 | potassium transport system protein Kup/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/30); new base T (2/2); total (27/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 |
TCGCGCTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACTG > NC_002947/1376175‑1376467 | tctcgcTGGCGGGTCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCaga < 7:190264/146‑1 (MQ=255) tCGCGCTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCaga < 4:102690/149‑1 (MQ=255) tCGCGCTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCa > 5:3552/1‑147 (MQ=255) gCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCt > 6:104983/1‑149 (MQ=255) ggggCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAAGCGGGTGATCGCGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGa < 3:22694/149‑1 (MQ=255) ggggCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCt > 6:262901/1‑147 (MQ=255) ggggCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGa < 8:216873/149‑1 (MQ=255) ggggCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGa < 3:17371/149‑1 (MQ=255) ggCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGc < 3:130566/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCGCGTTCTTGCTGCAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGt < 8:151668/149‑1 (MQ=255) ttCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGa < 4:86020/138‑1 (MQ=255) ttCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGa > 3:86020/1‑138 (MQ=255) ttCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGt > 7:54838/1‑149 (MQ=255) ttCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTAAGGGCCGCAGAGCGGCCCAGAGCCTTGTAAGt > 6:221281/1‑149 (MQ=255) gcgTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTc < 5:104983/148‑1 (MQ=255) tGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTAc > 3:264605/1‑149 (MQ=255) tGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTAc > 8:92085/1‑149 (MQ=255) gaaTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTg < 3:104943/149‑1 (MQ=255) aTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGa < 6:3552/149‑1 (MQ=255) cAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTg > 2:250561/1‑149 (MQ=255) ggCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCtt > 2:298321/1‑149 (MQ=255) cgcTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGCGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGttt > 2:56720/1‑149 (MQ=255) gcTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGttt > 1:117621/1‑148 (MQ=255) gcTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGttt < 2:117621/148‑1 (MQ=255) gcTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCAGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTc > 6:327075/1‑149 (MQ=255) cttcttCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCg < 5:262901/149‑1 (MQ=255) ttcttcAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCCCAGAGCGGCCCAGAGCCATGTGAGTTCTGCTAAGCTAAGCTGGACTTGCCTTTGCGCGtttag > 2:321353/1‑146 (MQ=255) ttcAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGAtct > 1:78523/1‑149 (MQ=255) cAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGAtctc < 1:250561/148‑1 (MQ=255) aCCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCGGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGc > 2:113229/1‑148 (MQ=255) cTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGAtctc < 8:21629/144‑1 (MQ=255) cTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCgagat > 7:21629/1‑145 (MQ=255) cTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCaa < 5:221281/149‑1 (MQ=255) ccGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATc < 7:189258/148‑1 (MQ=255) gTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGgc < 5:185948/126‑1 (MQ=255) ttGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAGATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAAc > 1:62802/1‑149 (MQ=255) aaCCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCt > 4:95579/1‑149 (MQ=255) ccGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTAAGGGCCGCAGAGCGGCCCAGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCCCTTg > 6:109097/1‑149 (MQ=255) gTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGa < 7:235684/149‑1 (MQ=255) gTGATCGAGCTAGGGACCCAGGGCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGa < 7:231204/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTg > 6:147464/1‑149 (MQ=255) gAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGcc < 2:78523/148‑1 (MQ=255) aGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACTCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCgg < 2:62802/149‑1 (MQ=255) gggACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGATCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTa < 1:250790/147‑1 (MQ=255) cccAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTtctc < 8:54838/149‑1 (MQ=255) cccAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTtctc < 1:298321/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGCAAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTtctc > 1:198776/1‑149 (MQ=255) a‑aTGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGccc < 1:321353/148‑1 (MQ=255) a‑aTGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCg > 3:294331/1‑149 (MQ=255) agc‑agGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCa < 3:95579/149‑1 (MQ=255) gc‑agGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCTATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAg < 7:92085/149‑1 (MQ=255) gc‑agGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAg < 4:264605/149‑1 (MQ=255) gCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCg > 1:106143/1‑131 (MQ=255) gCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCg < 2:106143/131‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCt > 1:196525/1‑148 (MQ=255) tCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCt > 3:135341/1‑148 (MQ=255) aGGGCCGCTCTGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCt < 2:196525/146‑1 (MQ=255) aGGGCCGCTCTGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCAc > 6:203633/1‑149 (MQ=255) aGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCa < 2:198776/148‑1 (MQ=255) aGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCAc < 4:294331/149‑1 (MQ=255) cGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACt > 3:25622/1‑149 (MQ=255) gCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACTg < 4:25622/149‑1 (MQ=255) agagCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCg < 3:66518/62‑1 (MQ=255) agagCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCg > 4:66518/1‑62 (MQ=255) | TCGCGCTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGA‑ATGGGGTTATACAGC‑AGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACTG > NC_002947/1376175‑1376467 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |