Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,693,686 | C→G | 10.1% | P52R (CCT→CGT) ‡ | PP_1489 → | CheW domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,693,686 | 0 | C | G | 10.1% | 196.7 / 10.0 | 68 | P52R (CCT→CGT) ‡ | PP_1489 | CheW domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/29); new base G (3/4); total (35/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 |
TTGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGC > NC_002947/1693541‑1693831 | ttGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgc > 2:35878/1‑149 (MQ=255) ttGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgc > 8:241234/1‑149 (MQ=255) gCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgc < 8:169674/147‑1 (MQ=255) aaCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTgg > 1:246535/1‑149 (MQ=255) aCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAGGTGCCTggg < 5:169358/149‑1 (MQ=255) aCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTggg > 5:319239/1‑149 (MQ=255) cTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAGGTGCCTgggc < 8:78836/149‑2 (MQ=255) cTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGt > 1:65354/1‑149 (MQ=255) cTGCGCACCGCGCGGGCGGCGAACCCCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCATGCCGATCGCCCAGGCAGGTGCCTgggc < 7:203661/149‑2 (MQ=255) cACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCgg < 5:316189/149‑1 (MQ=255) cACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGGGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCgg < 7:162812/149‑1 (MQ=255) aCCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCggg > 2:240599/1‑149 (MQ=255) aCCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCggg < 8:105477/149‑1 (MQ=255) gggCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATtc < 3:270345/147‑1 (MQ=255) ggcgAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGcc > 2:20473/1‑148 (MQ=255) ccGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGc < 2:65354/149‑1 (MQ=255) cGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGAGCGAAGTGTTGCCGGGTCAGCCGATCAAGCCGAGCGCCCAGCCACCTCCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCTGCGTGGc > 4:53132/1‑148 (MQ=255) ttGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTcc < 8:155005/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCa < 1:240599/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCa > 6:183421/1‑149 (MQ=255) ccTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCa > 4:148722/1‑149 (MQ=255) cTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCAt > 2:29861/1‑149 (MQ=255) tGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATc > 5:23019/1‑149 (MQ=255) cAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATc < 3:148722/147‑1 (MQ=255) cGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTg < 6:319239/148‑1 (MQ=255) cATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTgccg > 6:283217/1‑149 (MQ=255) agagCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCtt < 7:241234/149‑1 (MQ=255) gagCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTg < 1:35878/149‑1 (MQ=255) gcAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATTGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCt > 2:113879/1‑149 (MQ=255) gcAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGGGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCt < 3:53132/149‑1 (MQ=255) cAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCtt > 3:317424/1‑149 (MQ=255) aGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCttt > 3:21807/1‑149 (MQ=255) gCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTg > 3:290286/1‑149 (MQ=255) cGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTgg < 4:21807/149‑1 (MQ=255) ccTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcgg > 6:243301/1‑149 (MQ=255) gTGCACGAGGTGATTGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCa < 1:113879/149‑1 (MQ=255) gCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAAc < 3:239935/149‑1 (MQ=255) gCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAAc > 3:120182/1‑149 (MQ=255) tcGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTg < 8:209022/142‑1 (MQ=255) aagAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTg > 7:209019/3‑143 (MQ=255) aCGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTg < 8:209019/143‑1 (MQ=255) aCGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCagctc > 7:209022/1‑145 (MQ=255) gTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCa < 6:23019/148‑1 (MQ=255) gTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAg > 3:233586/1‑149 (MQ=255) tCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCAcc < 5:283217/149‑1 (MQ=255) cGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCAccc > 3:240478/1‑149 (MQ=255) cGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCAAAAACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCAccc > 1:268089/1‑149 (MQ=255) aaGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGCTCGCGGCCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCCACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGc > 8:180974/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGTCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggt < 1:20473/149‑1 (MQ=255) tGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCAcc < 1:122654/140‑1 (MQ=255) tGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCAcc > 2:122654/1‑140 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctg < 4:120182/149‑1 (MQ=255) gcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctagtgctgg < 2:246535/149‑1 (MQ=255) ggcAGCCGGTCAAGCCGATGGCCCAGGCTCGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGTCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGGCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctggtg < 3:13375/147‑1 (MQ=255) gTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctggtg < 5:179832/149‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGCgggtgctggtgc < 5:183421/149‑1 (MQ=255) gCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCAc > 1:213678/1‑148 (MQ=255) ccGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAACTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTa > 3:269877/1‑149 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAgg > 6:714/1‑149 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAgg < 4:240478/149‑1 (MQ=255) gATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCa < 7:294448/113‑1 (MQ=255) gATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCa > 8:294448/1‑113 (MQ=255) gacccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTg > 1:287769/3‑148 (MQ=255) gacccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGc > 6:34501/3‑149 (MQ=255) gCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCGTCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTg > 1:55580/1‑147 (MQ=255) cccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAg > 5:87153/1‑149 (MQ=255) ccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGTCCTGCAGc < 4:290286/149‑1 (MQ=255) ccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGc > 7:306205/1‑149 (MQ=255) ccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGc > 5:114850/1‑149 (MQ=255) ccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGc > 7:175516/1‑149 (MQ=255) cACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGc < 6:114850/149‑1 (MQ=255) | TTGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGC > NC_002947/1693541‑1693831 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |