Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,594,484 | A→C | 7.3% | R313R (CGT→CGG) | kgtP ← | alpha‑ketoglutarate permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,594,484 | 0 | A | C | 7.3% | 208.0 / 7.4 | 69 | R313R (CGT→CGG) | kgtP | alpha‑ketoglutarate permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/33); new base C (2/3); total (33/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.65e-01 |
CGGCGTTGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGGTGGTGT > NC_002947/1594336‑1594626 | cGGCGTTGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGa < 8:39996/149‑1 (MQ=255) gTTGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGAcggc > 8:165042/1‑149 (MQ=255) gATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACggcggc > 5:76621/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGcc > 6:254311/1‑149 (MQ=255) ggTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGAGCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAAGATCGGCCGCCGTCCGATcc < 7:248083/149‑2 (MQ=255) ataGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGt > 1:211493/1‑149 (MQ=255) taGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGt < 5:254311/148‑1 (MQ=255) taGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTc < 5:263935/149‑1 (MQ=255) taGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTc < 5:268379/149‑1 (MQ=255) taGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTc < 1:234767/149‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACTTGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCGGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCg < 1:271839/148‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCg > 8:74756/1‑148 (MQ=255) ccGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTc < 6:113914/146‑1 (MQ=255) ccGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTc > 5:113914/1‑146 (MQ=255) ccGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGa > 4:275034/1‑149 (MQ=255) gCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACa < 2:211493/149‑1 (MQ=255) gatgatCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGaccac > 7:211814/1‑149 (MQ=255) tgatCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCg < 3:275034/149‑1 (MQ=255) acAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGAAGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTAGt > 5:311510/2‑132 (MQ=255) cgaccATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCgg < 7:288828/145‑1 (MQ=255) cATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATc > 3:286364/1‑118 (MQ=255) cATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATc < 4:286364/118‑1 (MQ=255) aGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACAt < 6:76621/149‑1 (MQ=255) aGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACAt > 3:16295/1‑149 (MQ=255) gaagaaCGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACAt > 1:67388/1‑148 (MQ=255) agaaCGCACCCCACCATGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATgaac < 3:175100/149‑1 (MQ=255) gaaCGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATgaa > 4:241631/1‑147 (MQ=255) gaaCGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATgaa > 6:3377/1‑147 (MQ=255) aaCGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATgaacag < 7:74756/149‑1 (MQ=255) cGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATgaacagga < 7:165042/149‑1 (MQ=255) gCACCCCAGCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATgaacaggaa < 2:78410/149‑1 (MQ=255) cccACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGc < 4:237030/149‑1 (MQ=255) cccACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGc > 7:169019/1‑149 (MQ=255) cccACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTACAGGCACATGAACAGGAACAGc > 8:279737/1‑149 (MQ=255) caccaGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGt < 2:231080/149‑1 (MQ=255) accaGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCa > 2:165844/1‑126 (MQ=255) accaGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCa < 1:165844/126‑1 (MQ=255) accaGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTg > 2:152361/1‑149 (MQ=255) accaGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTg < 3:241631/149‑1 (MQ=255) accaGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTg > 2:157221/1‑149 (MQ=255) gATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGcc > 3:212277/1‑145 (MQ=255) gATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCga < 1:233414/147‑1 (MQ=255) tGGTGTGTAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAAGATCGGCCGCCGTCCGATCCTgat < 5:202156/88‑3 (MQ=37) tGGTGTGTAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAAGATCGGCCGCCGTCCGATCCTgat > 6:202156/1‑86 (MQ=37) tgtgCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGAtggtg < 5:3377/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTc > 2:123933/1‑148 (MQ=255) aGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGa < 1:157221/149‑1 (MQ=255) aGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGa < 1:152361/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGt < 1:123933/149‑1 (MQ=255) gTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGc < 2:129375/106‑1 (MQ=255) gTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGc > 1:129375/1‑106 (MQ=255) gCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCAc < 4:16295/149‑1 (MQ=255) gA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGa > 4:279390/1‑149 (MQ=255) tGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTc < 2:67388/149‑1 (MQ=255) ggTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTACAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCa < 7:279737/149‑1 (MQ=255) gTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCAc > 3:269195/1‑149 (MQ=255) gCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACg < 6:181598/134‑1 (MQ=255) gCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACg > 5:181598/1‑134 (MQ=255) cGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTg > 1:8932/1‑148 (MQ=255) cGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTg < 2:8932/148‑1 (MQ=255) cGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGc < 4:212277/149‑1 (MQ=255) ggCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGt < 8:169019/149‑1 (MQ=255) gCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATg > 1:25144/1‑147 (MQ=255) aTCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAggt > 2:1530/1‑149 (MQ=255) aTCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACAACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGAGCAGGTATTTCTGCATGTAggt > 3:81502/1‑149 (MQ=255) ggATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGgtggtg > 5:219066/1‑149 (MQ=255) gATCGGCCGCCGTCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGACTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTc < 3:270094/133‑1 (MQ=255) gATCGGCCGCCGTCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGACTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTc > 4:270094/1‑133 (MQ=255) gATCGGACGGCGGCGGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAAAAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGgtggtg > 6:270697/1‑148 (MQ=255) gATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGGTggtgt < 3:279390/149‑1 (MQ=255) | CGGCGTTGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGA‑GGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGGTGGTGT > NC_002947/1594336‑1594626 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |