| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,396,271 | A→T | 5.6% | M1129K (ATG→AAG) | PP_2100 ← | two‑component system sensor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,396,271 | 0 | A | T | 5.6% | 214.1 / 2.4 | 72 | M1129K (ATG→AAG) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/34); new base T (2/2); total (35/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.71e-01 | |||||||||||
CGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGC > NC_002947/2396127‑2396418 | cgcACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAg > 2:201869/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGAGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCt < 1:85148/149‑1 (MQ=255) ggCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGc < 4:120498/149‑1 (MQ=255) gCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGcc < 3:174120/149‑1 (MQ=255) aGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGa < 1:201869/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTg > 4:206899/1‑147 (MQ=255) tCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAg < 6:222563/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGc < 8:45655/149‑1 (MQ=255) gCCGCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTTCAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATGGcgc < 6:73412/147‑3 (MQ=255) ccTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTgg < 6:261329/149‑1 (MQ=255) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCTTCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCAACTTGTGG‑GCCTGCTCGGCTATGGCGCGGCTGTCGTTTTGCGGGTGAAGCGCCATCTGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt < 1:192691/149‑1 (MQ=255) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGc > 6:145847/1‑135 (MQ=255) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGc < 5:145847/135‑1 (MQ=255) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt > 1:323383/1‑149 (MQ=255) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt > 3:274631/1‑149 (MQ=255) tCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTg > 5:141887/1‑149 (MQ=255) cTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGtt < 4:64826/149‑1 (MQ=255) ttCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGttt > 2:320311/1‑149 (MQ=255) ttCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGttt > 6:125661/1‑149 (MQ=255) acaGGCCGCCATCAGGTCCGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCa < 4:243189/149‑1 (MQ=255) acaGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt < 2:51104/137‑1 (MQ=255) acaGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTcc < 5:125661/148‑1 (MQ=255) aGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAg > 2:28484/1‑115 (MQ=255) aGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAg > 1:153518/1‑148 (MQ=255) gccgccATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTTCAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATgg < 2:308826/126‑1 (MQ=255) gccgccATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTTCAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATgg > 1:308826/1‑126 (MQ=255) cgccATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAgc > 1:213178/1‑149 (MQ=255) cATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCt < 6:218978/149‑1 (MQ=255) cATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCt > 1:190865/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCt > 1:41188/1‑148 (MQ=255) tcaggtcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGa < 5:118747/149‑1 (MQ=255) ggggCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAAc < 1:320311/149‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCgg > 8:114650/1‑149 (MQ=255) cTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCggg > 5:324527/1‑149 (MQ=255) cgcgcgGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGa < 4:224222/148‑1 (MQ=255) cTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCAcggcg < 8:227619/139‑1 (MQ=255) cTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCAcggcg > 7:227619/1‑139 (MQ=255) cTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGt > 4:114714/1‑149 (MQ=255) cTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGt > 6:324329/1‑149 (MQ=255) cTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGt > 2:85624/1‑149 (MQ=255) ttGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGTGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTc > 8:225153/1‑149 (MQ=255) gtgG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTc < 2:213178/147‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCGTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCg < 8:225055/140‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCGTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCg > 7:225055/1‑140 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg < 2:190865/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg < 4:49867/149‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg > 3:152081/1‑148 (MQ=255) ggCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCt > 1:58580/1‑149 (MQ=255) ggCAATGGCGCCGCTGTCGTGTGGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAg < 8:131037/147‑1 (MQ=255) gCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCtt < 6:141887/149‑1 (MQ=255) aaTGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGc > 8:184741/1‑149 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAg < 4:117894/101‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAg > 3:117894/1‑101 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCggg < 7:114650/149‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCggg > 3:142013/1‑149 (MQ=255) ccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCgggg < 7:184741/149‑1 (MQ=255) tCGTGTTGGGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCGTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGTAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCCCGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTGGCGTCGGGGGCGTTg > 4:6290/1‑149 (MQ=255) tCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTg > 3:84674/1‑149 (MQ=255) tCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTg < 5:325055/149‑1 (MQ=255) gtgtTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGc < 4:142013/148‑1 (MQ=255) cGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTggcgg < 4:274631/148‑1 (MQ=255) ccagagcCTTCAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCggg > 7:285543/6‑149 (MQ=38) aaGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGc < 6:205980/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGc < 2:58580/149‑1 (MQ=255) gcgcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCg > 4:62529/1‑148 (MQ=255) gcgcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCg > 5:156691/1‑148 (MQ=255) gcgcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAAACGGGTCAGGCCAGACCACGGCGGACAGGCCGTCCAGCTGGTACAGGTTGGGTGGGGGGGGTTGGTGggggggggggggt > 2:128258/1‑146 (MQ=255) gcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACGGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCGGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt < 3:6290/149‑1 (MQ=255) gcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt < 6:119116/149‑1 (MQ=255) gcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt < 5:324329/149‑1 (MQ=255) gcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt > 3:273975/1‑149 (MQ=255) cATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCCCGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgc > 5:321987/1‑149 (MQ=255) aTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgc > 5:205444/1‑148 (MQ=255) aTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCAAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTgg < 3:39611/132‑1 (MQ=255) aTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCAAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTgg > 4:39611/1‑132 (MQ=255) | CGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGG‑GCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGC > NC_002947/2396127‑2396418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |