Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,524,049 | T→A | 6.7% | A251A (GCT→GCA) ‡ | murG → | UDP‑N‑acetylglucosamine‑‑N‑acetylmuramyl‑ (pentapeptide) pyrophosphoryl‑undecaprenol N‑acetylglucosamine transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,524,049 | 0 | T | A | 6.7% | 217.1 / 5.0 | 75 | A251A (GCT→GCA) ‡ | murG | UDP‑N‑acetylglucosamine‑‑N‑acetylmuramyl‑ (pentapeptide) pyrophosphoryl‑undecaprenol N‑acetylglucosamine transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/38); new base A (2/3); total (34/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.34e-01 |
CTAAGGCCCTGTCCGAGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAATATCTGGCCCGCGAA > NC_002947/1523901‑1524196 | cTAAGGCCCTGTCCGAGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCt > 7:116298/1‑149 (MQ=255) aGGCCCTGTCCGAGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGTTCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCtt < 4:164548/147‑1 (MQ=255) gCCCTGTCCGAGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATgg > 5:155340/1‑149 (MQ=255) ccTGTCCGAGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCt > 8:42986/1‑149 (MQ=255) gTCCGAGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGTCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTAGCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAATGAGATGGCCGAGGCTTATGGCTgg > 7:108411/1‑148 (MQ=255) gTCCGAGGTGACCGCGGCGCTGCTTGCAGAGGGTTTCCACGAGGCGGGCAAGGAGCACGCACCGATCACCGCCGATCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTgg < 8:108411/148‑1 (MQ=255) tCCGAGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTggg < 7:22742/148‑1 (MQ=255) tCCGAGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑c > 4:124775/1‑149 (MQ=255) cGAGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCGCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGCCATAAGCCTGGG‑cc < 8:285489/148‑1 (MQ=255) aGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGAc < 3:291003/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGCCTGGG‑CCGAc > 8:106755/1‑148 (MQ=255) gTGCCCGCTGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGTCCGGCAAGCATCACGCACCGATCACCGCCGAGCTTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCATGTAGAGCCTTTCATCAAATACATGGCCCAGCCATAAGCCTGGG‑ccatgtc < 4:218165/149‑6 (MQ=255) cccGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCtggt < 7:42986/149‑1 (MQ=255) cccGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCtgg < 3:124775/148‑1 (MQ=255) ccGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCtggtg < 1:137367/149‑1 (MQ=255) gcggcgCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTggtggt > 1:38383/1‑149 (MQ=255) cggcgCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGgtggtg > 7:26920/1‑149 (MQ=255) ggcgCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGgtgt < 6:310723/149‑1 (MQ=255) ggcgCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGgtgt < 7:216305/149‑1 (MQ=255) ggcgCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGgtgt < 2:218341/149‑1 (MQ=255) tGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTgccgg > 3:106159/1‑149 (MQ=255) gCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACACGGCCCAGCCATAAGCCTGGG‑ccat > 3:156618/1‑127 (MQ=255) gCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACACGGCCCAGCCATAAGCCTGGG‑ccat < 4:156618/129‑3 (MQ=255) ccAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTgccgggccgg > 7:187697/1‑149 (MQ=255) agagGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTg > 4:211475/1‑149 (MQ=255) agGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGcc > 2:248581/1‑149 (MQ=255) ggTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCt < 2:28888/149‑1 (MQ=255) ttCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTTGAGCCTTTCATCAATGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGAc < 7:106755/149‑1 (MQ=255) ttCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGa < 4:106159/148‑1 (MQ=255) ccaccaGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTg > 3:146110/1‑149 (MQ=255) ccaccaGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTg > 7:301628/1‑149 (MQ=255) ccaGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTct > 1:293890/1‑148 (MQ=255) gCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCAGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCg > 2:17536/1‑148 (MQ=255) cAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTgg < 4:146110/149‑1 (MQ=255) agcagcACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGgca < 8:26920/149‑1 (MQ=255) cacgcacCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGGCCCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGgcagcag < 1:248581/149‑1 (MQ=255) cacCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGgc < 5:328/149‑1 (MQ=255) cacCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGgc < 2:38383/149‑1 (MQ=255) ccGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCTGGTGCCTTGACTGTCAGCTAACTGGCAGCAGCAGgcct < 3:229890/149‑1 (MQ=255) agATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGgcctg > 2:27042/2‑149 (MQ=255) aCCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCtt < 8:301628/148‑1 (MQ=255) aCCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTc < 6:155340/149‑1 (MQ=255) aCCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGCCTCAGCTAGAGCCATTCATCAAAGACATGGCACAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCACCAGCAGGCCTGCCTTc > 1:44550/1‑149 (MQ=255) cgccgAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGa > 4:286245/1‑149 (MQ=255) cgccgAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGa < 5:263556/149‑1 (MQ=255) ccgAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATg > 1:123001/1‑149 (MQ=255) cGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGt > 3:176056/1‑149 (MQ=255) gAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGcc < 2:229708/149‑1 (MQ=255) ggcgggcgTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGccc > 1:189066/1‑148 (MQ=255) gggcgTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCAcg > 1:269807/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATc < 2:189066/149‑1 (MQ=255) tCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATc < 2:123001/149‑1 (MQ=255) cgGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCCGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATcgac < 5:305757/149‑1 (MQ=255) cgGCTCAGCTAGATCCTTTCATCAAAGACATGGCCCCGGCTTATGGCTTGG‑CCGACCTGGGGTGGGGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATcgac < 8:230624/149‑1 (MQ=255) cTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGGCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGAt < 3:275376/149‑1 (MQ=255) tCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGAt > 3:203699/1‑148 (MQ=255) tCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGAt > 7:216146/1‑148 (MQ=255) aGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATc < 6:9515/147‑1 (MQ=255) ggTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGNTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCAcc < 1:27042/149‑1 (MQ=255) ccTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGa < 1:145072/130‑1 (MQ=255) ccTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGa > 2:145072/1‑130 (MQ=255) ccTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATcga > 2:169035/1‑134 (MQ=255) ccTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATcga < 1:169035/134‑1 (MQ=255) ccTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTca < 8:216146/149‑1 (MQ=255) tttCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTcac > 6:246274/1‑148 (MQ=255) atcaAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTAGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGc < 6:240208/149‑1 (MQ=255) aaaGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGccc > 6:58808/1‑148 (MQ=255) gACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGACCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCGGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAata > 4:78760/1‑149 (MQ=255) gtcggCCCAGCCATAAGCCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCATGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAATATc > 8:194893/4‑149 (MQ=255) aTGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTTCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAATATCt < 8:116298/149‑1 (MQ=255) aTGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAatat > 4:225271/1‑147 (MQ=255) aTGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAATATCt < 8:187697/149‑1 (MQ=255) aTGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAATATCt > 5:250077/1‑149 (MQ=255) aTGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGACCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCGGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAATATCt < 3:78760/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAATATCTGGc < 3:211475/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAATATCTGGccc > 1:291840/1‑149 (MQ=255) cTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAATATCTGGCCCGCGaa < 3:225271/149‑1 (MQ=255) | CTAAGGCCCTGTCCGAGGTGCCCGCGGCGCTGCGGCCAGAGGTGTTCCACCAGGCCGGCAAGCAGCACGCACCGATCACCGCCGAGCGTTATCACGAGGCGGGCGTCGCGGCTCAGGTAGAGCCTTTCATCAAAGACATGGCCCAGGCTTATGGCTGGG‑CCGACCTGGTGGTGTGCCGGGCCGGTGCCTTGACTGTCAGCGAACTGGCAGCAGCAGGCCTGCCTTCGATGCTGGTGCCTTTGCCCCACGCGATCGACGATCACCAGACTCACAACGCCCAATATCTGGCCCGCGAA > NC_002947/1523901‑1524196 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |