Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,215,345 | G→A | 6.4% | intergenic (+159/‑785) | PP_1957 → / → PP_5493 | Pdr/VanB family oxidoreductase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,215,345 | 0 | G | A | 6.4% | 184.5 / 2.2 | 64 | intergenic (+159/‑785) | PP_1957/PP_5493 | Pdr/VanB family oxidoreductase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/28); new base A (2/2); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.00e-01 |
GGGGCAGGGGGCCAGTCACTCTGATTATCCGCGACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCAGTCATGGACATCCACAGGCTTCCCT > NC_002947/2215198‑2215492 | ggggcaggggGCCAGTCACTCTGATTATCCGCGACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTg > 4:208913/1‑148 (MQ=255) gcaggggGCCAGTCACTCTGATTATCCGCGACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCAtt < 1:124108/149‑1 (MQ=255) gggCCAGTCACTCTTATTATCCGCGACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGa < 5:198134/149‑1 (MQ=255) gCCAGTCACTCTGATTATCCGCGACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGc > 4:72392/1‑149 (MQ=255) ccAGTCACTCTGATTATCCGCGACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCg > 1:119764/1‑149 (MQ=255) tctGATTATCCGCGACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGaa > 2:51597/1‑149 (MQ=255) tctGATTATCCGCGACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGaa > 5:280025/1‑149 (MQ=255) tGATTATCCGCGACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAAcc > 7:144416/1‑149 (MQ=255) tATCCGCGACCAGAGCCTACTCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGc < 6:275819/148‑1 (MQ=255) gACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTACATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCgg > 6:145817/1‑148 (MQ=255) ccAGAGCCAACGCTGTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGGGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAAt < 8:254643/149‑1 (MQ=255) cAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCTTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAAt > 8:248403/1‑148 (MQ=255) cAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAAt > 1:208371/1‑148 (MQ=255) cAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAAt > 2:236185/1‑148 (MQ=255) agagCCAACGGTTTGCTTGCGAGGTCCTTAAGGATTGGTGCAGGGATGCGCTGTAGTGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCGTCTGCGTTGCTTTGCGGAGCCGCCTAGAACCCTCTGTGCGGaaag > 8:122317/1‑146 (MQ=255) ccAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAAccc < 1:236185/149‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCTTTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAg > 1:103458/1‑149 (MQ=255) aCGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGc < 3:72392/149‑1 (MQ=255) tttGGTTGCGAGGTACTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTCCGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGCACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGt > 4:97790/1‑149 (MQ=255) gTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCgg < 2:103458/148‑1 (MQ=255) gTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCg > 7:131267/1‑147 (MQ=255) ttGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAg < 4:122683/149‑1 (MQ=255) ttGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAg > 6:217267/1‑149 (MQ=255) cGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAgggg > 5:195519/1‑149 (MQ=255) gAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGc < 6:195519/149‑1 (MQ=255) gAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGc < 3:188498/149‑1 (MQ=255) gAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGc > 1:202832/1‑149 (MQ=255) gTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCTCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCt < 8:260684/148‑1 (MQ=255) tCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTg < 5:217267/149‑1 (MQ=255) ttAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCGGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCAAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGaa > 1:263901/1‑149 (MQ=255) ttAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCTAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGaa > 6:232239/1‑149 (MQ=255) aaGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGaa < 2:119764/147‑1 (MQ=255) aaGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAAt < 8:131267/148‑1 (MQ=255) aGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATc < 2:202832/148‑1 (MQ=255) aGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCa < 7:36857/149‑1 (MQ=255) gCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCaa < 3:208913/149‑1 (MQ=255) cATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAAt > 3:299631/1‑149 (MQ=255) aTTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAAtt < 6:280025/149‑1 (MQ=255) ggTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGc > 5:289342/1‑148 (MQ=255) cACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGt < 4:299631/148‑1 (MQ=255) cACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGt < 2:208371/148‑1 (MQ=255) aCGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTg > 8:15845/1‑148 (MQ=255) gcTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACACGCTTTGCGCAATGAACCCAGCGGGTCGTAGGGGCCTTGGAATCAATTGCTAGTGCACTGATTc > 3:264832/1‑149 (MQ=255) tAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATc > 2:112790/1‑125 (MQ=255) tAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGt < 8:242628/148‑1 (MQ=255) tAGTGAGTTCAGCAATCGCTAACCATTCATGACTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGAGGAGCGGACTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGAACTGATTCTGTCGATAgt > 4:13763/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAAc < 8:144416/149‑1 (MQ=255) ttCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAAc > 5:143905/1‑148 (MQ=255) gCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCg > 3:10912/1‑87 (MQ=255) gCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCg < 4:10912/87‑1 (MQ=255) cTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTACATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAAcc < 6:299434/142‑1 (MQ=255) cTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTACATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAAcc > 5:299434/1‑142 (MQ=255) gCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCtt < 1:159456/96‑1 (MQ=255) gCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCtt > 2:159456/1‑96 (MQ=255) gCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAaca > 1:154552/1‑149 (MQ=255) gCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAaca < 7:248403/149‑1 (MQ=255) aCCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACgg > 7:188393/1‑148 (MQ=255) cATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCa < 1:51597/148‑1 (MQ=255) ccTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCAGTCAt < 8:188393/149‑1 (MQ=255) aCGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCAGTCATGGa > 2:245792/1‑149 (MQ=255) cGAGTGTCCTCTGCCTTTCATTGCGTAGCGGCCTAGAACCGTCTTTGCGTAATGAACCCAGCGGGTCGGATGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCTATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCAGTCATgg < 3:13763/147‑1 (MQ=255) ctgtGCCTTACATTGCGGAGCGGCCTAGAACGCGCTTTGAGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGTGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTTTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCAGTCATGGACATCcaca < 5:145817/145‑1 (MQ=255) tctGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCAGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCAGTAATGGACATCCACAgg > 5:195152/1‑149 (MQ=255) ccTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCAGTCATGGACATCCACAGGCtt < 6:289342/148‑1 (MQ=255) tGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCAGTCATGGACATCCACAGGCTTCCCt > 7:149224/1‑149 (MQ=255) gCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCAGTCATGGACATCCACAGGCTTCCCt > 1:264268/1‑148 (MQ=255) | GGGGCAGGGGGCCAGTCACTCTGATTATCCGCGACCAGAGCCAACGCTTTGGTTGCGAGGTCCTTAAGCATTGGTGCACGGATGCGCTGTAGGGGTAGTGAGTTCAGCACTCGCTAACCATTCATGCCTACGAGTGTCCTCTGCCTTGCATTGCGGAGCGGCCTAGAACCCGCTTTGCGGAATGAACCCAGCGGGTCGGAGGGGCCTTGGAATCAATTGCGAGTGCACTGATTCTGTCGATAGTGTTAACCACGTCAAACACGGCACTCAGTCATGGACATCCACAGGCTTCCCT > NC_002947/2215198‑2215492 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |