Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,452,781 | C→T | 7.7% | Q315* (CAG→TAG) | PP_1271 → | putative Multidrug efflux MFS transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,452,781 | 0 | C | T | 7.7% | 187.3 / 4.5 | 65 | Q315* (CAG→TAG) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/25); new base T (3/2); total (38/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 |
CAACGAGTGGTCCGAGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGC > NC_002947/1452642‑1452928 | cAACGAGTGGTCCGAGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGTAGATCCAgg > 5:292152/1‑149 (MQ=255) cAACGAGTGGTCCGAGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAgg > 1:308042/1‑149 (MQ=255) aaCGAGTGGTCCGAGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAggg > 1:215389/1‑149 (MQ=255) aGTGGTCCGAGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGTAGATCCAGGGCTAc < 6:292152/149‑1 (MQ=255) tCCGAGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGccc > 7:45841/1‑149 (MQ=255) cGAGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCgg > 7:222285/1‑149 (MQ=255) gAGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGgc < 7:269353/149‑1 (MQ=255) aGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGgcg > 1:281836/1‑149 (MQ=255) aGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGACGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGTAGATCCAGGGCTACCGCCCGgcg > 5:11380/1‑149 (MQ=255) cgttgccgttTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAg < 5:220237/149‑1 (MQ=255) gttgccgttTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGa > 8:44483/1‑149 (MQ=255) cgttTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGc > 8:290466/1‑149 (MQ=255) cgttTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGc > 6:327058/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTtga < 7:42891/148‑1 (MQ=255) gcTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCtg > 6:281483/1‑149 (MQ=255) aTTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGACGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGTAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCtggt < 6:11380/147‑1 (MQ=255) ttGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCCCAGCCCAGCCCGTTGATGATGCTGTTGGc > 4:252331/1‑149 (MQ=255) gCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACGAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGccc > 3:32388/1‑148 (MQ=255) aGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATg < 8:45841/149‑1 (MQ=255) ggcgCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGCCCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCg > 5:183621/1‑149 (MQ=255) gcAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGGGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCaa < 1:96086/149‑1 (MQ=255) gcAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCaa < 7:44483/149‑1 (MQ=255) aCTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACt > 3:129204/1‑148 (MQ=255) cTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGa > 7:211545/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGAt > 4:91392/1‑149 (MQ=255) gAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCg > 5:129957/1‑149 (MQ=255) tttCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACAGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGccc > 2:225972/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTg > 3:124049/1‑149 (MQ=255) gCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGc < 2:195877/148‑1 (MQ=255) ccTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGc > 3:49537/1‑149 (MQ=255) gTGCCCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGTAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGAc > 4:35962/1‑149 (MQ=255) gACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGAcgg < 2:215389/149‑1 (MQ=255) cccTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCAt > 6:179439/1‑118 (MQ=255) cccTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCAt < 5:179439/118‑1 (MQ=255) cccTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGAcggcg < 5:156610/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCGTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGAcggcgg > 1:228934/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGAcggcgg > 5:17474/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGAcg < 4:51260/143‑1 (MQ=255) tGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGAcg > 3:51260/1‑143 (MQ=255) gCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCa < 7:290466/147‑1 (MQ=255) gTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCaa < 2:281836/149‑1 (MQ=255) tGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCaa > 6:249345/1‑148 (MQ=255) tGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATc > 4:43553/1‑149 (MQ=255) gTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCcg > 6:108144/1‑149 (MQ=255) gCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATcc > 8:43620/1‑143 (MQ=255) gCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATcc < 7:43620/143‑1 (MQ=255) cTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGCTCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGt < 1:225972/149‑1 (MQ=255) ttCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTg > 6:147446/1‑148 (MQ=255) cGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGa < 6:17474/148‑1 (MQ=255) cGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGa < 2:228934/148‑1 (MQ=255) gggTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGCTCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACt > 2:57240/1‑149 (MQ=255) tgGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGc < 3:91392/149‑1 (MQ=255) gcagcaTCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGcc < 6:202611/98‑1 (MQ=255) gcagcaTCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGcc > 5:202611/1‑98 (MQ=255) cagcaTCACCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACTGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGCCTGCCGCTggg > 6:173762/1‑149 (MQ=255) caTCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGc < 5:194264/149‑1 (MQ=255) tCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTg < 5:249345/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACAACCCCGTTGATGATTCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCCGTGGACTGCCGCTGGGTGCTggg > 4:3263/1‑148 (MQ=255) cTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCGACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCa > 1:72709/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCAt > 4:294112/1‑149 (MQ=255) ggCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTg < 4:129204/149‑1 (MQ=255) tACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCt > 4:303906/1‑149 (MQ=255) aCCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTg < 3:252331/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCTACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTgg < 2:308042/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGc < 4:49537/149‑1 (MQ=255) gcAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGc > 3:251038/1‑149 (MQ=255) gcAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCAGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGc > 8:106914/1‑149 (MQ=255) | CAACGAGTGGTCCGAGCCGTTGCCGTTTTTCCAGTTGCGCTTATTGCAGCGGCGCAACTTGAGTTTCGCCCTGGTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGC > NC_002947/1452642‑1452928 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |